More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5167 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  60.29 
 
 
550 aa  682    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  59.82 
 
 
560 aa  679    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  58.97 
 
 
581 aa  647    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  63.04 
 
 
564 aa  691    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  60.74 
 
 
571 aa  680    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  62.21 
 
 
556 aa  662    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  59.62 
 
 
565 aa  697    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  64.9 
 
 
560 aa  738    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  59.17 
 
 
563 aa  666    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  60.07 
 
 
573 aa  680    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  58.84 
 
 
560 aa  671    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  60.33 
 
 
569 aa  645    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  64.1 
 
 
570 aa  701    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  63.27 
 
 
592 aa  682    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  100 
 
 
568 aa  1160    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  68.07 
 
 
569 aa  771    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  63.7 
 
 
569 aa  707    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  58.82 
 
 
590 aa  664    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  58.84 
 
 
560 aa  671    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  63.19 
 
 
562 aa  701    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  58.84 
 
 
560 aa  673    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  61.43 
 
 
586 aa  669    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  67.89 
 
 
569 aa  766    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  59.03 
 
 
560 aa  672    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  62.16 
 
 
560 aa  685    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  58.5 
 
 
581 aa  657    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  60.93 
 
 
567 aa  665    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  63.35 
 
 
573 aa  696    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  57.29 
 
 
570 aa  632  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  55.43 
 
 
556 aa  606  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  39.77 
 
 
521 aa  341  2e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  38.08 
 
 
567 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  37.43 
 
 
540 aa  334  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.61 
 
 
591 aa  331  2e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  38.58 
 
 
586 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  37.48 
 
 
541 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  36.51 
 
 
540 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  36.73 
 
 
540 aa  320  5e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  36.85 
 
 
540 aa  320  6e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  36.26 
 
 
519 aa  320  6e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  36.55 
 
 
540 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  36.55 
 
 
540 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  36.55 
 
 
540 aa  318  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  36.55 
 
 
540 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  36.55 
 
 
540 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  36.36 
 
 
540 aa  316  9e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  35.99 
 
 
540 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  38.14 
 
 
589 aa  309  9e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  33.76 
 
 
542 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  35.17 
 
 
553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.74 
 
 
592 aa  292  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  35.34 
 
 
643 aa  288  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.98 
 
 
603 aa  287  4e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  36.84 
 
 
510 aa  283  5.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  35.88 
 
 
536 aa  280  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  35.86 
 
 
591 aa  279  8e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  35.6 
 
 
586 aa  279  1e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  33.27 
 
 
551 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  35.57 
 
 
513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  35.57 
 
 
513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  32.95 
 
 
516 aa  266  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  35.14 
 
 
512 aa  266  8.999999999999999e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  33.84 
 
 
648 aa  263  8e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.13 
 
 
793 aa  260  5.0000000000000005e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  34.32 
 
 
639 aa  258  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  33.85 
 
 
521 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.42 
 
 
805 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  33.52 
 
 
599 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.98 
 
 
569 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  32.28 
 
 
492 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  30.41 
 
 
553 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  30.41 
 
 
553 aa  243  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.39 
 
 
590 aa  243  9e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  32.11 
 
 
615 aa  243  9e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  31.91 
 
 
513 aa  242  2e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  33.33 
 
 
586 aa  241  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  31.77 
 
 
513 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  32.04 
 
 
590 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  33.12 
 
 
605 aa  226  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  32.82 
 
 
542 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  30.69 
 
 
601 aa  224  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  31.58 
 
 
590 aa  223  6e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  31.86 
 
 
586 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  30.52 
 
 
596 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  34.78 
 
 
621 aa  221  3e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  31.09 
 
 
596 aa  220  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  33.09 
 
 
604 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  34.12 
 
 
595 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  28.17 
 
 
480 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  33.48 
 
 
595 aa  216  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1264  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  31.31 
 
 
551 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.657041  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  31.01 
 
 
608 aa  209  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.03 
 
 
757 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  28.74 
 
 
548 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  30.83 
 
 
633 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1942  sulfite/nitrite reductase hemoprotein subunit  28.42 
 
 
556 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0593  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  28.42 
 
 
556 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313736  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3124  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  30 
 
 
564 aa  194  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2637  sulfite reductase (NADPH)  27.62 
 
 
713 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.42 
 
 
545 aa  192  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.135047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>