More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1333 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  70.32 
 
 
551 aa  763    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  100 
 
 
542 aa  1122    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  51.14 
 
 
590 aa  590  1e-167  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  53.87 
 
 
569 aa  588  1e-167  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  49.13 
 
 
793 aa  502  1e-141  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  49.52 
 
 
805 aa  499  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  48.38 
 
 
586 aa  479  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  46.52 
 
 
591 aa  451  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  44.83 
 
 
589 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  45.39 
 
 
592 aa  443  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  43.99 
 
 
591 aa  440  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  40.86 
 
 
603 aa  410  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  41.25 
 
 
540 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  42.57 
 
 
586 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  39.85 
 
 
540 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  39.66 
 
 
540 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  39.66 
 
 
540 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  39.66 
 
 
540 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  39.48 
 
 
540 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  39.74 
 
 
540 aa  392  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  39.48 
 
 
540 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  39.48 
 
 
540 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  39.11 
 
 
540 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  39.29 
 
 
540 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  42.51 
 
 
553 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  38.81 
 
 
541 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  39.69 
 
 
510 aa  369  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.75 
 
 
562 aa  360  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  42.15 
 
 
513 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  42.15 
 
 
513 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  39.96 
 
 
516 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.2 
 
 
550 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.18 
 
 
565 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  38.98 
 
 
492 aa  352  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  38.62 
 
 
521 aa  350  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  39.73 
 
 
512 aa  345  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  35.66 
 
 
560 aa  345  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  36.07 
 
 
567 aa  345  2e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  37.5 
 
 
536 aa  342  8e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.65 
 
 
556 aa  336  7e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  36.13 
 
 
586 aa  331  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  36.68 
 
 
567 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  37.36 
 
 
569 aa  326  5e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  35.71 
 
 
569 aa  325  9e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  36.59 
 
 
569 aa  325  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  35.35 
 
 
556 aa  325  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  36.12 
 
 
571 aa  321  1.9999999999999998e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  35.34 
 
 
560 aa  320  3.9999999999999996e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  34 
 
 
581 aa  318  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  35.11 
 
 
564 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  35.06 
 
 
573 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  37.39 
 
 
480 aa  312  7.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  35.4 
 
 
569 aa  310  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  35.62 
 
 
570 aa  310  4e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  36.21 
 
 
633 aa  307  3e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  34.26 
 
 
581 aa  304  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  35.33 
 
 
643 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  36.67 
 
 
521 aa  302  9e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  35.39 
 
 
519 aa  299  1e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  35.93 
 
 
570 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  34.7 
 
 
639 aa  298  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  33.76 
 
 
568 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  35.42 
 
 
599 aa  295  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  33.03 
 
 
560 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.91 
 
 
592 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  34.57 
 
 
648 aa  290  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  32.66 
 
 
560 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  32.48 
 
 
560 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  32.48 
 
 
560 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  33.39 
 
 
560 aa  286  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  34.06 
 
 
513 aa  286  5.999999999999999e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  32.48 
 
 
513 aa  286  8e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  34.74 
 
 
542 aa  282  9e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  33.58 
 
 
563 aa  282  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  32.36 
 
 
590 aa  279  8e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  32.12 
 
 
573 aa  276  6e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  32.67 
 
 
553 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  30.09 
 
 
608 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  31.64 
 
 
553 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  30.66 
 
 
586 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  31.26 
 
 
615 aa  238  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  32.15 
 
 
621 aa  235  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  29.54 
 
 
604 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.36 
 
 
757 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  29.98 
 
 
590 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1146  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.31 
 
 
697 aa  219  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  29.76 
 
 
586 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2912  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.98 
 
 
557 aa  213  9e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.198106 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4432  ferredoxin--nitrite reductase  29.59 
 
 
607 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  28.68 
 
 
590 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3268  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.13 
 
 
606 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446029  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2637  sulfite reductase (NADPH)  28.54 
 
 
713 aa  207  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2147  sulfite reductase (ferredoxin)  28.46 
 
 
552 aa  206  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0201969  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  28.41 
 
 
595 aa  206  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3346  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  30.13 
 
 
605 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40770  sulfite reductase  28.76 
 
 
552 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74513  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3274  sulfite reductase (ferredoxin)  27.24 
 
 
669 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0798  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.5 
 
 
560 aa  201  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  27.92 
 
 
595 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  28.71 
 
 
494 aa  201  3.9999999999999996e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>