More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1298 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  98.92 
 
 
553 aa  1124    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  100 
 
 
553 aa  1135    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  66 
 
 
513 aa  738    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  66.2 
 
 
513 aa  729    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  66.29 
 
 
542 aa  774    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  47.32 
 
 
510 aa  489  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  47.36 
 
 
512 aa  483  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  47.63 
 
 
513 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  46.53 
 
 
536 aa  478  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  47.63 
 
 
513 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  45.11 
 
 
521 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  46.27 
 
 
516 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  40.46 
 
 
633 aa  390  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  38.09 
 
 
621 aa  333  6e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  36.14 
 
 
541 aa  306  6e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  35.45 
 
 
492 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  36.14 
 
 
540 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  36.47 
 
 
540 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  36.47 
 
 
540 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  36.14 
 
 
540 aa  298  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  36.35 
 
 
540 aa  297  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  36.14 
 
 
540 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  36.14 
 
 
540 aa  296  7e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  36.75 
 
 
540 aa  296  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  36.14 
 
 
540 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  36.14 
 
 
540 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  35.74 
 
 
540 aa  292  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  33.14 
 
 
586 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  31.52 
 
 
586 aa  280  5e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.33 
 
 
562 aa  279  8e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30 
 
 
591 aa  271  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  31.32 
 
 
553 aa  270  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  32.69 
 
 
586 aa  268  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.33 
 
 
550 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  31.64 
 
 
542 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.04 
 
 
589 aa  264  3e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.87 
 
 
565 aa  262  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.42 
 
 
603 aa  262  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  33.2 
 
 
569 aa  259  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  32.73 
 
 
560 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  31.46 
 
 
586 aa  258  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  30.85 
 
 
643 aa  257  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  30.14 
 
 
551 aa  257  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  29.28 
 
 
560 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  34.29 
 
 
480 aa  254  3e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  32.71 
 
 
564 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  31.56 
 
 
591 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.68 
 
 
592 aa  251  3e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  32.6 
 
 
571 aa  250  5e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  29.71 
 
 
586 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  31.88 
 
 
581 aa  247  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  30.98 
 
 
595 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  32.17 
 
 
599 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  31.61 
 
 
595 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  32.17 
 
 
556 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  32.13 
 
 
581 aa  242  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  31.07 
 
 
569 aa  240  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  30.85 
 
 
567 aa  240  5.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  30.41 
 
 
568 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  31.84 
 
 
604 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  30.24 
 
 
573 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  27.78 
 
 
590 aa  237  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.24 
 
 
592 aa  237  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  29.05 
 
 
596 aa  237  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  28.52 
 
 
590 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  29.05 
 
 
596 aa  236  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.92 
 
 
569 aa  233  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  30.29 
 
 
615 aa  233  6e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  29.42 
 
 
605 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  28.49 
 
 
601 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  30.63 
 
 
521 aa  231  3e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  29.69 
 
 
569 aa  231  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  31.74 
 
 
567 aa  230  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.79 
 
 
556 aa  229  9e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  30.59 
 
 
519 aa  229  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  27.66 
 
 
648 aa  229  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.17 
 
 
805 aa  227  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  29.63 
 
 
570 aa  227  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.2 
 
 
793 aa  223  6e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  29.62 
 
 
570 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  27.71 
 
 
639 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  28.69 
 
 
608 aa  219  7.999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.49 
 
 
573 aa  219  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.32 
 
 
590 aa  219  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  29.23 
 
 
560 aa  217  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  29.34 
 
 
560 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.25 
 
 
569 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  29.04 
 
 
560 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  29.04 
 
 
560 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  29.04 
 
 
560 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.51 
 
 
590 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  28.23 
 
 
563 aa  206  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1264  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  27.65 
 
 
551 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.657041  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2912  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.6 
 
 
557 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.198106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2513  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.5 
 
 
557 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67153  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  26.24 
 
 
494 aa  170  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  25.94 
 
 
732 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  28.93 
 
 
796 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1671  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.75 
 
 
558 aa  161  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0706341  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3991  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  25.21 
 
 
556 aa  160  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>