More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1754 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  61.08 
 
 		 605 aa  699    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  61.54 
 
 		 595 aa  717    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  62.39 
 
 		 595 aa  714    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  60.42 
 
 		 596 aa  729    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  60.17 
 
 		 590 aa  722    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  100 
 
 		 586 aa  1197    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  83.88 
 
 		 590 aa  1020    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  59.72 
 
 		 601 aa  716    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  68.16 
 
 		 604 aa  818    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  61.75 
 
 		 586 aa  719    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  59.9 
 
 		 596 aa  719    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  47.84 
 
 		 615 aa  553  1e-156  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  44.01 
 
 		 608 aa  514  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  45.58 
 
 		 599 aa  514  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  38.91 
 
 		 494 aa  351  3e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  38.61 
 
 		 732 aa  346  8.999999999999999e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  33.53 
 
 		 510 aa  282  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  34.4 
 
 		 553 aa  274  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  34.19 
 
 		 513 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  34.19 
 
 		 513 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  32.95 
 
 		 536 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  33.79 
 
 		 512 aa  261  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  31.19 
 
 		 541 aa  257  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  33.33 
 
 		 513 aa  254  3e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  30.49 
 
 		 553 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  29.71 
 
 		 553 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  33.05 
 
 		 516 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  31.89 
 
 		 513 aa  248  3e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  30.86 
 
 		 540 aa  247  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  31.49 
 
 		 540 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  33.4 
 
 		 521 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  29.66 
 
 		 540 aa  243  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  30.48 
 
 		 540 aa  243  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  29.66 
 
 		 540 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  31.15 
 
 		 643 aa  242  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  29.66 
 
 		 540 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  29.66 
 
 		 540 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  29.03 
 
 		 540 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  29.66 
 
 		 540 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  29.66 
 
 		 540 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  29.72 
 
 		 540 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  32.77 
 
 		 567 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  31.08 
 
 		 542 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  31.14 
 
 		 648 aa  229  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  28.04 
 
 		 480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  28.78 
 
 		 492 aa  220  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  31.53 
 
 		 633 aa  219  8.999999999999998e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  29.76 
 
 		 542 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  31.28 
 
 		 621 aa  218  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.63 
 
 		 550 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  30.63 
 
 		 639 aa  218  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  30.69 
 
 		 586 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.83 
 
 		 562 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.11 
 
 		 589 aa  216  7e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  30.62 
 
 		 551 aa  213  7.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  29.6 
 
 		 586 aa  213  9e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  31.86 
 
 		 568 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  30.06 
 
 		 521 aa  213  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  29.87 
 
 		 560 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.48 
 
 		 556 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  30.78 
 
 		 560 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  25.83 
 
 		 519 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.32 
 
 		 592 aa  201  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  31.62 
 
 		 570 aa  201  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  30.66 
 
 		 586 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  30.6 
 
 		 569 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.99 
 
 		 591 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.57 
 
 		 569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.51 
 
 		 565 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  27.87 
 
 		 573 aa  198  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  31.72 
 
 		 569 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.89 
 
 		 590 aa  196  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  31.87 
 
 		 569 aa  196  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  29.87 
 
 		 591 aa  195  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3268  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.9 
 
 		 606 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446029  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  30.88 
 
 		 567 aa  193  6e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  30.21 
 
 		 560 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  30.21 
 
 		 560 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  30.42 
 
 		 560 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.85 
 
 		 590 aa  192  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  30.21 
 
 		 560 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  30.65 
 
 		 564 aa  188  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.32 
 
 		 573 aa  188  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  28.87 
 
 		 581 aa  189  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  29.04 
 
 		 560 aa  189  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  28.8 
 
 		 581 aa  188  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.14 
 
 		 793 aa  187  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  28.44 
 
 		 563 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  28.52 
 
 		 570 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  28.44 
 
 		 571 aa  184  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3346  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  27.36 
 
 		 605 aa  183  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.01 
 
 		 569 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  33.17 
 
 		 476 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.55 
 
 		 603 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  29.6 
 
 		 556 aa  174  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  27.61 
 
 		 487 aa  173  9e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3156  sulfite reductase (ferredoxin)  28.03 
 
 		 552 aa  173  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.41 
 
 		 757 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.84 
 
 		 545 aa  172  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5531  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.2 
 
 		 609 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>