More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1862 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2937  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  60.82 
 
 		 559 aa  684    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655156  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2371  sulphite reductase hemoprotein, beta subunit  62.25 
 
 		 550 aa  719    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  59.21 
 
 		 548 aa  669    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1862  sulfite reductase oxidoreductase protein  100 
 
 		 577 aa  1179    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.816955  normal  0.207611 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2425  sulfite reductase oxidoreductase protein  62.5 
 
 		 553 aa  706    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2348  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  60.82 
 
 		 559 aa  684    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2730  sulphite reductase  62.43 
 
 		 552 aa  736    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759699  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2689  Sulfite reductase (ferredoxin)  61.99 
 
 		 553 aa  699    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.671477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1978  sulfite reductase (ferredoxin)  61.72 
 
 		 550 aa  712    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126005  normal  0.0650245 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0663  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  60.82 
 
 		 559 aa  684    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.6828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2462  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  62.25 
 
 		 552 aa  732    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133864  hitchhiker  0.0089814 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2912  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  60.57 
 
 		 557 aa  705    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.198106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3457  sulfite reductase  62.86 
 
 		 552 aa  730    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.998056  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2696  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  60.5 
 
 		 560 aa  689    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3940  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  79.41 
 
 		 568 aa  936    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1013  sulfite reductase, ferredoxin subunit  61.36 
 
 		 559 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0970  Ferredoxin--nitrite reductase  60.18 
 
 		 559 aa  687    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2147  sulfite reductase (ferredoxin)  62.5 
 
 		 552 aa  723    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0201969  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1166  sulfite reductase  61.36 
 
 		 589 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.878601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2513  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  59.04 
 
 		 557 aa  679    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67153  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3112  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  62.97 
 
 		 552 aa  737    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1662  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  60.82 
 
 		 559 aa  684    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5806  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  61.36 
 
 		 559 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0962  sulfite or nitrite reductase  60.68 
 
 		 557 aa  673    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0889  sulfite reductase (ferredoxin)  56.56 
 
 		 552 aa  645    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812727 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2235  sulfite reductase (ferredoxin)  60.47 
 
 		 559 aa  689    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0814  sulfite reductase  60.82 
 
 		 589 aa  682    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1401  sulfite reductase, hemoprotein subunit  56.43 
 
 		 550 aa  636    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0403368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27520  Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  63.23 
 
 		 552 aa  696    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2013  sulphite reductase  57.45 
 
 		 554 aa  661    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1671  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  63.37 
 
 		 558 aa  756    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0706341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3664  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  60.36 
 
 		 559 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1891  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  57.96 
 
 		 550 aa  671    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2816  sulfite reductase (NADPH) subunit beta  58.9 
 
 		 560 aa  684    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1006  sulfite reductase, ferredoxin subunit  60.82 
 
 		 559 aa  684    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0798  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  59.47 
 
 		 560 aa  694    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1864  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  61.36 
 
 		 559 aa  688    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  58.35 
 
 		 570 aa  651    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1884  sulfite reductase (ferredoxin)  61.9 
 
 		 550 aa  713    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3324  sulfite reductase (ferredoxin)  62.25 
 
 		 550 aa  718    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2524  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  61.36 
 
 		 559 aa  687    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2229  Sulfite reductase (ferredoxin)  61.63 
 
 		 553 aa  695    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10550  putative sulfite or nitrite reductas  60.14 
 
 		 557 aa  664    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40770  sulfite reductase  63.39 
 
 		 552 aa  734    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2475  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  61.36 
 
 		 559 aa  688    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.187728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2345  sulfite reductase (ferredoxin)  59.86 
 
 		 553 aa  694    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166972 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2392  sulfite reductase (ferredoxin)  61.25 
 
 		 559 aa  687    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0819  ferredoxin--nitrite reductase  62.08 
 
 		 559 aa  699    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2480  sulfite reductase (ferredoxin)  61.36 
 
 		 559 aa  688    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1528  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  58.21 
 
 		 550 aa  673    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.245681  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1381  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  56.17 
 
 		 551 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.244986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1397  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  54.56 
 
 		 551 aa  629  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0190  sulfite reductase (ferredoxin)  55.3 
 
 		 556 aa  625  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4013  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  55.1 
 
 		 550 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1394  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  53.78 
 
 		 561 aa  626  1e-178  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0181  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  55.65 
 
 		 556 aa  623  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6980  sulfite/ferredoxin-nitrite reductase  54.03 
 
 		 551 aa  624  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1110  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  53.93 
 
 		 560 aa  623  1e-177  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1101  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  55.36 
 
 		 557 aa  622  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251663 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1068  putative sulfite reductase, beta subunit  54.2 
 
 		 561 aa  620  1e-176  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0175  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  55.48 
 
 		 556 aa  620  1e-176  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1503  putative nitrite/sulfite reductase  55.44 
 
 		 569 aa  619  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0107318  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0770  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like protein  55.91 
 
 		 543 aa  620  1e-176  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4694  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  55.46 
 
 		 551 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1825  Sulfite reductase (ferredoxin)  56.36 
 
 		 556 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.291186  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3124  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  57.17 
 
 		 564 aa  615  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2784  sulfite reductase (ferredoxin)  56.71 
 
 		 568 aa  611  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163848 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4335  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  54.97 
 
 		 593 aa  614  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1638  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  56.17 
 
 		 556 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123155  normal  0.260957 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2558  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  54.56 
 
 		 544 aa  608  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1153  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  56.05 
 
 		 555 aa  607  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2148  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  54.32 
 
 		 557 aa  605  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.249832  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3991  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  53.71 
 
 		 556 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661802  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1264  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  53.38 
 
 		 551 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.657041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4652  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  52.83 
 
 		 629 aa  597  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  hitchhiker  0.00315368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2456  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S protein  54 
 
 		 605 aa  595  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2427  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  51.22 
 
 		 602 aa  595  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2261  sulfite reductase (ferredoxin)  54.64 
 
 		 553 aa  593  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0593  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  54.98 
 
 		 556 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1942  sulfite/nitrite reductase hemoprotein subunit  55.16 
 
 		 556 aa  591  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1931  ferredoxin--nitrite reductase  53.71 
 
 		 556 aa  591  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2339  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  51.76 
 
 		 608 aa  591  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3053  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  51.76 
 
 		 616 aa  588  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304429  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3267  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  52.85 
 
 		 552 aa  585  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3156  sulfite reductase (ferredoxin)  51.16 
 
 		 552 aa  588  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0338  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  54.61 
 
 		 556 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0988225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  55.16 
 
 		 545 aa  586  1e-166  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1568  nitrite/sulfite reductase family protein  51.23 
 
 		 729 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4515  Sulfite reductase (ferredoxin)  51.85 
 
 		 596 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0628  nitrite/sulfite reductase family protein  51.06 
 
 		 633 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1466  sulfite reductase, beta subunit  51.23 
 
 		 633 aa  581  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3052  nitrite/sulfite reductase family protein  51.06 
 
 		 605 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1241  nitrite/sulfite reductase family protein  51.06 
 
 		 633 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1758  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  52.22 
 
 		 555 aa  579  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0525  nitrite/sulfite reductase family protein  51.06 
 
 		 633 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1435  sulfite reductase, beta subunit  51.06 
 
 		 633 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3274  sulfite reductase (ferredoxin)  51.89 
 
 		 669 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1354  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component  51.43 
 
 		 594 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.249924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4058  sulfite reductase (ferredoxin)  52.24 
 
 		 544 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.639199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5807  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  51.95 
 
 		 594 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>