More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1737 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  100 
 
 		 608 aa  1254    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  49.5 
 
 		 599 aa  581  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  45.68 
 
 		 615 aa  523  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  44.87 
 
 		 590 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  44.01 
 
 		 586 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  45.17 
 
 		 586 aa  514  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  45.83 
 
 		 595 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  44.84 
 
 		 596 aa  501  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  43.31 
 
 		 604 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  44.16 
 
 		 601 aa  498  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  43.99 
 
 		 596 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  43.75 
 
 		 605 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  45.53 
 
 		 595 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  42.24 
 
 		 590 aa  479  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  36.47 
 
 		 732 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  37.38 
 
 		 494 aa  317  5e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  33.97 
 
 		 521 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  32.27 
 
 		 536 aa  277  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  34.32 
 
 		 510 aa  276  9e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  34.48 
 
 		 513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  34.48 
 
 		 513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  33.58 
 
 		 516 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  30.09 
 
 		 542 aa  268  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  35.07 
 
 		 512 aa  256  6e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  31.72 
 
 		 553 aa  255  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  31.37 
 
 		 513 aa  244  3e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  30.16 
 
 		 541 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  31.74 
 
 		 542 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  28.81 
 
 		 540 aa  237  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  29.24 
 
 		 540 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  29.24 
 
 		 540 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  31.55 
 
 		 521 aa  233  7.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  29.24 
 
 		 540 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  29.24 
 
 		 540 aa  233  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  29.24 
 
 		 540 aa  233  9e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  29.24 
 
 		 540 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  29.22 
 
 		 551 aa  233  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  28.86 
 
 		 540 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  31.34 
 
 		 513 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  30.79 
 
 		 633 aa  230  7e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  28.86 
 
 		 540 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  29.61 
 
 		 567 aa  228  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  28.81 
 
 		 540 aa  227  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  29.18 
 
 		 540 aa  225  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  28.9 
 
 		 553 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  29.27 
 
 		 643 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.13 
 
 		 591 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  28.69 
 
 		 553 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  30.77 
 
 		 586 aa  219  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  28.6 
 
 		 586 aa  218  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  29.7 
 
 		 492 aa  217  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27 
 
 		 569 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.07 
 
 		 805 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.87 
 
 		 590 aa  213  7e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.68 
 
 		 562 aa  213  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.88 
 
 		 589 aa  208  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  25.98 
 
 		 519 aa  207  4e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  27.98 
 
 		 480 aa  207  6e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  30.76 
 
 		 591 aa  205  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.88 
 
 		 565 aa  204  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.39 
 
 		 603 aa  203  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  31.01 
 
 		 568 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  30.48 
 
 		 621 aa  201  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.65 
 
 		 793 aa  199  7.999999999999999e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.96 
 
 		 556 aa  200  7.999999999999999e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  28.65 
 
 		 567 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  28.73 
 
 		 560 aa  197  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.54 
 
 		 550 aa  196  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.64 
 
 		 592 aa  194  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  30.17 
 
 		 556 aa  194  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  28.02 
 
 		 648 aa  193  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  28.18 
 
 		 560 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  28.18 
 
 		 560 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  28.18 
 
 		 569 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  28 
 
 		 560 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  28 
 
 		 560 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1942  sulfite/nitrite reductase hemoprotein subunit  29.31 
 
 		 556 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  28 
 
 		 560 aa  190  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0593  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.31 
 
 		 556 aa  190  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  28.8 
 
 		 571 aa  189  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1931  ferredoxin--nitrite reductase  29.69 
 
 		 556 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  28.21 
 
 		 639 aa  188  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1153  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  29.31 
 
 		 555 aa  187  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3268  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.85 
 
 		 606 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  26.68 
 
 		 560 aa  186  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  27.68 
 
 		 487 aa  186  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3156  sulfite reductase (ferredoxin)  28.4 
 
 		 552 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  28.26 
 
 		 569 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  27.12 
 
 		 569 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.34 
 
 		 590 aa  184  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  30.14 
 
 		 570 aa  184  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  27.97 
 
 		 573 aa  183  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2637  sulfite reductase (NADPH)  27.27 
 
 		 713 aa  183  8.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0679  sulfite reductase ferredoxin  26.64 
 
 		 602 aa  183  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  26.94 
 
 		 586 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.1 
 
 		 757 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0338  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.11 
 
 		 556 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0988225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  27.22 
 
 		 564 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  27.37 
 
 		 563 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4013  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.86 
 
 		 550 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>