113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2534 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2489  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 373 aa  714    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2534  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 373 aa  714    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.35067  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2526  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 373 aa  714    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  68.21 
 
 		 372 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  70.92 
 
 		 372 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12100  cobalamin biosynthesis protein cobG  69.11 
 
 		 363 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00940846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  49.06 
 
 		 378 aa  300  3e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  45.6 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  40.79 
 
 		 439 aa  236  7e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2192  precorrin-3B synthase  47.11 
 
 		 351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0576  precorrin-3B synthase  50 
 
 		 389 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.244524  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2494  nitrite/sulfite reductase hemoprotein subnit beta ferrodoxin domain-containing protein  45.04 
 
 		 367 aa  216  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  40.41 
 
 		 473 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1519  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  39.64 
 
 		 481 aa  203  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1783  hypothetical protein  39.04 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17650  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  42.52 
 
 		 292 aa  170  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220438  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1626  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  38.68 
 
 		 335 aa  136  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.470677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2894  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  39.24 
 
 		 282 aa  135  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.804468  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  30.71 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.04 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  31.4 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  30.89 
 
 		 443 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  28.11 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  30.92 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  25.71 
 
 		 487 aa  99  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  28.53 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  31.09 
 
 		 476 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  31.07 
 
 		 447 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  28.46 
 
 		 439 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  32.08 
 
 		 464 aa  96.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  30.95 
 
 		 443 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  30.65 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  28.65 
 
 		 409 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  30.19 
 
 		 463 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  29.88 
 
 		 483 aa  90.1  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0341  precorrin-3B synthase  29.84 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3411  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  42.45 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  24.04 
 
 		 494 aa  83.2  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  28.61 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  27.53 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  30.42 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  29.67 
 
 		 479 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  26.6 
 
 		 599 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  25.98 
 
 		 590 aa  77  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  28.09 
 
 		 482 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  25.74 
 
 		 586 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  29.35 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  40.44 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  31.2 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  24.43 
 
 		 608 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  25.74 
 
 		 615 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  28.33 
 
 		 482 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  25.94 
 
 		 513 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  25.94 
 
 		 513 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  39.6 
 
 		 478 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  23.67 
 
 		 732 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  24.04 
 
 		 605 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  25.55 
 
 		 601 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  25.55 
 
 		 596 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  35.92 
 
 		 454 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  25.8 
 
 		 596 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  23.23 
 
 		 510 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  25.42 
 
 		 595 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  35.44 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  36.6 
 
 		 516 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  32.14 
 
 		 507 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  33.33 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  25.49 
 
 		 521 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  24.45 
 
 		 595 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  35.71 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  31.11 
 
 		 456 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  24.26 
 
 		 604 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  26.21 
 
 		 586 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  36.05 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  36.05 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  31.97 
 
 		 512 aa  56.2  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3285  precorrin-3B synthase  28.65 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  24.68 
 
 		 639 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  40 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  25.43 
 
 		 590 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  24.3 
 
 		 569 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1435  precorrin-3B synthase  42.67 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.592884  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.21 
 
 		 568 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  20.99 
 
 		 621 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  46.67 
 
 		 449 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2439  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  38.46 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341511  normal  0.0829631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  42.67 
 
 		 428 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4432  ferredoxin--nitrite reductase  30.92 
 
 		 607 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  31.58 
 
 		 536 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  41.33 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  42.5 
 
 		 460 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  24 
 
 		 648 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  24.75 
 
 		 492 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  29.37 
 
 		 486 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2150  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  37.86 
 
 		 478 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.32 
 
 		 570 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  30.1 
 
 		 796 aa  46.6  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>