More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5008 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  60.64 
 
 
590 aa  745    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  97.15 
 
 
596 aa  1189    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  56.12 
 
 
590 aa  688    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  96.64 
 
 
601 aa  1184    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  60.42 
 
 
586 aa  729    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  100 
 
 
596 aa  1222    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  59.28 
 
 
586 aa  699    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  80.48 
 
 
595 aa  981    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  86.91 
 
 
605 aa  1053    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  60.41 
 
 
604 aa  727    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  82.11 
 
 
595 aa  989    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  48.12 
 
 
615 aa  574  1.0000000000000001e-162  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  45.27 
 
 
599 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  44.84 
 
 
608 aa  501  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  38.37 
 
 
732 aa  343  5.999999999999999e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  39.06 
 
 
494 aa  340  4e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  34.91 
 
 
512 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  32.35 
 
 
510 aa  269  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  34.47 
 
 
513 aa  267  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  34.47 
 
 
513 aa  267  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  33.33 
 
 
536 aa  263  6e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  32.34 
 
 
540 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  33.83 
 
 
513 aa  254  3e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  31.63 
 
 
540 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  31.95 
 
 
540 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  31.63 
 
 
540 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  31.63 
 
 
540 aa  251  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  31.57 
 
 
540 aa  250  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  31.57 
 
 
540 aa  250  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  33.13 
 
 
553 aa  249  8e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  31.76 
 
 
540 aa  249  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  31.57 
 
 
540 aa  248  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  31.57 
 
 
540 aa  248  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  32.05 
 
 
513 aa  247  4e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  32.64 
 
 
516 aa  247  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  32.12 
 
 
541 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  32.48 
 
 
521 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  32.08 
 
 
567 aa  243  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  31.31 
 
 
540 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  31.98 
 
 
542 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  29.24 
 
 
553 aa  240  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  29.05 
 
 
553 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  31.43 
 
 
521 aa  232  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  30.97 
 
 
492 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  29.96 
 
 
643 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  31.03 
 
 
639 aa  225  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  30.66 
 
 
586 aa  224  4.9999999999999996e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  31.25 
 
 
648 aa  220  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.34 
 
 
550 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  31.09 
 
 
568 aa  214  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.42 
 
 
589 aa  213  5.999999999999999e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  29.72 
 
 
633 aa  213  9e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  32.14 
 
 
621 aa  213  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.97 
 
 
562 aa  212  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  31.08 
 
 
560 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  30.67 
 
 
591 aa  211  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.71 
 
 
591 aa  207  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  28.47 
 
 
586 aa  207  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  32.41 
 
 
560 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.98 
 
 
592 aa  204  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  26.24 
 
 
519 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.26 
 
 
556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  27.06 
 
 
480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  31.03 
 
 
567 aa  198  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.03 
 
 
565 aa  197  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  30.53 
 
 
569 aa  196  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.77 
 
 
757 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  27.63 
 
 
542 aa  194  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  29.1 
 
 
551 aa  194  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.71 
 
 
603 aa  193  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  30.91 
 
 
569 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.26 
 
 
569 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  30.24 
 
 
586 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  30.47 
 
 
569 aa  189  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  30.78 
 
 
570 aa  189  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3268  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.69 
 
 
606 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446029  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  28.87 
 
 
573 aa  187  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  30.56 
 
 
570 aa  187  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.08 
 
 
590 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  30.38 
 
 
556 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.88 
 
 
569 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  28.44 
 
 
571 aa  181  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.79 
 
 
793 aa  180  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3604  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.64 
 
 
614 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387306  normal  0.13043 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  28.63 
 
 
590 aa  180  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  28.63 
 
 
573 aa  180  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  30.11 
 
 
564 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  27.45 
 
 
560 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  27.32 
 
 
560 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  27.32 
 
 
560 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  27.32 
 
 
560 aa  171  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  27.37 
 
 
560 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.31 
 
 
805 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  26.49 
 
 
487 aa  169  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  28.32 
 
 
581 aa  169  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4432  ferredoxin--nitrite reductase  30.04 
 
 
607 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.98 
 
 
592 aa  167  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.77 
 
 
581 aa  166  8e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1153  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  27.67 
 
 
555 aa  166  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2513  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.21 
 
 
557 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67153  normal  0.43061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>