More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5369 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  76.82 
 
 		 510 aa  735    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 507 aa  1004    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  53.69 
 
 		 465 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  54.58 
 
 		 479 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  52.95 
 
 		 482 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  53.56 
 
 		 482 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  53.56 
 
 		 482 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  53.56 
 
 		 482 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  53.56 
 
 		 482 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  53.56 
 
 		 482 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  53.16 
 
 		 482 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  47.76 
 
 		 476 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  50.31 
 
 		 456 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  51.65 
 
 		 463 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  46.11 
 
 		 432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  47.06 
 
 		 483 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  50.21 
 
 		 478 aa  352  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  49.59 
 
 		 454 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  50.72 
 
 		 486 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  47.05 
 
 		 447 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  49.68 
 
 		 482 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  49.68 
 
 		 516 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  43.35 
 
 		 443 aa  316  7e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  43.69 
 
 		 438 aa  316  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  43.69 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  49.68 
 
 		 482 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  47.01 
 
 		 469 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  42.57 
 
 		 443 aa  299  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  39.92 
 
 		 431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  39.08 
 
 		 409 aa  259  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  37.24 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  29.45 
 
 		 494 aa  199  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  28.38 
 
 		 732 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  29.82 
 
 		 615 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  28.2 
 
 		 586 aa  173  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  30.22 
 
 		 599 aa  162  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  26.99 
 
 		 590 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  27.22 
 
 		 595 aa  148  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  27.85 
 
 		 595 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  27.05 
 
 		 605 aa  144  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  26.15 
 
 		 604 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  27.69 
 
 		 608 aa  140  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  26.23 
 
 		 487 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  26.54 
 
 		 596 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  26.54 
 
 		 596 aa  139  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  26.54 
 
 		 601 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  26.09 
 
 		 586 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  26.63 
 
 		 590 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  26.68 
 
 		 567 aa  123  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  29.28 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  30.58 
 
 		 423 aa  121  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  28.1 
 
 		 424 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  24.26 
 
 		 510 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  23.96 
 
 		 521 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  24.41 
 
 		 542 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  24 
 
 		 536 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  25.88 
 
 		 512 aa  107  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  26.43 
 
 		 439 aa  106  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  22.97 
 
 		 540 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  30.32 
 
 		 408 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  24.59 
 
 		 513 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  23.04 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  22.56 
 
 		 540 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  22.56 
 
 		 540 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  22.74 
 
 		 540 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  22.74 
 
 		 540 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  22.63 
 
 		 540 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  22.56 
 
 		 540 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  22.63 
 
 		 540 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  22.66 
 
 		 540 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  22.48 
 
 		 540 aa  103  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.7 
 
 		 793 aa  103  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  28.73 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  29.56 
 
 		 372 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  24.21 
 
 		 633 aa  101  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  23.65 
 
 		 513 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  21.69 
 
 		 540 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  23.65 
 
 		 513 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  23.89 
 
 		 571 aa  97.8  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  24.88 
 
 		 542 aa  97.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.11 
 
 		 805 aa  97.4  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  22.1 
 
 		 519 aa  97.1  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  26.53 
 
 		 639 aa  97.1  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  24.42 
 
 		 513 aa  95.5  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  23.49 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.32 
 
 		 562 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  24.51 
 
 		 621 aa  92.8  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.84 
 
 		 569 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.37 
 
 		 592 aa  91.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  24.32 
 
 		 569 aa  91.3  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  35 
 
 		 473 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  23.49 
 
 		 560 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2051  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.4 
 
 		 720 aa  90.1  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.773496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.68 
 
 		 570 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  24.2 
 
 		 569 aa  89  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.52 
 
 		 567 aa  87.8  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  19.63 
 
 		 480 aa  87.8  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  23.11 
 
 		 586 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.81 
 
 		 550 aa  86.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  22.77 
 
 		 643 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>