More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3747 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  63.99 
 
 		 590 aa  749    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  82.11 
 
 		 596 aa  1015    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  81.43 
 
 		 601 aa  1007    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  81.6 
 
 		 596 aa  1008    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  100 
 
 		 595 aa  1205    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  62.39 
 
 		 586 aa  731    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  62.01 
 
 		 586 aa  711    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  57.97 
 
 		 590 aa  701    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  64.24 
 
 		 604 aa  759    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  81.85 
 
 		 605 aa  974    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  92.61 
 
 		 595 aa  1099    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  49.67 
 
 		 615 aa  558  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  46.36 
 
 		 608 aa  505  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  46.32 
 
 		 599 aa  500  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  39.21 
 
 		 732 aa  349  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  39.34 
 
 		 494 aa  345  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  35.85 
 
 		 512 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  34.39 
 
 		 510 aa  269  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  35.23 
 
 		 513 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  35.23 
 
 		 513 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  35.1 
 
 		 521 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  33.68 
 
 		 516 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  33.8 
 
 		 536 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  34.03 
 
 		 513 aa  256  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  32.96 
 
 		 542 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  33.14 
 
 		 521 aa  250  6e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  31.17 
 
 		 553 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  33.4 
 
 		 553 aa  248  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  30.98 
 
 		 553 aa  247  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  30.6 
 
 		 540 aa  246  6e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  32.31 
 
 		 513 aa  246  6.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  32.7 
 
 		 567 aa  243  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  31.92 
 
 		 541 aa  243  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  29.85 
 
 		 540 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  29.66 
 
 		 540 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  29.85 
 
 		 540 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  29.85 
 
 		 540 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  29.85 
 
 		 540 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  29.85 
 
 		 540 aa  233  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  29.66 
 
 		 540 aa  234  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  30.15 
 
 		 643 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  32.59 
 
 		 492 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  29.66 
 
 		 540 aa  231  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  29.66 
 
 		 540 aa  230  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  29.72 
 
 		 540 aa  229  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.26 
 
 		 562 aa  225  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.91 
 
 		 550 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  30.6 
 
 		 586 aa  221  3e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  32.5 
 
 		 648 aa  221  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  33.69 
 
 		 560 aa  220  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  32.32 
 
 		 621 aa  217  5.9999999999999996e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  31.27 
 
 		 639 aa  216  8e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  31.75 
 
 		 567 aa  214  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  29.69 
 
 		 633 aa  211  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  34.12 
 
 		 568 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  34.12 
 
 		 560 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  28.41 
 
 		 542 aa  207  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  26.48 
 
 		 519 aa  207  7e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  28.86 
 
 		 586 aa  206  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.61 
 
 		 565 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.58 
 
 		 592 aa  204  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.57 
 
 		 589 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.2 
 
 		 556 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.91 
 
 		 591 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  30.13 
 
 		 591 aa  201  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  30.04 
 
 		 551 aa  201  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  33.26 
 
 		 569 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  31.65 
 
 		 569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  32.23 
 
 		 586 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  34 
 
 		 570 aa  198  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  32.43 
 
 		 569 aa  196  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  32.2 
 
 		 569 aa  195  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  26.21 
 
 		 480 aa  194  5e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  30.08 
 
 		 573 aa  190  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.6 
 
 		 603 aa  189  8e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.04 
 
 		 590 aa  189  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.95 
 
 		 569 aa  189  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  30.02 
 
 		 556 aa  188  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  32.02 
 
 		 570 aa  187  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3268  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.32 
 
 		 606 aa  187  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446029  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  32.85 
 
 		 571 aa  186  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.23 
 
 		 757 aa  184  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  29.65 
 
 		 590 aa  182  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  32.84 
 
 		 476 aa  180  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  27.78 
 
 		 487 aa  180  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  31 
 
 		 564 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  29.62 
 
 		 573 aa  179  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3604  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.42 
 
 		 614 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387306  normal  0.13043 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  30.65 
 
 		 581 aa  177  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0962  sulfite or nitrite reductase  28.68 
 
 		 557 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10550  putative sulfite or nitrite reductas  28.68 
 
 		 557 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2513  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.13 
 
 		 557 aa  174  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67153  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  29.93 
 
 		 581 aa  173  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  29.35 
 
 		 560 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  28.52 
 
 		 563 aa  171  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  28.04 
 
 		 560 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  28.04 
 
 		 560 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.96 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2912  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.24 
 
 		 557 aa  170  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.198106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  28.04 
 
 		 560 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>