More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1888 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  60.28 
 
 		 560 aa  674    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  62.41 
 
 		 586 aa  708    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  72.27 
 
 		 560 aa  849    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  67.19 
 
 		 569 aa  787    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  60.7 
 
 		 567 aa  693    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  65.15 
 
 		 556 aa  754    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  59.38 
 
 		 590 aa  671    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  64.74 
 
 		 570 aa  693    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  100 
 
 		 564 aa  1153    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  64.31 
 
 		 560 aa  730    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  59.4 
 
 		 560 aa  665    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  59.75 
 
 		 560 aa  673    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  76.11 
 
 		 562 aa  892    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  63.46 
 
 		 569 aa  711    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  61.2 
 
 		 571 aa  697    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  62.86 
 
 		 556 aa  709    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  64.05 
 
 		 569 aa  716    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  77.17 
 
 		 565 aa  922    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  73.82 
 
 		 550 aa  844    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  60.28 
 
 		 560 aa  674    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  59.61 
 
 		 563 aa  655    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  58.15 
 
 		 581 aa  663    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  66.36 
 
 		 592 aa  718    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  60.28 
 
 		 560 aa  674    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  63.69 
 
 		 569 aa  713    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  58.14 
 
 		 573 aa  665    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  58.46 
 
 		 581 aa  680    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  63.19 
 
 		 568 aa  703    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  61.36 
 
 		 573 aa  695    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  57.98 
 
 		 570 aa  632  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  39.85 
 
 		 540 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  39.17 
 
 		 586 aa  367  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  38.52 
 
 		 567 aa  349  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.39 
 
 		 591 aa  348  2e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  38.52 
 
 		 540 aa  346  7e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  38.33 
 
 		 540 aa  345  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  38.15 
 
 		 540 aa  343  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  38.15 
 
 		 540 aa  343  7e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  38.15 
 
 		 540 aa  343  7e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  38.15 
 
 		 540 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  38.15 
 
 		 540 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  37.78 
 
 		 540 aa  340  5e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  37.78 
 
 		 540 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  37.66 
 
 		 540 aa  339  7e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  39.02 
 
 		 541 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  38.49 
 
 		 592 aa  339  9.999999999999999e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  38.46 
 
 		 521 aa  335  1e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  35.11 
 
 		 542 aa  332  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  35.83 
 
 		 519 aa  330  4e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  37.73 
 
 		 591 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  37.04 
 
 		 551 aa  324  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.25 
 
 		 589 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  36.84 
 
 		 643 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.86 
 
 		 569 aa  306  7e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  34.75 
 
 		 553 aa  305  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.81 
 
 		 603 aa  298  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  35.19 
 
 		 639 aa  295  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  34.82 
 
 		 586 aa  294  2e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  34.68 
 
 		 510 aa  294  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  35.44 
 
 		 513 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  35.44 
 
 		 513 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.29 
 
 		 805 aa  289  9e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  36.17 
 
 		 536 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  34.42 
 
 		 648 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  36.27 
 
 		 516 aa  283  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  35.15 
 
 		 521 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  35.33 
 
 		 512 aa  274  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  34.52 
 
 		 492 aa  271  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.82 
 
 		 793 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.25 
 
 		 590 aa  264  3e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  32.6 
 
 		 553 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  32.39 
 
 		 553 aa  261  3e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  32.86 
 
 		 513 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  31.81 
 
 		 513 aa  244  3.9999999999999997e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  35.31 
 
 		 599 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  31.08 
 
 		 542 aa  240  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  31.07 
 
 		 480 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  30.7 
 
 		 586 aa  223  9e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  29.85 
 
 		 633 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  31.07 
 
 		 590 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.43 
 
 		 757 aa  216  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  29.65 
 
 		 615 aa  215  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  29.98 
 
 		 621 aa  213  7.999999999999999e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  28.32 
 
 		 590 aa  212  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  30.65 
 
 		 586 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  30.56 
 
 		 604 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1146  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.03 
 
 		 697 aa  200  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  30.32 
 
 		 605 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  27.22 
 
 		 608 aa  199  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  30.32 
 
 		 596 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  30.11 
 
 		 601 aa  195  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  30.93 
 
 		 595 aa  193  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  31 
 
 		 595 aa  192  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3268  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.16 
 
 		 606 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446029  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  28.72 
 
 		 545 aa  192  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2147  sulfite reductase (ferredoxin)  27.59 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0201969  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  29.68 
 
 		 596 aa  191  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  29.94 
 
 		 548 aa  189  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2513  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.71 
 
 		 557 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67153  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2371  sulphite reductase hemoprotein, beta subunit  28.2 
 
 		 550 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>