More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2398 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  88.59 
 
 
482 aa  634    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  87.76 
 
 
482 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  100 
 
 
479 aa  911    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  88.38 
 
 
482 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  88.38 
 
 
482 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  88.38 
 
 
482 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  88.38 
 
 
482 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  87.97 
 
 
482 aa  631  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  54.26 
 
 
507 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  61.59 
 
 
478 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  58.09 
 
 
483 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  59.26 
 
 
454 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  59.62 
 
 
463 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  52.88 
 
 
510 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  60.13 
 
 
482 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  59.4 
 
 
482 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  59.4 
 
 
516 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  48.68 
 
 
476 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  48.52 
 
 
465 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  46.09 
 
 
432 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  46.65 
 
 
447 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  47.24 
 
 
438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  49.78 
 
 
456 aa  312  9e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  50.65 
 
 
486 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  45.61 
 
 
443 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  46.8 
 
 
443 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  46.61 
 
 
469 aa  300  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  45.51 
 
 
443 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  38.91 
 
 
439 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  40.39 
 
 
431 aa  248  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  39.56 
 
 
409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  30.53 
 
 
494 aa  204  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  31.57 
 
 
732 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  31.75 
 
 
615 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  31.84 
 
 
586 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  31.18 
 
 
590 aa  162  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  30.36 
 
 
604 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  26.62 
 
 
487 aa  159  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  29.54 
 
 
586 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  29.71 
 
 
608 aa  151  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  29.32 
 
 
590 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  29.95 
 
 
595 aa  150  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  29.72 
 
 
595 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  29.14 
 
 
605 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  33.41 
 
 
424 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  28.88 
 
 
596 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  29.12 
 
 
596 aa  136  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  29.12 
 
 
601 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  29.81 
 
 
599 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  28.64 
 
 
439 aa  127  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  33.33 
 
 
464 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  31.26 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  25.87 
 
 
513 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  25.87 
 
 
513 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  25.93 
 
 
536 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  26.17 
 
 
542 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  25.43 
 
 
510 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12100  cobalamin biosynthesis protein cobG  31.72 
 
 
363 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00940846  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  27.36 
 
 
567 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  24.95 
 
 
516 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  26.9 
 
 
512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  31.44 
 
 
430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  26.86 
 
 
492 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  26.45 
 
 
521 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.55 
 
 
805 aa  106  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  35.92 
 
 
473 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  25.85 
 
 
633 aa  106  9e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  26.09 
 
 
513 aa  106  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  25 
 
 
551 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  22.44 
 
 
540 aa  101  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  32.27 
 
 
449 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  25.53 
 
 
542 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  21.2 
 
 
480 aa  100  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  33.41 
 
 
423 aa  100  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  24.6 
 
 
621 aa  99.8  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  22.03 
 
 
540 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  21.77 
 
 
540 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  22.03 
 
 
540 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  23.23 
 
 
540 aa  99  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  22.03 
 
 
540 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  22.03 
 
 
540 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  21.77 
 
 
540 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  27.48 
 
 
443 aa  97.8  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  21.77 
 
 
540 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  22.46 
 
 
553 aa  97.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  21.52 
 
 
540 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  32.71 
 
 
428 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  22.42 
 
 
540 aa  94  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  22.22 
 
 
553 aa  93.6  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  29.5 
 
 
460 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  29.79 
 
 
378 aa  93.2  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.2 
 
 
567 aa  93.2  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.94 
 
 
793 aa  93.2  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  29.65 
 
 
380 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  23.36 
 
 
560 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  26.13 
 
 
569 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  25.93 
 
 
521 aa  91.7  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  30.99 
 
 
428 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  25.18 
 
 
571 aa  90.1  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  24.39 
 
 
513 aa  89  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>