More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2771 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  60.07 
 
 		 568 aa  669    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  58.97 
 
 		 560 aa  660    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  63.87 
 
 		 569 aa  736    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  77.5 
 
 		 563 aa  904    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  57.92 
 
 		 564 aa  651    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  76.99 
 
 		 560 aa  908    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  58.15 
 
 		 570 aa  638    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  63.32 
 
 		 569 aa  724    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  56.57 
 
 		 567 aa  639    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  78.61 
 
 		 560 aa  916    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  59.11 
 
 		 562 aa  667    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  63 
 
 		 592 aa  688    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  60.61 
 
 		 556 aa  655    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  57.45 
 
 		 550 aa  637    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  59.93 
 
 		 569 aa  699    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  56.81 
 
 		 571 aa  654    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  67.51 
 
 		 570 aa  750    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  57.57 
 
 		 581 aa  649    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  56.77 
 
 		 565 aa  641    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  78.43 
 
 		 560 aa  915    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  77.35 
 
 		 560 aa  913    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  78.98 
 
 		 590 aa  960    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  69.35 
 
 		 560 aa  801    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  57.31 
 
 		 581 aa  669    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  100 
 
 		 573 aa  1172    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  62.14 
 
 		 573 aa  686    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  78.43 
 
 		 560 aa  915    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  56.59 
 
 		 556 aa  621  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  57.19 
 
 		 569 aa  617  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  53.67 
 
 		 586 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  37.74 
 
 		 521 aa  333  6e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  35.67 
 
 		 540 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  34.57 
 
 		 540 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  35.54 
 
 		 567 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  34.57 
 
 		 540 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  34.57 
 
 		 540 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  34.38 
 
 		 540 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  34.57 
 
 		 540 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  34.57 
 
 		 540 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  34.57 
 
 		 540 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  34.2 
 
 		 540 aa  302  9e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  34.2 
 
 		 540 aa  300  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  34.29 
 
 		 541 aa  300  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  34.38 
 
 		 540 aa  300  6e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.92 
 
 		 591 aa  282  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  33.71 
 
 		 586 aa  281  2e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.62 
 
 		 589 aa  281  3e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  32.65 
 
 		 643 aa  280  7e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.76 
 
 		 569 aa  278  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  32.12 
 
 		 542 aa  276  8e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  31.56 
 
 		 553 aa  273  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  33.93 
 
 		 551 aa  272  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  33.4 
 
 		 648 aa  264  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  32.57 
 
 		 639 aa  261  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  32.07 
 
 		 510 aa  254  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  31.26 
 
 		 519 aa  251  3e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.85 
 
 		 590 aa  249  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  31.82 
 
 		 513 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  31.82 
 
 		 513 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  33.58 
 
 		 591 aa  244  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  31.55 
 
 		 536 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.37 
 
 		 793 aa  243  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.11 
 
 		 603 aa  242  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.43 
 
 		 805 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  31.18 
 
 		 521 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  31.67 
 
 		 512 aa  238  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  30.58 
 
 		 516 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.33 
 
 		 592 aa  234  5e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  30.3 
 
 		 586 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  28.52 
 
 		 513 aa  227  4e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  29.11 
 
 		 492 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  28.6 
 
 		 513 aa  223  6e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  27.49 
 
 		 553 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  27.49 
 
 		 553 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  28.38 
 
 		 542 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  28.41 
 
 		 633 aa  202  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  28.52 
 
 		 590 aa  200  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  29.83 
 
 		 599 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  27.74 
 
 		 480 aa  197  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  29.11 
 
 		 586 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.07 
 
 		 757 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  27.55 
 
 		 590 aa  195  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2689  Sulfite reductase (ferredoxin)  31.17 
 
 		 553 aa  194  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.671477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2513  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.22 
 
 		 557 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67153  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  28.11 
 
 		 615 aa  192  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2229  Sulfite reductase (ferredoxin)  31.38 
 
 		 553 aa  192  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10550  putative sulfite or nitrite reductas  29.9 
 
 		 557 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  29.75 
 
 		 621 aa  190  5.999999999999999e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  28.6 
 
 		 545 aa  189  8e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  27.32 
 
 		 586 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0962  sulfite or nitrite reductase  29.31 
 
 		 557 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2816  sulfite reductase (NADPH) subunit beta  28.63 
 
 		 560 aa  187  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2371  sulphite reductase hemoprotein, beta subunit  28.51 
 
 		 550 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2425  sulfite reductase oxidoreductase protein  29.58 
 
 		 553 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  28.99 
 
 		 605 aa  183  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1264  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  27.79 
 
 		 551 aa  183  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.657041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2912  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.07 
 
 		 557 aa  183  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.198106 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1884  sulfite reductase (ferredoxin)  28.11 
 
 		 550 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3324  sulfite reductase (ferredoxin)  28.51 
 
 		 550 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  27.55 
 
 		 548 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>