More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0718 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  68.78 
 
 		 556 aa  739    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  60.36 
 
 		 560 aa  672    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  61.96 
 
 		 570 aa  651    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  63.27 
 
 		 569 aa  691    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  62.16 
 
 		 592 aa  663    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  57.29 
 
 		 565 aa  639    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  58.55 
 
 		 586 aa  638    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  62.19 
 
 		 560 aa  687    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  59.02 
 
 		 590 aa  655    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  100 
 
 		 570 aa  1148    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  58.15 
 
 		 573 aa  659    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  59.72 
 
 		 560 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  61.22 
 
 		 569 aa  680    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  58.29 
 
 		 550 aa  645    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  68.9 
 
 		 567 aa  782    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  68.66 
 
 		 581 aa  780    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  60.36 
 
 		 560 aa  672    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  73.38 
 
 		 571 aa  857    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  59.82 
 
 		 560 aa  667    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  62.36 
 
 		 569 aa  685    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  60.11 
 
 		 562 aa  662    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  69.16 
 
 		 581 aa  801    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  63.95 
 
 		 573 aa  707    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  57.12 
 
 		 563 aa  644    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  60.36 
 
 		 560 aa  672    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  57.29 
 
 		 568 aa  637    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  58.93 
 
 		 560 aa  659    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  58.58 
 
 		 564 aa  630  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  56.84 
 
 		 556 aa  606  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  58.14 
 
 		 569 aa  604  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  39.85 
 
 		 521 aa  348  2e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  37.68 
 
 		 586 aa  325  2e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  35.71 
 
 		 591 aa  318  2e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  37.29 
 
 		 567 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  35.8 
 
 		 542 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  34.85 
 
 		 540 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.44 
 
 		 589 aa  301  2e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  34.42 
 
 		 541 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  34.73 
 
 		 540 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  34.79 
 
 		 540 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  35.79 
 
 		 553 aa  295  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  34.73 
 
 		 540 aa  294  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  37.88 
 
 		 551 aa  294  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  34.73 
 
 		 540 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  34.73 
 
 		 540 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  34.73 
 
 		 540 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  34.73 
 
 		 540 aa  293  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  35.74 
 
 		 586 aa  292  9e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  34.43 
 
 		 540 aa  292  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  34.73 
 
 		 540 aa  290  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  34.79 
 
 		 540 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  34.79 
 
 		 519 aa  283  6.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.38 
 
 		 569 aa  282  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  33.76 
 
 		 643 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  35.56 
 
 		 648 aa  276  7e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  35.28 
 
 		 805 aa  276  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  34.29 
 
 		 591 aa  271  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.93 
 
 		 592 aa  266  5e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.04 
 
 		 603 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.95 
 
 		 590 aa  263  6e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  33.22 
 
 		 639 aa  250  5e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  33.46 
 
 		 510 aa  249  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.63 
 
 		 793 aa  246  6e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  33.33 
 
 		 492 aa  244  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  32.65 
 
 		 513 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  32.65 
 
 		 513 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  29.64 
 
 		 553 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  29.62 
 
 		 553 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  31.37 
 
 		 521 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  31.72 
 
 		 513 aa  226  7e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  33.12 
 
 		 599 aa  226  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  34.26 
 
 		 512 aa  225  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  31.29 
 
 		 536 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  32.45 
 
 		 513 aa  223  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  31.7 
 
 		 516 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  30.62 
 
 		 590 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  32.01 
 
 		 586 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  29.8 
 
 		 542 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  30.06 
 
 		 633 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  30.77 
 
 		 615 aa  196  9e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  31.32 
 
 		 605 aa  195  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  29.23 
 
 		 590 aa  194  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  27 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  31.39 
 
 		 596 aa  194  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  28.52 
 
 		 586 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  32.02 
 
 		 595 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  32.02 
 
 		 595 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  29.09 
 
 		 604 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  30.9 
 
 		 596 aa  187  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  30.16 
 
 		 621 aa  187  5e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  30.9 
 
 		 601 aa  187  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.3 
 
 		 757 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  29.67 
 
 		 548 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3991  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  28.85 
 
 		 556 aa  179  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661802  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  27.87 
 
 		 608 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  28.24 
 
 		 545 aa  171  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1884  sulfite reductase (ferredoxin)  28.92 
 
 		 550 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0889  sulfite reductase (ferredoxin)  26.84 
 
 		 552 aa  169  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812727 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1891  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.83 
 
 		 550 aa  169  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3112  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.23 
 
 		 552 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>