More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12830 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  67.86 
 
 		 563 aa  783    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  64.9 
 
 		 568 aa  725    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  63.48 
 
 		 565 aa  728    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  66.49 
 
 		 562 aa  753    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  64.54 
 
 		 567 aa  723    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  60.54 
 
 		 556 aa  665    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  64.31 
 
 		 564 aa  704    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  66.31 
 
 		 569 aa  758    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  61.86 
 
 		 581 aa  687    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  67.45 
 
 		 556 aa  717    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  100 
 
 		 560 aa  1132    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  67.52 
 
 		 569 aa  763    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  62.97 
 
 		 569 aa  678    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  62.36 
 
 		 586 aa  682    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  69.22 
 
 		 560 aa  802    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  69.58 
 
 		 560 aa  804    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  80 
 
 		 570 aa  872    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  70.05 
 
 		 573 aa  801    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  63.46 
 
 		 571 aa  704    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  69.58 
 
 		 560 aa  803    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  68.07 
 
 		 569 aa  769    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  64.73 
 
 		 550 aa  716    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  67.21 
 
 		 592 aa  740    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  62.19 
 
 		 570 aa  668    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  69.24 
 
 		 590 aa  790    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  64.07 
 
 		 560 aa  712    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  61.77 
 
 		 581 aa  703    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  64.39 
 
 		 573 aa  721    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  69.58 
 
 		 560 aa  803    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  69.22 
 
 		 560 aa  800    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  39.48 
 
 		 567 aa  340  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  39.09 
 
 		 521 aa  338  1.9999999999999998e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  38.06 
 
 		 591 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  36.21 
 
 		 540 aa  326  9e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  38.95 
 
 		 589 aa  322  9.999999999999999e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  35.34 
 
 		 542 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  38.29 
 
 		 586 aa  320  5e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  36.28 
 
 		 540 aa  318  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  36.1 
 
 		 540 aa  317  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  35.7 
 
 		 541 aa  316  8e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  36.1 
 
 		 540 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  36.1 
 
 		 540 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  36.1 
 
 		 540 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  36.1 
 
 		 540 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  35.91 
 
 		 540 aa  312  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  35.91 
 
 		 540 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  35.73 
 
 		 540 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  35.66 
 
 		 540 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  35.18 
 
 		 519 aa  307  3e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  38.45 
 
 		 551 aa  307  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  35.6 
 
 		 553 aa  306  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  35.54 
 
 		 643 aa  299  7e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.9 
 
 		 569 aa  296  6e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  37.21 
 
 		 591 aa  291  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  35.45 
 
 		 648 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.86 
 
 		 592 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  34.42 
 
 		 510 aa  287  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.72 
 
 		 805 aa  283  6.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.28 
 
 		 590 aa  283  7.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  34.41 
 
 		 513 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  34.41 
 
 		 513 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.66 
 
 		 793 aa  279  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  35.98 
 
 		 639 aa  278  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.65 
 
 		 603 aa  278  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  34.62 
 
 		 536 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  35.5 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  34.54 
 
 		 521 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  33.53 
 
 		 516 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  34.9 
 
 		 586 aa  265  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  31.91 
 
 		 513 aa  259  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  29.28 
 
 		 553 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  29.12 
 
 		 553 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  32.47 
 
 		 586 aa  250  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  30.54 
 
 		 513 aa  248  2e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  30.8 
 
 		 542 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  34.11 
 
 		 599 aa  238  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  31.32 
 
 		 615 aa  233  6e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  31.39 
 
 		 492 aa  232  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  31.08 
 
 		 590 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  30.42 
 
 		 590 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  28.91 
 
 		 480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  33.84 
 
 		 605 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.01 
 
 		 757 aa  214  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  29.87 
 
 		 586 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  33.99 
 
 		 595 aa  210  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  31.58 
 
 		 633 aa  208  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  34.12 
 
 		 595 aa  208  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  32.62 
 
 		 596 aa  206  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2689  Sulfite reductase (ferredoxin)  30.97 
 
 		 553 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.671477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  31.29 
 
 		 621 aa  204  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  32.41 
 
 		 596 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2229  Sulfite reductase (ferredoxin)  30.77 
 
 		 553 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  32.41 
 
 		 601 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3112  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.12 
 
 		 552 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2425  sulfite reductase oxidoreductase protein  30.12 
 
 		 553 aa  197  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  28.73 
 
 		 608 aa  197  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2371  sulphite reductase hemoprotein, beta subunit  29.35 
 
 		 550 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1884  sulfite reductase (ferredoxin)  29.47 
 
 		 550 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2462  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.63 
 
 		 552 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133864  hitchhiker  0.0089814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2513  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.42 
 
 		 557 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67153  normal  0.43061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>