More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1240 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  63.88 
 
 		 536 aa  705    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  66.28 
 
 		 513 aa  716    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  100 
 
 		 512 aa  1050    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  60.08 
 
 		 516 aa  663    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  61.69 
 
 		 521 aa  668    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  63.6 
 
 		 510 aa  699    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  66.28 
 
 		 513 aa  716    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  51.68 
 
 		 542 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  49.4 
 
 		 513 aa  508  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  47.82 
 
 		 513 aa  500  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  47.75 
 
 		 553 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  47.36 
 
 		 553 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  47.67 
 
 		 633 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  44.89 
 
 		 621 aa  422  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  42.63 
 
 		 540 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  42.43 
 
 		 540 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  42.23 
 
 		 540 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  42.43 
 
 		 540 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  42.43 
 
 		 540 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  42.23 
 
 		 540 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  42.03 
 
 		 540 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  42.23 
 
 		 540 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  42.23 
 
 		 540 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  41.83 
 
 		 540 aa  375  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  41.83 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  41.98 
 
 		 541 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  42.29 
 
 		 553 aa  362  7.0000000000000005e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  41.76 
 
 		 492 aa  360  3e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  39.92 
 
 		 551 aa  355  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  39.73 
 
 		 542 aa  349  6e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  39.07 
 
 		 586 aa  342  7e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  39.27 
 
 		 586 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.85 
 
 		 589 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.85 
 
 		 591 aa  317  3e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  35.69 
 
 		 480 aa  316  6e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  37.14 
 
 		 591 aa  314  2.9999999999999996e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.74 
 
 		 592 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.04 
 
 		 590 aa  307  3e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  35.83 
 
 		 569 aa  303  7.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  35.32 
 
 		 603 aa  300  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.67 
 
 		 793 aa  298  1e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  38.12 
 
 		 550 aa  298  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  36.43 
 
 		 567 aa  298  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.28 
 
 		 562 aa  296  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  37.94 
 
 		 599 aa  291  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.17 
 
 		 556 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  35.85 
 
 		 595 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  36.38 
 
 		 586 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  34.93 
 
 		 560 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  36.27 
 
 		 595 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  35.98 
 
 		 586 aa  279  8e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  35.11 
 
 		 596 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  35.11 
 
 		 601 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  36.17 
 
 		 560 aa  278  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  35.11 
 
 		 596 aa  277  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.38 
 
 		 805 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  34.46 
 
 		 573 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  35.41 
 
 		 605 aa  274  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  34.43 
 
 		 590 aa  272  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.4 
 
 		 565 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  35.71 
 
 		 569 aa  271  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  35.35 
 
 		 567 aa  269  7e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  34.44 
 
 		 590 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  35.33 
 
 		 568 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  34.11 
 
 		 586 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  35.85 
 
 		 570 aa  267  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  36.23 
 
 		 569 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  34.62 
 
 		 604 aa  264  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  35.07 
 
 		 608 aa  263  6e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  36.8 
 
 		 521 aa  262  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  35.33 
 
 		 564 aa  261  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.71 
 
 		 592 aa  260  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  30.66 
 
 		 519 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  34.81 
 
 		 643 aa  257  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  34.03 
 
 		 569 aa  257  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  33.46 
 
 		 569 aa  253  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  32.94 
 
 		 615 aa  252  9.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  34.06 
 
 		 639 aa  252  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  33.46 
 
 		 581 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  35.62 
 
 		 556 aa  251  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  33.77 
 
 		 581 aa  246  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  32.04 
 
 		 648 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  33.47 
 
 		 571 aa  243  6e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  34.26 
 
 		 560 aa  242  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  32.21 
 
 		 573 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  32.34 
 
 		 590 aa  240  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  33.4 
 
 		 560 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  32.87 
 
 		 560 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  33.2 
 
 		 560 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  33.2 
 
 		 560 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  34.26 
 
 		 570 aa  229  9e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  32.38 
 
 		 563 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  29.93 
 
 		 494 aa  215  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  29.75 
 
 		 732 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2912  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.73 
 
 		 557 aa  196  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.198106 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1671  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.79 
 
 		 558 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0706341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.02 
 
 		 757 aa  179  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1241  ferredoxin--nitrite reductase  27.2 
 
 		 567 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.250067  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1264  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.67 
 
 		 551 aa  173  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.657041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3267  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.45 
 
 		 552 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>