191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12100 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12100  cobalamin biosynthesis protein cobG  100 
 
 		 363 aa  702    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00940846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  64.67 
 
 		 372 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2489  precorrin-3B synthase  69.11 
 
 		 373 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2534  precorrin-3B synthase  69.11 
 
 		 373 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.35067  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2526  precorrin-3B synthase  69.11 
 
 		 373 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  64.58 
 
 		 372 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  49.59 
 
 		 378 aa  287  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  41.73 
 
 		 439 aa  247  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0576  precorrin-3B synthase  48.67 
 
 		 389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.244524  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2192  precorrin-3B synthase  46.81 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  44.2 
 
 		 408 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2494  nitrite/sulfite reductase hemoprotein subnit beta ferrodoxin domain-containing protein  44.68 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  44.64 
 
 		 473 aa  209  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1519  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  40.85 
 
 		 481 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1783  hypothetical protein  39.2 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17650  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  42.27 
 
 		 292 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220438  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2894  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  40.21 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.804468  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1626  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  37.05 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.470677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  33.26 
 
 		 478 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.52 
 
 		 432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  31.25 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  32.45 
 
 		 483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  29.24 
 
 		 430 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  32.28 
 
 		 476 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  29.95 
 
 		 424 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  31.54 
 
 		 443 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  30.29 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  31.47 
 
 		 447 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  30.35 
 
 		 438 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  25.61 
 
 		 494 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  30.84 
 
 		 479 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  32.32 
 
 		 464 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  29.76 
 
 		 409 aa  97.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  31.34 
 
 		 456 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  30.85 
 
 		 443 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  29.68 
 
 		 469 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  29.49 
 
 		 443 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  28.33 
 
 		 465 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  22.84 
 
 		 487 aa  91.7  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  28.53 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  31.72 
 
 		 482 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  31.98 
 
 		 434 aa  90.1  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  26.65 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3411  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  34.26 
 
 		 207 aa  86.3  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  31.95 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  31.95 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  31.95 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  31.95 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  28.94 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  31.64 
 
 		 482 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  26.89 
 
 		 507 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  31.72 
 
 		 482 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  31.59 
 
 		 486 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0341  precorrin-3B synthase  28.33 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  28.72 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  34.81 
 
 		 732 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  26.45 
 
 		 599 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  24.87 
 
 		 615 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  24.43 
 
 		 590 aa  74.3  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  40.44 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  40.85 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  25.82 
 
 		 586 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  39.44 
 
 		 463 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  37.86 
 
 		 482 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  40.52 
 
 		 482 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  40.52 
 
 		 516 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  25.7 
 
 		 595 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  21.88 
 
 		 604 aa  66.2  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  25.45 
 
 		 586 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  23.47 
 
 		 513 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  23.47 
 
 		 513 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  34.11 
 
 		 521 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  28.5 
 
 		 443 aa  63.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  27.56 
 
 		 648 aa  62.8  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  20.92 
 
 		 480 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  25.96 
 
 		 596 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  25.45 
 
 		 595 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1435  precorrin-3B synthase  27.11 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.592884  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  34.41 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  25.96 
 
 		 601 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  22.41 
 
 		 621 aa  60.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  21.54 
 
 		 510 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  50 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  45.33 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.54 
 
 		 567 aa  58.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2541  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.69 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000365571  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3309  hypothetical protein  26 
 
 		 562 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.586333  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  37.3 
 
 		 608 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2150  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  39.6 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  30.89 
 
 		 540 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  28.16 
 
 		 570 aa  57  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1188  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.56 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445325  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  26.54 
 
 		 571 aa  56.6  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  22.52 
 
 		 542 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  24.47 
 
 		 590 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  30.23 
 
 		 512 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  24.47 
 
 		 639 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  42.67 
 
 		 428 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  30.08 
 
 		 540 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3285  precorrin-3B synthase  40 
 
 		 438 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>