More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1110 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3457  sulfite reductase  61.43 
 
 
552 aa  707    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.998056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1662  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  56.28 
 
 
559 aa  651    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2371  sulphite reductase hemoprotein, beta subunit  59.11 
 
 
550 aa  675    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  59.82 
 
 
548 aa  690    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0819  ferredoxin--nitrite reductase  56.64 
 
 
559 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2730  sulphite reductase  57.4 
 
 
552 aa  673    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759699  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0663  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  56.28 
 
 
559 aa  651    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.6828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2462  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  57.58 
 
 
552 aa  671    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133864  hitchhiker  0.0089814 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1068  putative sulfite reductase, beta subunit  76.65 
 
 
561 aa  914    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2912  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  56.35 
 
 
557 aa  662    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.198106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2696  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  56.23 
 
 
560 aa  651    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1978  sulfite reductase (ferredoxin)  58.93 
 
 
550 aa  674    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126005  normal  0.0650245 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2345  sulfite reductase (ferredoxin)  61.5 
 
 
553 aa  713    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0166972 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2392  sulfite reductase (ferredoxin)  55.58 
 
 
559 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1166  sulfite reductase  56.28 
 
 
589 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.878601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2513  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  55.26 
 
 
557 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67153  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3112  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  58.29 
 
 
552 aa  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1013  sulfite reductase, ferredoxin subunit  56.28 
 
 
559 aa  658    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5806  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  56.46 
 
 
559 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0970  Ferredoxin--nitrite reductase  55.93 
 
 
559 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3324  sulfite reductase (ferredoxin)  59.11 
 
 
550 aa  674    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2348  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  56.28 
 
 
559 aa  651    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1528  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  58.82 
 
 
550 aa  674    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.245681  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0814  sulfite reductase  56.46 
 
 
589 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0798  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  57.65 
 
 
560 aa  664    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2013  sulphite reductase  60.61 
 
 
554 aa  679    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160364  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1671  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  59.64 
 
 
558 aa  694    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0706341  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3664  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  55.75 
 
 
559 aa  646    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1891  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  58.19 
 
 
550 aa  668    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1394  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  77.01 
 
 
561 aa  923    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2816  sulfite reductase (NADPH) subunit beta  55.69 
 
 
560 aa  646    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1884  sulfite reductase (ferredoxin)  58.75 
 
 
550 aa  676    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2235  sulfite reductase (ferredoxin)  55.22 
 
 
559 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1864  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  55.93 
 
 
559 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2147  sulfite reductase (ferredoxin)  60.39 
 
 
552 aa  692    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0201969  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27520  Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  59.89 
 
 
552 aa  670    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2937  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  56.28 
 
 
559 aa  651    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655156  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2524  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  55.93 
 
 
559 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40770  sulfite reductase  61.07 
 
 
552 aa  705    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74513  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2475  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  55.93 
 
 
559 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.187728  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1110  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  100 
 
 
560 aa  1167    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2480  sulfite reductase (ferredoxin)  55.93 
 
 
559 aa  645    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1006  sulfite reductase, ferredoxin subunit  56.28 
 
 
559 aa  651    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3940  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  56.03 
 
 
568 aa  634  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2425  sulfite reductase oxidoreductase protein  54.01 
 
 
553 aa  624  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2229  Sulfite reductase (ferredoxin)  53.65 
 
 
553 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2689  Sulfite reductase (ferredoxin)  53.3 
 
 
553 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.671477  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0962  sulfite or nitrite reductase  53.91 
 
 
557 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10550  putative sulfite or nitrite reductas  53.91 
 
 
557 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0889  sulfite reductase (ferredoxin)  53.82 
 
 
552 aa  614  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0812727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1862  sulfite reductase oxidoreductase protein  53.93 
 
 
577 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.816955  normal  0.207611 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  52.52 
 
 
570 aa  604  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1397  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  52.23 
 
 
551 aa  600  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1264  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  52.47 
 
 
551 aa  599  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.657041  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1638  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  53.48 
 
 
556 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123155  normal  0.260957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1825  Sulfite reductase (ferredoxin)  53.12 
 
 
556 aa  595  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.291186  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_004310  BR0181  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  52.13 
 
 
556 aa  591  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0175  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  52.13 
 
 
556 aa  590  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1503  putative nitrite/sulfite reductase  53.42 
 
 
569 aa  590  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0107318  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0190  sulfite reductase (ferredoxin)  51.33 
 
 
556 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2148  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  52.13 
 
 
557 aa  585  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.249832  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1101  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  51.68 
 
 
557 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.251663 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3991  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  52.82 
 
 
556 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661802  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2558  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  52.49 
 
 
544 aa  580  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2261  sulfite reductase (ferredoxin)  51.86 
 
 
553 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533982  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  51.34 
 
 
545 aa  575  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4694  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  50.27 
 
 
551 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1931  ferredoxin--nitrite reductase  49.91 
 
 
556 aa  570  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2784  sulfite reductase (ferredoxin)  52.84 
 
 
568 aa  571  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1401  sulfite reductase, hemoprotein subunit  50.09 
 
 
550 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0403368  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1381  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  49.73 
 
 
551 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.244986  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6980  sulfite/ferredoxin-nitrite reductase  50.36 
 
 
551 aa  568  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4013  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  50.09 
 
 
550 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3156  sulfite reductase (ferredoxin)  48.49 
 
 
552 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240199  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3267  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  51.33 
 
 
552 aa  560  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4058  sulfite reductase (ferredoxin)  49.38 
 
 
544 aa  558  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.639199  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4515  Sulfite reductase (ferredoxin)  48.05 
 
 
596 aa  557  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4652  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  47.83 
 
 
629 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  hitchhiker  0.00315368 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0770  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like protein  50.18 
 
 
543 aa  550  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259227  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3929  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  48.14 
 
 
594 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4393  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  47.9 
 
 
594 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196691  normal  0.0835923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4335  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  48.73 
 
 
593 aa  545  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321125  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5807  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  46.52 
 
 
594 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5829  sulfite reductase (ferredoxin)  46.54 
 
 
596 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.635326 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3124  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  49.38 
 
 
564 aa  546  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2456  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S protein  48.47 
 
 
605 aa  546  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2408  Sulfite reductase (ferredoxin)  48.99 
 
 
592 aa  541  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351922  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1354  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component  47.28 
 
 
594 aa  544  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2427  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  47.75 
 
 
602 aa  543  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2339  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  47.26 
 
 
608 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3053  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  47.22 
 
 
616 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304429  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1568  nitrite/sulfite reductase family protein  45.51 
 
 
729 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0338  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  48.22 
 
 
556 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0988225  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1466  sulfite reductase, beta subunit  45.51 
 
 
633 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0525  nitrite/sulfite reductase family protein  45.35 
 
 
633 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3052  nitrite/sulfite reductase family protein  45.35 
 
 
605 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1241  nitrite/sulfite reductase family protein  45.35 
 
 
633 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0628  nitrite/sulfite reductase family protein  45.35 
 
 
633 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1435  sulfite reductase, beta subunit  45.35 
 
 
633 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0922  putative nitrite/sulfite reductase  46.81 
 
 
595 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.465808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>