More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2866 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  100 
 
 
732 aa  1506    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  57.68 
 
 
494 aa  568  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  38.96 
 
 
595 aa  355  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  39.21 
 
 
595 aa  349  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  38.61 
 
 
586 aa  347  7e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  38.37 
 
 
596 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  38.59 
 
 
605 aa  342  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  38.29 
 
 
590 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  37.85 
 
 
596 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  37.3 
 
 
604 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  37.65 
 
 
601 aa  337  7e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  37.62 
 
 
615 aa  331  4e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  36.88 
 
 
590 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  38.48 
 
 
599 aa  325  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  36.71 
 
 
586 aa  325  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  36.47 
 
 
608 aa  320  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  69.71 
 
 
208 aa  305  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0122  precorrin-8X methylmutase  78.85 
 
 
209 aa  304  4.0000000000000003e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  69.23 
 
 
208 aa  303  5.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  70.67 
 
 
208 aa  301  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  70.67 
 
 
208 aa  301  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  68.75 
 
 
208 aa  301  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4823  precorrin-8X methylmutase  73.56 
 
 
208 aa  295  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183427 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1591  precorrin-8X methylmutase  73.56 
 
 
208 aa  293  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257981 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1646  precorrin-8X methylmutase  73.56 
 
 
208 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.996028  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1193  precorrin-8X methylmutase  73.56 
 
 
208 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0208289  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1673  precorrin-8X methylmutase  73.56 
 
 
208 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0355413  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  73.08 
 
 
208 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0605  precorrin-8X methylmutase  73.56 
 
 
208 aa  288  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.414575  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  67.31 
 
 
208 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1244  precorrin-8X methylmutase  72.12 
 
 
208 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0926514  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3144  precorrin-8X methylmutase  71.15 
 
 
212 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2399  precorrin-8X methylmutase  71.15 
 
 
208 aa  281  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4572  precorrin-8X methylmutase  70.67 
 
 
208 aa  280  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4618  precorrin-8X methylmutase  71.15 
 
 
208 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4884  precorrin-8X methylmutase  71.15 
 
 
208 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4828  precorrin-8X methylmutase  71.15 
 
 
208 aa  277  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.504707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4706  precorrin-8X methylmutase  71.15 
 
 
208 aa  277  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1852  precorrin-8X methylmutase  69.71 
 
 
209 aa  275  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.334862  normal  0.809538 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1670  precorrin-8X methylmutase  70.19 
 
 
209 aa  274  6e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793368  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5370  precorrin-8X methylmutase  72.12 
 
 
208 aa  270  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218381  normal  0.626073 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1569  precorrin-8X methylmutase  71.63 
 
 
208 aa  269  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0892973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  61.54 
 
 
208 aa  268  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  66.02 
 
 
230 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2112  precorrin-8X methylmutase  72.12 
 
 
208 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.937061  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2991  precorrin-8X methylmutase  65.87 
 
 
208 aa  265  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1949  precorrin-8X methylmutase  72.12 
 
 
208 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1966  precorrin-8X methylmutase  72.12 
 
 
208 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000701969  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1162  precorrin-8X methylmutase  72.12 
 
 
208 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00824413  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0265  precorrin-8X methylmutase  72.12 
 
 
208 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.187916  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1603  precorrin-8X methylmutase  72.12 
 
 
208 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559116  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0895  precorrin-8X methylmutase  72.12 
 
 
208 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.182747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26500  precorrin-8X methylmutase  73.08 
 
 
208 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00589849  normal  0.995121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2249  precorrin-8X methylmutase  73.08 
 
 
208 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0575  Precorrin-8X methylmutase  62.02 
 
 
206 aa  258  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  31.8 
 
 
487 aa  258  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1520  precorrin-8X methylmutase  61.46 
 
 
219 aa  253  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  63.11 
 
 
209 aa  251  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3146  precorrin-8X methylmutase  62.02 
 
 
210 aa  250  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  58.3 
 
 
224 aa  250  8e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0172  precorrin-8X methylmutase  63.59 
 
 
512 aa  246  6.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00890226  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2493  precorrin-8X methylmutase  65.4 
 
 
213 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  62.14 
 
 
209 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  62.14 
 
 
209 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3284  precorrin-8X methylmutase  63.86 
 
 
211 aa  242  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174863  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  60.95 
 
 
221 aa  239  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  59.51 
 
 
210 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2639  precorrin isomerase  62.93 
 
 
499 aa  238  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0523957  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  60.49 
 
 
210 aa  238  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2212  precorrin-8X methylmutase  60.77 
 
 
209 aa  238  4e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1437  precorrin-8X methylmutase  62.62 
 
 
210 aa  238  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1434  Precorrin-8X methylmutase  63.11 
 
 
210 aa  238  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  62.14 
 
 
210 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  62.62 
 
 
209 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2440  precorrin-8X methylmutase  62.83 
 
 
210 aa  237  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal  0.0714057 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  59.51 
 
 
210 aa  237  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0802  Precorrin-8X methylmutase  64.8 
 
 
217 aa  237  7e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.172339  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5850  precorrin-8X methylmutase  58.74 
 
 
209 aa  230  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2534  precorrin-8X methylmutase  59.81 
 
 
209 aa  229  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474036  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3430  precorrin-8X methylmutase  57.69 
 
 
208 aa  226  9e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193703  normal  0.583558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2151  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  63.59 
 
 
210 aa  226  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108715  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0340  precorrin-8X methylmutase  62.14 
 
 
209 aa  226  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2480  Precorrin-8X methylmutase  60 
 
 
208 aa  224  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182678  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3105  precorrin-8X methylmutase  59.13 
 
 
208 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.575803  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  29.81 
 
 
510 aa  220  7.999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2191  Precorrin-8X methylmutase  60 
 
 
211 aa  220  8.999999999999998e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  54.29 
 
 
220 aa  219  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2525  precorrin-8X methylmutase  59.62 
 
 
208 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345603  normal  0.182328 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2533  precorrin-8X methylmutase  59.62 
 
 
208 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.466209  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  30.66 
 
 
521 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2488  precorrin-8X methylmutase  59.62 
 
 
208 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5691  Precorrin-8X methylmutase  62.14 
 
 
210 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1888  precorrin-8X methylmutase  60.73 
 
 
209 aa  218  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  29.96 
 
 
513 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6217  precorrin-8X methylmutase  61.17 
 
 
209 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0665101  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  29.96 
 
 
513 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1469  precorrin-8X methylmutase  61.17 
 
 
209 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3266  Precorrin-8X methylmutase  61.17 
 
 
215 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0444754 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1519  precorrin-8X methylmutase  60.68 
 
 
209 aa  212  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.023292 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1625  Precorrin-8X methylmutase  55.09 
 
 
221 aa  211  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.823307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>