191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3145 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  100 
 
 		 424 aa  832    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  37.97 
 
 		 430 aa  215  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  37.53 
 
 		 423 aa  171  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  35.05 
 
 		 380 aa  168  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1435  precorrin-3B synthase  34.85 
 
 		 437 aa  167  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.592884  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  36.18 
 
 		 428 aa  166  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  35.4 
 
 		 428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  37.71 
 
 		 434 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  35.79 
 
 		 464 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  37.53 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  34.24 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  26.86 
 
 		 494 aa  146  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  32.68 
 
 		 443 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  32.33 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  34.31 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0341  precorrin-3B synthase  35.79 
 
 		 381 aa  137  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  26.39 
 
 		 732 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  33.09 
 
 		 454 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  30.34 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2150  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  32.14 
 
 		 478 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  32.66 
 
 		 438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  32.91 
 
 		 443 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  33.67 
 
 		 460 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  31.65 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  33.83 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.46 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  33.57 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  33.65 
 
 		 482 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  33.65 
 
 		 516 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  31.82 
 
 		 443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  32.41 
 
 		 443 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6019  precorrin-3B synthase  34.25 
 
 		 452 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0172666  normal  0.33411 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  33.17 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  29.07 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3285  precorrin-3B synthase  31.31 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  32.2 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  27.34 
 
 		 604 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  31.33 
 
 		 447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  30.73 
 
 		 476 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  28.32 
 
 		 507 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  28.97 
 
 		 409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  29.56 
 
 		 439 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  28.14 
 
 		 586 aa  109  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2439  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  34.56 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341511  normal  0.0829631 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  25.89 
 
 		 487 aa  107  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1626  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  40.19 
 
 		 335 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.470677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  26.73 
 
 		 595 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  33.41 
 
 		 479 aa  103  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  26.21 
 
 		 608 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  27.39 
 
 		 599 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  25.74 
 
 		 595 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  25 
 
 		 596 aa  101  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  29.98 
 
 		 372 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12100  cobalamin biosynthesis protein cobG  28.75 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00940846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  25.12 
 
 		 605 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  30.02 
 
 		 456 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  22.93 
 
 		 480 aa  98.2  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  27 
 
 		 590 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  26.67 
 
 		 586 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  24.81 
 
 		 596 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  29.38 
 
 		 372 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  24.56 
 
 		 601 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2489  precorrin-3B synthase  30.71 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2534  precorrin-3B synthase  30.71 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.35067  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2526  precorrin-3B synthase  30.71 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  30.81 
 
 		 465 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  32.56 
 
 		 473 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  30.51 
 
 		 486 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2192  precorrin-3B synthase  32.6 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  31.79 
 
 		 482 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  40 
 
 		 510 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  31.79 
 
 		 482 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  31.79 
 
 		 482 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  31.79 
 
 		 482 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  31.79 
 
 		 482 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  31.32 
 
 		 482 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  31.79 
 
 		 482 aa  90.1  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  22.86 
 
 		 516 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  24.63 
 
 		 615 aa  87.8  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  24.87 
 
 		 590 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.23 
 
 		 592 aa  84.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.83 
 
 		 581 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  23.97 
 
 		 513 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.03 
 
 		 568 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  24.75 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  22.28 
 
 		 510 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  22.2 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  25.59 
 
 		 569 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  22.2 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  23.36 
 
 		 542 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  22.97 
 
 		 536 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.23 
 
 		 590 aa  79.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2494  nitrite/sulfite reductase hemoprotein subnit beta ferrodoxin domain-containing protein  30.89 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  25 
 
 		 571 aa  78.6  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24 
 
 		 589 aa  78.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2894  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  40 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.804468  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  29.8 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  25.71 
 
 		 569 aa  77  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  24.02 
 
 		 521 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17650  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  40.38 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220438  normal  0.761775 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>