171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6019 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  79.35 
 
 		 460 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6019  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 452 aa  878    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0172666  normal  0.33411 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  44.44 
 
 		 443 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3285  precorrin-3B synthase  39.63 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1435  precorrin-3B synthase  35.67 
 
 		 437 aa  157  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.592884  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  37.03 
 
 		 428 aa  156  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  36.41 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  32.96 
 
 		 430 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  34.25 
 
 		 424 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  31.77 
 
 		 464 aa  129  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  33.16 
 
 		 380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  35.43 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2439  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  36.84 
 
 		 423 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341511  normal  0.0829631 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0341  precorrin-3B synthase  33.33 
 
 		 381 aa  123  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  25.9 
 
 		 494 aa  113  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  25.94 
 
 		 732 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  27.94 
 
 		 439 aa  106  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  33.33 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  31.71 
 
 		 423 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  26.81 
 
 		 560 aa  96.7  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  27.76 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  29.43 
 
 		 469 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.19 
 
 		 550 aa  93.6  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  28 
 
 		 482 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  28 
 
 		 516 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  29.55 
 
 		 434 aa  90.5  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  27.55 
 
 		 476 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  25.16 
 
 		 487 aa  89  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  27.67 
 
 		 454 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  27.08 
 
 		 447 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  30.81 
 
 		 387 aa  87.4  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  27.91 
 
 		 409 aa  87  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2150  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  39.74 
 
 		 478 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  27.76 
 
 		 482 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  28.09 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.82 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.72 
 
 		 565 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  23.24 
 
 		 564 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  27.81 
 
 		 586 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  23.08 
 
 		 563 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  24.78 
 
 		 571 aa  80.9  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.05 
 
 		 569 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  28.15 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  26 
 
 		 595 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  26.65 
 
 		 463 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  23.71 
 
 		 596 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  25.45 
 
 		 595 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  26.5 
 
 		 599 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  28.16 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  28.74 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.81 
 
 		 570 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  23.49 
 
 		 596 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  24.2 
 
 		 569 aa  77.4  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  23.71 
 
 		 601 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.78 
 
 		 592 aa  76.6  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.88 
 
 		 556 aa  76.6  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  26.17 
 
 		 521 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  26.17 
 
 		 512 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.31 
 
 		 562 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  22.76 
 
 		 553 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  24.29 
 
 		 581 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  26.37 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  23.06 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  23.06 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  22.76 
 
 		 553 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.55 
 
 		 581 aa  73.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  24.09 
 
 		 569 aa  73.6  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  22.48 
 
 		 590 aa  73.2  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  27.2 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.34 
 
 		 567 aa  72.8  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  25.3 
 
 		 586 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  24.58 
 
 		 569 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  23.58 
 
 		 605 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  25.31 
 
 		 608 aa  71.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  21.89 
 
 		 560 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  25.74 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  28.64 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  21.7 
 
 		 536 aa  70.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.1 
 
 		 568 aa  70.1  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  21.88 
 
 		 560 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  25.78 
 
 		 590 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  21.23 
 
 		 541 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  22.91 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  23.19 
 
 		 513 aa  68.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  21.46 
 
 		 560 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  21.46 
 
 		 560 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  27.23 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.49 
 
 		 570 aa  67.4  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  21.46 
 
 		 560 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  23.67 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  24.04 
 
 		 591 aa  67  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  24.18 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  23.19 
 
 		 516 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.07 
 
 		 556 aa  65.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  20.98 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  22.08 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  22.67 
 
 		 633 aa  64.3  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  29.08 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  28.7 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  28.7 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>