More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1101 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4694  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  60.87 
 
 
551 aa  682    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0181  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  76.36 
 
 
556 aa  883    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2730  sulphite reductase  53.8 
 
 
552 aa  641    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759699  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3267  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  60 
 
 
552 aa  689    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1397  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  60.91 
 
 
551 aa  696    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1153  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  62.45 
 
 
555 aa  698    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2462  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  54.17 
 
 
552 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133864  hitchhiker  0.0089814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0962  sulfite or nitrite reductase  58.02 
 
 
557 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6980  sulfite/ferredoxin-nitrite reductase  58.77 
 
 
551 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1101  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  100 
 
 
557 aa  1152    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.251663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1638  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  88.55 
 
 
556 aa  1024    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123155  normal  0.260957 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1942  sulfite/nitrite reductase hemoprotein subunit  61.32 
 
 
556 aa  692    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0190  sulfite reductase (ferredoxin)  76.8 
 
 
556 aa  899    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3274  sulfite reductase (ferredoxin)  58.58 
 
 
669 aa  662    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0593  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  61.14 
 
 
556 aa  691    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313736  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4058  sulfite reductase (ferredoxin)  59.45 
 
 
544 aa  686    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.639199  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1931  ferredoxin--nitrite reductase  58.74 
 
 
556 aa  681    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0889  sulfite reductase (ferredoxin)  65.15 
 
 
552 aa  756    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0812727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1401  sulfite reductase, hemoprotein subunit  60.36 
 
 
550 aa  680    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0403368  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0175  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  75.82 
 
 
556 aa  875    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2558  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  62.18 
 
 
544 aa  716    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1773  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  60.47 
 
 
553 aa  660    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.155846  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4013  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  59.6 
 
 
550 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1825  Sulfite reductase (ferredoxin)  87.77 
 
 
556 aa  1026    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.291186  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1381  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  60.04 
 
 
551 aa  679    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.244986  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2235  sulfite reductase (ferredoxin)  54.29 
 
 
559 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2261  sulfite reductase (ferredoxin)  68.73 
 
 
553 aa  789    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533982  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1758  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  58.29 
 
 
555 aa  655    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0770  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like protein  62.98 
 
 
543 aa  724    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259227  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2148  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  85.82 
 
 
557 aa  1003    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.249832  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3991  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  77.16 
 
 
556 aa  894    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661802  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3124  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  62.41 
 
 
564 aa  702    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0338  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  61.9 
 
 
556 aa  700    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0988225  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  62.19 
 
 
545 aa  694    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10550  putative sulfite or nitrite reductas  58.3 
 
 
557 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0655  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  57.88 
 
 
551 aa  651    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2425  sulfite reductase oxidoreductase protein  55.35 
 
 
553 aa  634  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3112  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  54.08 
 
 
552 aa  632  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3664  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  53.93 
 
 
559 aa  634  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40770  sulfite reductase  54.63 
 
 
552 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74513  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2480  sulfite reductase (ferredoxin)  54.15 
 
 
559 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  56.44 
 
 
548 aa  631  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0798  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  54.07 
 
 
560 aa  628  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2513  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  53.76 
 
 
557 aa  629  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67153  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3457  sulfite reductase  54.45 
 
 
552 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.998056  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1671  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  54.61 
 
 
558 aa  631  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0706341  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1864  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  54.15 
 
 
559 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0970  Ferredoxin--nitrite reductase  53.93 
 
 
559 aa  631  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0819  ferredoxin--nitrite reductase  54.33 
 
 
559 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2475  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  54.15 
 
 
559 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.187728  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2147  sulfite reductase (ferredoxin)  54.63 
 
 
552 aa  628  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0201969  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1013  sulfite reductase, ferredoxin subunit  53.75 
 
 
559 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1166  sulfite reductase  53.75 
 
 
589 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.878601  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5806  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  53.79 
 
 
559 aa  626  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2229  Sulfite reductase (ferredoxin)  54.81 
 
 
553 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2689  Sulfite reductase (ferredoxin)  54.99 
 
 
553 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.671477  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0663  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  53.93 
 
 
559 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.6828  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1006  sulfite reductase, ferredoxin subunit  53.93 
 
 
559 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2348  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  53.93 
 
 
559 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1662  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  53.93 
 
 
559 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2937  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  53.93 
 
 
559 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655156  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2392  sulfite reductase (ferredoxin)  53.79 
 
 
559 aa  624  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2524  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  53.61 
 
 
559 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2371  sulphite reductase hemoprotein, beta subunit  53.08 
 
 
550 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1528  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  53.9 
 
 
550 aa  619  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.245681  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3324  sulfite reductase (ferredoxin)  53.08 
 
 
550 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1884  sulfite reductase (ferredoxin)  53.07 
 
 
550 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1978  sulfite reductase (ferredoxin)  53.07 
 
 
550 aa  618  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126005  normal  0.0650245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2912  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  53.51 
 
 
557 aa  617  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.198106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2696  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  53.99 
 
 
560 aa  615  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2345  sulfite reductase (ferredoxin)  53.33 
 
 
553 aa  617  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0166972 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0814  sulfite reductase  53.39 
 
 
589 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2013  sulphite reductase  53.58 
 
 
554 aa  609  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160364  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2816  sulfite reductase (NADPH) subunit beta  53.26 
 
 
560 aa  611  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  53.1 
 
 
570 aa  605  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1891  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  53.45 
 
 
550 aa  607  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3940  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  53.45 
 
 
568 aa  599  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1862  sulfite reductase oxidoreductase protein  55.36 
 
 
577 aa  596  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.816955  normal  0.207611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27520  Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  54.08 
 
 
552 aa  598  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3156  sulfite reductase (ferredoxin)  52.36 
 
 
552 aa  593  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240199  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1068  putative sulfite reductase, beta subunit  51.52 
 
 
561 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1110  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  51.68 
 
 
560 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4515  Sulfite reductase (ferredoxin)  49.83 
 
 
596 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2456  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S protein  50.34 
 
 
605 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1394  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  50.98 
 
 
561 aa  580  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1503  putative nitrite/sulfite reductase  52.32 
 
 
569 aa  581  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0107318  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2784  sulfite reductase (ferredoxin)  52.25 
 
 
568 aa  576  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2427  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  48.47 
 
 
602 aa  569  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5829  sulfite reductase (ferredoxin)  48.47 
 
 
596 aa  571  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.635326 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2339  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  48.99 
 
 
608 aa  570  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0922  putative nitrite/sulfite reductase  50.17 
 
 
595 aa  567  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1264  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  51 
 
 
551 aa  568  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.657041  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4652  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  48.57 
 
 
629 aa  564  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  hitchhiker  0.00315368 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1568  nitrite/sulfite reductase family protein  49.16 
 
 
729 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1354  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component  49.32 
 
 
594 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249924 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3052  nitrite/sulfite reductase family protein  48.99 
 
 
605 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387475  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1435  sulfite reductase, beta subunit  48.99 
 
 
633 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0628  nitrite/sulfite reductase family protein  48.99 
 
 
633 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1466  sulfite reductase, beta subunit  49.16 
 
 
633 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0525  nitrite/sulfite reductase family protein  48.99 
 
 
633 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>