264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0576 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0576  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 389 aa  723    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.244524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  52.01 
 
 		 473 aa  302  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  51.44 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2494  nitrite/sulfite reductase hemoprotein subnit beta ferrodoxin domain-containing protein  52.08 
 
 		 367 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  50.52 
 
 		 372 aa  279  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1519  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  46.91 
 
 		 481 aa  277  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12100  cobalamin biosynthesis protein cobG  50.8 
 
 		 363 aa  260  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00940846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2526  precorrin-3B synthase  49.87 
 
 		 373 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2489  precorrin-3B synthase  49.87 
 
 		 373 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2534  precorrin-3B synthase  49.87 
 
 		 373 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.35067  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  44.18 
 
 		 378 aa  230  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1783  hypothetical protein  45.48 
 
 		 345 aa  219  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  37.77 
 
 		 439 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  43.92 
 
 		 408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2192  precorrin-3B synthase  45.14 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17650  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  45.73 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220438  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1626  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  40.08 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.470677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2894  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  38.41 
 
 		 282 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.804468  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  30.81 
 
 		 430 aa  122  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  25.17 
 
 		 732 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  25 
 
 		 494 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  31.73 
 
 		 469 aa  110  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  32.59 
 
 		 456 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  31.59 
 
 		 431 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.88 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  25.61 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  29.5 
 
 		 439 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  32.84 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  26.92 
 
 		 615 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  31.35 
 
 		 409 aa  101  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  32.73 
 
 		 438 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  32.73 
 
 		 443 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  32.52 
 
 		 483 aa  99.4  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  32.17 
 
 		 486 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  30.98 
 
 		 465 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  30.33 
 
 		 424 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  32.56 
 
 		 443 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  31.78 
 
 		 447 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  32.15 
 
 		 423 aa  94  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  27.41 
 
 		 599 aa  92.8  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  32.99 
 
 		 443 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  25.74 
 
 		 608 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  24.38 
 
 		 510 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3411  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  35.89 
 
 		 207 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  32.61 
 
 		 464 aa  90.5  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  30.68 
 
 		 478 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  26.23 
 
 		 621 aa  88.6  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 479 aa  88.6  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  33.85 
 
 		 434 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  27.27 
 
 		 521 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  25.85 
 
 		 604 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  25.45 
 
 		 586 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  26.1 
 
 		 590 aa  86.7  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.75 
 
 		 805 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  27.84 
 
 		 521 aa  84.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  27.06 
 
 		 639 aa  84  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  33.64 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  33.41 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  29.37 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  33.72 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.65 
 
 		 793 aa  83.2  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  26.7 
 
 		 512 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  22.77 
 
 		 542 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  33.41 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  33.41 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  33.41 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  33.41 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  25.78 
 
 		 513 aa  80.5  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  23.91 
 
 		 536 aa  79.7  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  24.94 
 
 		 586 aa  79.7  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  22.42 
 
 		 513 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  22.42 
 
 		 513 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  20.89 
 
 		 480 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  25.71 
 
 		 605 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  24.62 
 
 		 590 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  26.34 
 
 		 633 aa  78.2  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  26.7 
 
 		 581 aa  76.3  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.45 
 
 		 581 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  24.1 
 
 		 541 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  23.81 
 
 		 516 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  25.82 
 
 		 595 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  26.92 
 
 		 601 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  30.73 
 
 		 380 aa  72.8  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  24.94 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  26.02 
 
 		 553 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  26.74 
 
 		 596 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  26.67 
 
 		 596 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  40 
 
 		 510 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  28 
 
 		 648 aa  70.5  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  23.95 
 
 		 586 aa  69.7  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  36.7 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  24.2 
 
 		 513 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  36.7 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  34.93 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  34.93 
 
 		 516 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  39.64 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  24.16 
 
 		 595 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  26.08 
 
 		 571 aa  66.2  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2439  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  32.05 
 
 		 423 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341511  normal  0.0829631 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  26.77 
 
 		 443 aa  66.2  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>