More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1401 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4694  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  88.2 
 
 		 551 aa  1013    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2371  sulphite reductase hemoprotein, beta subunit  56.02 
 
 		 550 aa  638    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1013  sulfite reductase, ferredoxin subunit  55.86 
 
 		 559 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  58.39 
 
 		 548 aa  668    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0181  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  60.36 
 
 		 556 aa  687    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1638  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  61.09 
 
 		 556 aa  691    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123155  normal  0.260957 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2730  sulphite reductase  56.55 
 
 		 552 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1884  sulfite reductase (ferredoxin)  55.84 
 
 		 550 aa  638    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0663  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  55.68 
 
 		 559 aa  638    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.6828  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0798  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  57.79 
 
 		 560 aa  655    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2462  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  57.45 
 
 		 552 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133864  hitchhiker  0.0089814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3457  sulfite reductase  56.73 
 
 		 552 aa  643    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.998056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1006  sulfite reductase, ferredoxin subunit  55.68 
 
 		 559 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6980  sulfite/ferredoxin-nitrite reductase  83.67 
 
 		 551 aa  964    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2696  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  57.87 
 
 		 560 aa  651    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3940  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  56.7 
 
 		 568 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0338  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  55.94 
 
 		 556 aa  636    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0988225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2148  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  58.74 
 
 		 557 aa  673    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.249832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1166  sulfite reductase  55.86 
 
 		 589 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.878601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2937  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  55.68 
 
 		 559 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655156  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3112  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  55.54 
 
 		 552 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1942  sulfite/nitrite reductase hemoprotein subunit  56.31 
 
 		 556 aa  638    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5806  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  55.86 
 
 		 559 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0593  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  56.49 
 
 		 556 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1397  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  70.11 
 
 		 551 aa  804    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0962  sulfite or nitrite reductase  59.39 
 
 		 557 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2147  sulfite reductase (ferredoxin)  56.18 
 
 		 552 aa  643    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0201969  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0819  ferredoxin--nitrite reductase  56.22 
 
 		 559 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2392  sulfite reductase (ferredoxin)  56.4 
 
 		 559 aa  643    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0190  sulfite reductase (ferredoxin)  59.64 
 
 		 556 aa  695    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3267  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  58.36 
 
 		 552 aa  664    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1978  sulfite reductase (ferredoxin)  55.84 
 
 		 550 aa  636    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126005  normal  0.0650245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0889  sulfite reductase (ferredoxin)  61.41 
 
 		 552 aa  712    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2261  sulfite reductase (ferredoxin)  61.16 
 
 		 553 aa  681    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1931  ferredoxin--nitrite reductase  56.5 
 
 		 556 aa  639    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0970  Ferredoxin--nitrite reductase  55.32 
 
 		 559 aa  641    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3124  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  59.27 
 
 		 564 aa  653    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1401  sulfite reductase, hemoprotein subunit  100 
 
 		 550 aa  1130    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0403368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2558  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  56.02 
 
 		 544 aa  636    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4013  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  85.3 
 
 		 550 aa  985    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3664  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  55.5 
 
 		 559 aa  646    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1825  Sulfite reductase (ferredoxin)  60.8 
 
 		 556 aa  684    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.291186  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1381  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  91.11 
 
 		 551 aa  1033    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.244986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2348  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  55.68 
 
 		 559 aa  638    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2816  sulfite reductase (NADPH) subunit beta  56.6 
 
 		 560 aa  643    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2235  sulfite reductase (ferredoxin)  55.68 
 
 		 559 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2480  sulfite reductase (ferredoxin)  56.76 
 
 		 559 aa  645    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0770  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like protein  57.3 
 
 		 543 aa  652    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1864  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  56.76 
 
 		 559 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0175  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  60.36 
 
 		 556 aa  686    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3991  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  59.17 
 
 		 556 aa  661    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661802  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3324  sulfite reductase (ferredoxin)  56.02 
 
 		 550 aa  637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1662  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  55.68 
 
 		 559 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2524  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  56.4 
 
 		 559 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10550  putative sulfite or nitrite reductas  59.57 
 
 		 557 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40770  sulfite reductase  56.91 
 
 		 552 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1101  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  60.36 
 
 		 557 aa  680    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251663 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2475  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  56.76 
 
 		 559 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.187728  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2425  sulfite reductase oxidoreductase protein  56.26 
 
 		 553 aa  632  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0814  sulfite reductase  55.14 
 
 		 589 aa  633  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1671  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  53.99 
 
 		 558 aa  632  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0706341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1153  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  56.31 
 
 		 555 aa  632  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4058  sulfite reductase (ferredoxin)  55.11 
 
 		 544 aa  631  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.639199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1758  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  54.3 
 
 		 555 aa  629  1e-179  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2513  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  55.27 
 
 		 557 aa  625  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67153  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2229  Sulfite reductase (ferredoxin)  55.54 
 
 		 553 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3156  sulfite reductase (ferredoxin)  55.15 
 
 		 552 aa  626  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2689  Sulfite reductase (ferredoxin)  55.54 
 
 		 553 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.671477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  56.2 
 
 		 545 aa  626  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2912  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  54.91 
 
 		 557 aa  624  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.198106 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1528  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  53.62 
 
 		 550 aa  618  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.245681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27520  Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  56.36 
 
 		 552 aa  612  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2345  sulfite reductase (ferredoxin)  53.18 
 
 		 553 aa  611  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1862  sulfite reductase oxidoreductase protein  56.43 
 
 		 577 aa  609  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.816955  normal  0.207611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3274  sulfite reductase (ferredoxin)  54.76 
 
 		 669 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1891  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  52.45 
 
 		 550 aa  598  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1773  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  54.48 
 
 		 553 aa  595  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.155846  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  53.83 
 
 		 570 aa  588  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0655  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  52.05 
 
 		 551 aa  582  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2013  sulphite reductase  52.54 
 
 		 554 aa  581  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4515  Sulfite reductase (ferredoxin)  50.68 
 
 		 596 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1264  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  52.63 
 
 		 551 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.657041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1110  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  50.09 
 
 		 560 aa  569  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5829  sulfite reductase (ferredoxin)  50.17 
 
 		 596 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.635326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2427  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  49.15 
 
 		 602 aa  568  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2339  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  49.5 
 
 		 608 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1068  putative sulfite reductase, beta subunit  49.38 
 
 		 561 aa  560  1e-158  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0922  putative nitrite/sulfite reductase  49.83 
 
 		 595 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1394  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  50.09 
 
 		 561 aa  560  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1503  putative nitrite/sulfite reductase  51.5 
 
 		 569 aa  557  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0107318  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4652  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  49.08 
 
 		 629 aa  554  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  hitchhiker  0.00315368 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2784  sulfite reductase (ferredoxin)  52.17 
 
 		 568 aa  549  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163848 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4335  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  50.26 
 
 		 593 aa  549  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1354  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component  49.74 
 
 		 594 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.249924 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3053  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  48.52 
 
 		 616 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304429  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4393  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  50.17 
 
 		 594 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196691  normal  0.0835923 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5807  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  49.24 
 
 		 594 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2408  Sulfite reductase (ferredoxin)  49.05 
 
 		 592 aa  542  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351922  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2456  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S protein  47.58 
 
 		 605 aa  543  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3929  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  50.17 
 
 		 594 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>