More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3704 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  66 
 
 		 592 aa  720    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  62.85 
 
 		 564 aa  698    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  65.1 
 
 		 565 aa  726    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  61.05 
 
 		 586 aa  661    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  64.07 
 
 		 562 aa  718    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  65.06 
 
 		 556 aa  698    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  60.88 
 
 		 560 aa  699    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  64.04 
 
 		 560 aa  735    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  62.08 
 
 		 570 aa  676    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  64.01 
 
 		 560 aa  734    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  61.05 
 
 		 569 aa  656    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  69.44 
 
 		 570 aa  758    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  61.71 
 
 		 550 aa  684    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  92.27 
 
 		 569 aa  1046    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  60.43 
 
 		 567 aa  678    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  64.78 
 
 		 590 aa  733    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  65.96 
 
 		 569 aa  748    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  62.57 
 
 		 560 aa  733    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  68.3 
 
 		 560 aa  776    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  61.31 
 
 		 571 aa  694    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  62.74 
 
 		 560 aa  733    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  62.82 
 
 		 573 aa  727    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  60.64 
 
 		 563 aa  706    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  67.88 
 
 		 568 aa  765    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  61.18 
 
 		 556 aa  666    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  58.33 
 
 		 581 aa  681    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  59.39 
 
 		 581 aa  672    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  100 
 
 		 569 aa  1149    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  65.11 
 
 		 573 aa  717    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  62.74 
 
 		 560 aa  733    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  38.86 
 
 		 540 aa  344  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  39.77 
 
 		 521 aa  342  8e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  38.31 
 
 		 540 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  37.2 
 
 		 540 aa  333  6e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  37.02 
 
 		 540 aa  332  8e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  37.2 
 
 		 540 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  37.2 
 
 		 540 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  37.57 
 
 		 540 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  37.02 
 
 		 540 aa  331  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  37.2 
 
 		 540 aa  332  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  37.64 
 
 		 567 aa  330  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  37.57 
 
 		 540 aa  330  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  38.04 
 
 		 541 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  36.55 
 
 		 540 aa  326  7e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  36.59 
 
 		 542 aa  325  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  38.55 
 
 		 586 aa  325  1e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.46 
 
 		 591 aa  324  3e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  38.03 
 
 		 589 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  36.33 
 
 		 519 aa  313  4.999999999999999e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  37.17 
 
 		 551 aa  289  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  36.7 
 
 		 591 aa  287  2.9999999999999996e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  34.92 
 
 		 553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  36.16 
 
 		 643 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  37.07 
 
 		 648 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  36.82 
 
 		 586 aa  277  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.42 
 
 		 569 aa  276  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.35 
 
 		 592 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.76 
 
 		 805 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  35.09 
 
 		 793 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.01 
 
 		 603 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  34.98 
 
 		 510 aa  266  5.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  33.93 
 
 		 536 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.04 
 
 		 590 aa  258  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  34.27 
 
 		 513 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  34.27 
 
 		 513 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  35.7 
 
 		 639 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  34.08 
 
 		 516 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  33.84 
 
 		 512 aa  253  5.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  33.89 
 
 		 492 aa  249  9e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  33.2 
 
 		 521 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  31.01 
 
 		 513 aa  233  6e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  29.92 
 
 		 553 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  29.92 
 
 		 553 aa  233  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  31.35 
 
 		 513 aa  229  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  30.89 
 
 		 586 aa  227  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  32.67 
 
 		 615 aa  227  5.0000000000000005e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  34.61 
 
 		 599 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  30.5 
 
 		 542 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  31.2 
 
 		 590 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  29.48 
 
 		 633 aa  209  8e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  28.82 
 
 		 480 aa  209  1e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  30.57 
 
 		 586 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  30.55 
 
 		 590 aa  196  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  32.77 
 
 		 595 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  30.71 
 
 		 604 aa  194  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3156  sulfite reductase (ferredoxin)  29.62 
 
 		 552 aa  193  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  32.55 
 
 		 595 aa  193  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  28.18 
 
 		 608 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  31.04 
 
 		 605 aa  191  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2147  sulfite reductase (ferredoxin)  28.46 
 
 		 552 aa  190  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0201969  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.1 
 
 		 757 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.36 
 
 		 545 aa  188  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  29.55 
 
 		 548 aa  188  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3457  sulfite reductase  28.46 
 
 		 552 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.998056  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  27.99 
 
 		 596 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  31.26 
 
 		 621 aa  185  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40770  sulfite reductase  28.46 
 
 		 552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  29.88 
 
 		 596 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1264  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.06 
 
 		 551 aa  182  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.657041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10550  putative sulfite or nitrite reductas  28.71 
 
 		 557 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>