More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2686 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  63.93 
 
 
569 aa  727    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  60.84 
 
 
569 aa  696    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  64.85 
 
 
569 aa  734    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  60.39 
 
 
562 aa  677    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  65.82 
 
 
592 aa  719    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  59.75 
 
 
564 aa  649    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  58.16 
 
 
560 aa  651    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  59.64 
 
 
565 aa  665    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  95.36 
 
 
560 aa  1093    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  58.83 
 
 
581 aa  643    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  80.78 
 
 
563 aa  942    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  68.73 
 
 
570 aa  759    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  59.82 
 
 
570 aa  646    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  69.22 
 
 
560 aa  802    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  79.04 
 
 
590 aa  910    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  95.18 
 
 
560 aa  1092    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  58.84 
 
 
568 aa  665    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  100 
 
 
560 aa  1144    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  58.9 
 
 
571 aa  657    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  57.45 
 
 
550 aa  637    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  63.41 
 
 
556 aa  684    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  77.9 
 
 
573 aa  903    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  58.75 
 
 
581 aa  653    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  57.3 
 
 
556 aa  638    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  60.39 
 
 
573 aa  684    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  95.18 
 
 
560 aa  1092    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  91.79 
 
 
560 aa  1062    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  57.29 
 
 
567 aa  633  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  56.44 
 
 
586 aa  617  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  56.56 
 
 
569 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  38.97 
 
 
521 aa  342  1e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  35.92 
 
 
567 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  35.36 
 
 
540 aa  296  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  35.25 
 
 
589 aa  296  5e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  33.03 
 
 
542 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  36.53 
 
 
551 aa  295  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  33.63 
 
 
540 aa  294  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  34.81 
 
 
540 aa  293  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  34.99 
 
 
540 aa  291  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  35.85 
 
 
541 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  34.99 
 
 
540 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  34.99 
 
 
540 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  34.99 
 
 
540 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  34.99 
 
 
540 aa  291  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  34.43 
 
 
540 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  34.57 
 
 
540 aa  289  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  34.81 
 
 
540 aa  287  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  34.97 
 
 
553 aa  287  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.45 
 
 
591 aa  276  8e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  35.21 
 
 
648 aa  273  8.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  35.25 
 
 
639 aa  270  4e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.35 
 
 
569 aa  270  5.9999999999999995e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  32.94 
 
 
519 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.79 
 
 
793 aa  268  1e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  32.83 
 
 
586 aa  269  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  33.84 
 
 
643 aa  268  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  33.33 
 
 
510 aa  260  4e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  33.65 
 
 
513 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  33.65 
 
 
513 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.29 
 
 
590 aa  257  3e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  32.73 
 
 
591 aa  249  6e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.62 
 
 
592 aa  249  8e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.38 
 
 
603 aa  249  9e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  32.82 
 
 
536 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  33.27 
 
 
516 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  32.11 
 
 
513 aa  243  9e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.57 
 
 
805 aa  239  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  31.35 
 
 
513 aa  238  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  33.33 
 
 
512 aa  236  9e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  32.14 
 
 
521 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  31.63 
 
 
586 aa  233  5e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  30.61 
 
 
542 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  31.18 
 
 
480 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  30.43 
 
 
492 aa  221  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  29.23 
 
 
553 aa  217  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  29.91 
 
 
615 aa  217  5e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  29.23 
 
 
553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  29.94 
 
 
586 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  29.89 
 
 
633 aa  211  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  28.99 
 
 
590 aa  208  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  29.3 
 
 
599 aa  207  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.57 
 
 
545 aa  205  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  30.18 
 
 
548 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  29.25 
 
 
590 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2912  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.74 
 
 
557 aa  193  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.198106 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  30.42 
 
 
586 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  28.18 
 
 
608 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1942  sulfite/nitrite reductase hemoprotein subunit  27.48 
 
 
556 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0593  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  27.48 
 
 
556 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313736  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2371  sulphite reductase hemoprotein, beta subunit  29.65 
 
 
550 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1884  sulfite reductase (ferredoxin)  29.65 
 
 
550 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2689  Sulfite reductase (ferredoxin)  30.83 
 
 
553 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.671477  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1978  sulfite reductase (ferredoxin)  29.65 
 
 
550 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126005  normal  0.0650245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3324  sulfite reductase (ferredoxin)  29.65 
 
 
550 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.74 
 
 
757 aa  187  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2425  sulfite reductase oxidoreductase protein  30.69 
 
 
553 aa  186  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2229  Sulfite reductase (ferredoxin)  31.03 
 
 
553 aa  186  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2513  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.96 
 
 
557 aa  186  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67153  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3112  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.33 
 
 
552 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0338  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  27.46 
 
 
556 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0988225  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>