120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0341 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0341  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 381 aa  739    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  42.33 
 
 		 380 aa  259  5.0000000000000005e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  45.95 
 
 		 386 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  40.32 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  41.22 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  34.3 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  35.79 
 
 		 424 aa  146  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  34.18 
 
 		 428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  33.59 
 
 		 464 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  34.38 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1435  precorrin-3B synthase  34.67 
 
 		 437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.592884  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6019  precorrin-3B synthase  33.33 
 
 		 452 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0172666  normal  0.33411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2439  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  35.96 
 
 		 423 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341511  normal  0.0829631 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  32.48 
 
 		 460 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3285  precorrin-3B synthase  33.42 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  30.21 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  27.84 
 
 		 431 aa  87  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  25.6 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  28.04 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  26.55 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  30.97 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  29.49 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  25.79 
 
 		 586 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  39.24 
 
 		 428 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  29.43 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1783  hypothetical protein  30.61 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  24.59 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  27 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2150  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  50.63 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.25 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  28.74 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  56.92 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  23.82 
 
 		 732 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  20.96 
 
 		 487 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2489  precorrin-3B synthase  29.84 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2534  precorrin-3B synthase  29.84 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.35067  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2526  precorrin-3B synthase  29.84 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  31.48 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  25.37 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  25.85 
 
 		 595 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2494  nitrite/sulfite reductase hemoprotein subnit beta ferrodoxin domain-containing protein  28.38 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12100  cobalamin biosynthesis protein cobG  27.5 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00940846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  24.75 
 
 		 599 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  29.41 
 
 		 473 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  24.94 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  25 
 
 		 595 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  24.32 
 
 		 615 aa  60.1  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  23.46 
 
 		 596 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1626  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  34.78 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.470677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2192  precorrin-3B synthase  28.09 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  31.62 
 
 		 456 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  32.33 
 
 		 438 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  32.33 
 
 		 443 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  32.12 
 
 		 507 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  23.21 
 
 		 605 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.2 
 
 		 793 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  21.91 
 
 		 586 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2894  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.14 
 
 		 282 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.804468  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  22.47 
 
 		 601 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  22.72 
 
 		 596 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  22.28 
 
 		 540 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  46.55 
 
 		 465 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  22.28 
 
 		 540 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  22.28 
 
 		 540 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  22.41 
 
 		 604 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  22.53 
 
 		 540 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  21.77 
 
 		 540 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  21.77 
 
 		 540 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  23.15 
 
 		 512 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  34.19 
 
 		 463 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  24.23 
 
 		 581 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  34.19 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.11 
 
 		 569 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  22.75 
 
 		 590 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17650  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  31.58 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220438  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  22.28 
 
 		 540 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  27.69 
 
 		 560 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  27.69 
 
 		 560 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  27.69 
 
 		 560 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  27.69 
 
 		 560 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  24.14 
 
 		 621 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  21.8 
 
 		 568 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  28.25 
 
 		 569 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  22.78 
 
 		 540 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  22.73 
 
 		 540 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  28.28 
 
 		 519 aa  46.6  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  20.91 
 
 		 513 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  30.15 
 
 		 486 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  31.58 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  20.91 
 
 		 513 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1519  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  28.95 
 
 		 481 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  21.76 
 
 		 608 aa  46.6  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  33.33 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  22.73 
 
 		 540 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  26.15 
 
 		 560 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  21.43 
 
 		 492 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  33.52 
 
 		 571 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  26.23 
 
 		 479 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  31.21 
 
 		 516 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  30.77 
 
 		 560 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>