More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1407 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  100 
 
 		 521 aa  1062    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  41.56 
 
 		 562 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  43.11 
 
 		 560 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  40.64 
 
 		 573 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  42.52 
 
 		 550 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  42.54 
 
 		 556 aa  375  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  41.83 
 
 		 569 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  41.41 
 
 		 569 aa  364  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  40.84 
 
 		 556 aa  362  8e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  40.26 
 
 		 567 aa  362  1e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  39.42 
 
 		 541 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  39.11 
 
 		 540 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  39.66 
 
 		 565 aa  355  8.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  39.88 
 
 		 540 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  38.95 
 
 		 540 aa  353  4e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  39.2 
 
 		 586 aa  352  7e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  38.83 
 
 		 540 aa  352  7e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  39.92 
 
 		 560 aa  352  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  39.68 
 
 		 540 aa  352  8e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  39.68 
 
 		 540 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  39.48 
 
 		 540 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  39.44 
 
 		 540 aa  351  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  39.48 
 
 		 540 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  39.48 
 
 		 540 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  39.09 
 
 		 540 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  38.23 
 
 		 590 aa  346  6e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  39.35 
 
 		 560 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  39.16 
 
 		 560 aa  345  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  39.16 
 
 		 560 aa  345  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  38.36 
 
 		 571 aa  343  5e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  40 
 
 		 569 aa  343  5.999999999999999e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  39.77 
 
 		 569 aa  342  8e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  38.97 
 
 		 560 aa  342  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  39.28 
 
 		 563 aa  341  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  39.09 
 
 		 560 aa  338  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  39.44 
 
 		 570 aa  334  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  37.74 
 
 		 573 aa  333  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  39.77 
 
 		 568 aa  332  7.000000000000001e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  39.33 
 
 		 592 aa  329  6e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  38.46 
 
 		 564 aa  326  5e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  36.79 
 
 		 581 aa  323  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  36.74 
 
 		 581 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  38.52 
 
 		 570 aa  314  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  36.67 
 
 		 542 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  35.94 
 
 		 639 aa  286  7e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  34.3 
 
 		 553 aa  281  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  34.73 
 
 		 567 aa  279  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.77 
 
 		 591 aa  278  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  32.9 
 
 		 586 aa  278  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  36.57 
 
 		 643 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.08 
 
 		 589 aa  268  1e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  35.83 
 
 		 551 aa  267  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  34.01 
 
 		 586 aa  265  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.09 
 
 		 592 aa  263  6e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  35.6 
 
 		 521 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  34.43 
 
 		 648 aa  260  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  35.77 
 
 		 513 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  35.77 
 
 		 513 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  35.45 
 
 		 510 aa  258  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  32.9 
 
 		 591 aa  257  3e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  36.17 
 
 		 512 aa  255  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  33.09 
 
 		 586 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  33.72 
 
 		 536 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.86 
 
 		 793 aa  253  9.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.57 
 
 		 603 aa  252  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  33.14 
 
 		 595 aa  251  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.12 
 
 		 569 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  33.01 
 
 		 595 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  34.08 
 
 		 516 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  31.77 
 
 		 615 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  32.66 
 
 		 519 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  31.24 
 
 		 605 aa  236  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.25 
 
 		 590 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  31.55 
 
 		 608 aa  233  6e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  32.01 
 
 		 513 aa  232  1e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  31.43 
 
 		 596 aa  232  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  31.62 
 
 		 596 aa  232  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  30.63 
 
 		 553 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  31.43 
 
 		 601 aa  229  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  30.04 
 
 		 553 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  33.33 
 
 		 492 aa  229  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  31.78 
 
 		 599 aa  226  6e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  33.49 
 
 		 633 aa  224  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  34.04 
 
 		 621 aa  223  4.9999999999999996e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1931  ferredoxin--nitrite reductase  32.27 
 
 		 556 aa  223  8e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.02 
 
 		 805 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1942  sulfite/nitrite reductase hemoprotein subunit  32.01 
 
 		 556 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0593  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  32.01 
 
 		 556 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  31.19 
 
 		 513 aa  221  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  29.53 
 
 		 542 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  30.06 
 
 		 590 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2912  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.08 
 
 		 557 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.198106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  30 
 
 		 604 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  30.06 
 
 		 586 aa  213  9e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  31.2 
 
 		 480 aa  212  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2513  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.73 
 
 		 557 aa  211  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67153  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  29.15 
 
 		 590 aa  210  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0338  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.54 
 
 		 556 aa  210  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0988225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.23 
 
 		 757 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  32.07 
 
 		 545 aa  208  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.135047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>