More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1739 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  63.18 
 
 
550 aa  693    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  65.88 
 
 
569 aa  701    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  62.21 
 
 
568 aa  665    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  66.79 
 
 
592 aa  712    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  60.71 
 
 
563 aa  663    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  62.86 
 
 
564 aa  699    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  67.45 
 
 
560 aa  725    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  61.97 
 
 
586 aa  674    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  65 
 
 
560 aa  734    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  67.03 
 
 
581 aa  725    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  62.59 
 
 
590 aa  677    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  62.19 
 
 
569 aa  654    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  100 
 
 
556 aa  1120    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  67.62 
 
 
562 aa  766    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  64.55 
 
 
565 aa  714    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  63.41 
 
 
560 aa  691    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  68.78 
 
 
570 aa  735    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  65.69 
 
 
569 aa  701    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  62.9 
 
 
560 aa  687    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  65.55 
 
 
567 aa  731    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  67.9 
 
 
571 aa  756    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  63.25 
 
 
560 aa  690    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  59.82 
 
 
556 aa  649    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  69.89 
 
 
569 aa  776    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  60.65 
 
 
573 aa  663    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  66.55 
 
 
581 aa  744    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  66.24 
 
 
570 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  64.48 
 
 
573 aa  695    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  62.9 
 
 
560 aa  687    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  62.17 
 
 
560 aa  681    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  40.84 
 
 
521 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  39.54 
 
 
567 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.96 
 
 
591 aa  330  4e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  36.78 
 
 
540 aa  327  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  37.87 
 
 
586 aa  322  9.999999999999999e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  35.35 
 
 
542 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  36.18 
 
 
540 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  36.08 
 
 
541 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  35.82 
 
 
540 aa  312  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  35.91 
 
 
540 aa  310  5e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  35.64 
 
 
540 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  35.64 
 
 
540 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  35.45 
 
 
540 aa  309  9e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  35.64 
 
 
540 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  35.64 
 
 
540 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  35.64 
 
 
540 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  35.09 
 
 
540 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.5 
 
 
589 aa  301  2e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  36.72 
 
 
586 aa  300  3e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  35.54 
 
 
553 aa  300  5e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  36.76 
 
 
519 aa  300  6e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  36.81 
 
 
591 aa  298  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  36.63 
 
 
643 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.2 
 
 
592 aa  286  5e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.75 
 
 
603 aa  283  7.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  36.35 
 
 
551 aa  282  9e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  36.19 
 
 
648 aa  277  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  35.38 
 
 
805 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  35.96 
 
 
639 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.7 
 
 
793 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  33.86 
 
 
510 aa  263  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  33.78 
 
 
536 aa  260  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  34.29 
 
 
516 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.35 
 
 
569 aa  256  7e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  34.05 
 
 
513 aa  253  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  34.05 
 
 
513 aa  253  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.09 
 
 
590 aa  249  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  31.98 
 
 
553 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  33.2 
 
 
492 aa  246  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  35.29 
 
 
512 aa  246  6.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  33.86 
 
 
521 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  32.11 
 
 
553 aa  243  7e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  32.43 
 
 
513 aa  238  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  32.56 
 
 
513 aa  235  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  31.55 
 
 
542 aa  227  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  33.76 
 
 
599 aa  227  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  34.24 
 
 
615 aa  226  6e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  30.55 
 
 
586 aa  214  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  32.25 
 
 
621 aa  210  5e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  30.98 
 
 
633 aa  209  7e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  29.67 
 
 
590 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  28.13 
 
 
590 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  30.15 
 
 
608 aa  199  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  27.82 
 
 
545 aa  198  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  28.63 
 
 
480 aa  196  8.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  31.14 
 
 
605 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.17 
 
 
757 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1942  sulfite/nitrite reductase hemoprotein subunit  28.74 
 
 
556 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0593  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  28.54 
 
 
556 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313736  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  31.65 
 
 
595 aa  192  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  29.74 
 
 
548 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  29.05 
 
 
601 aa  190  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2371  sulphite reductase hemoprotein, beta subunit  28.95 
 
 
550 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2912  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.28 
 
 
557 aa  188  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.198106 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1884  sulfite reductase (ferredoxin)  29.18 
 
 
550 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  30.38 
 
 
596 aa  188  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2513  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.18 
 
 
557 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67153  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3324  sulfite reductase (ferredoxin)  28.95 
 
 
550 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1264  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.37 
 
 
551 aa  188  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.657041  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3112  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.83 
 
 
552 aa  187  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>