187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3429 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 372 aa  722    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  78.76 
 
 		 372 aa  566  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2489  precorrin-3B synthase  70.92 
 
 		 373 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2534  precorrin-3B synthase  70.92 
 
 		 373 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.35067  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2526  precorrin-3B synthase  70.92 
 
 		 373 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12100  cobalamin biosynthesis protein cobG  64.58 
 
 		 363 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00940846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  49.6 
 
 		 378 aa  304  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0576  precorrin-3B synthase  51.06 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.244524  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2494  nitrite/sulfite reductase hemoprotein subnit beta ferrodoxin domain-containing protein  47.18 
 
 		 367 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  42.5 
 
 		 473 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  40.68 
 
 		 439 aa  236  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2192  precorrin-3B synthase  44.5 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1519  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  40.82 
 
 		 481 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  42.97 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1783  hypothetical protein  41.33 
 
 		 345 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17650  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  44.1 
 
 		 292 aa  170  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220438  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2894  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  38.35 
 
 		 282 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.804468  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1626  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  39.51 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.470677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.84 
 
 		 432 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  32.83 
 
 		 464 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  33.33 
 
 		 483 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  30.51 
 
 		 430 aa  109  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  27.31 
 
 		 732 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  33.86 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  33.06 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  31.76 
 
 		 447 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  25.86 
 
 		 494 aa  102  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  29.11 
 
 		 439 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  30.56 
 
 		 465 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  29.28 
 
 		 424 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3411  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  39.62 
 
 		 207 aa  99.4  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  31.11 
 
 		 386 aa  96.3  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  28.4 
 
 		 608 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  31.83 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  29.87 
 
 		 431 aa  94.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  31.79 
 
 		 479 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  32.35 
 
 		 443 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  32.01 
 
 		 434 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  29.59 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  29.95 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0341  precorrin-3B synthase  29.97 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  29.71 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  34.93 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  25.74 
 
 		 599 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  31 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  27.75 
 
 		 595 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  26.17 
 
 		 586 aa  79.7  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  27.66 
 
 		 595 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  27.81 
 
 		 596 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  27.95 
 
 		 596 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  27.07 
 
 		 601 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  26.78 
 
 		 590 aa  75.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  25 
 
 		 615 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  27 
 
 		 605 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  41.94 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  24.48 
 
 		 521 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  41.94 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  42 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  38.69 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.88 
 
 		 568 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  33.93 
 
 		 456 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  25.65 
 
 		 513 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  25.65 
 
 		 513 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  39.68 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  41.01 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  40.29 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  26.03 
 
 		 604 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  38.78 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  38.78 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  38.89 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  38.89 
 
 		 516 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  38.78 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  38.78 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  38.78 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  38.78 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  38.78 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  26.93 
 
 		 569 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  27.15 
 
 		 443 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  27.94 
 
 		 586 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  29.02 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  38.26 
 
 		 507 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.87 
 
 		 570 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.68 
 
 		 573 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  32.56 
 
 		 512 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  25 
 
 		 569 aa  60.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  20.65 
 
 		 621 aa  59.7  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3285  precorrin-3B synthase  29.33 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  23.91 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  26.61 
 
 		 590 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  26.72 
 
 		 560 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  20.05 
 
 		 541 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  23.86 
 
 		 581 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  22.62 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  23.08 
 
 		 510 aa  57  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.02 
 
 		 793 aa  57  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  32.73 
 
 		 486 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1969  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.46 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000637611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  23.94 
 
 		 571 aa  56.2  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  23.86 
 
 		 573 aa  56.2  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  26.28 
 
 		 460 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.104242 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>