91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1783 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1783  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  663    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2494  nitrite/sulfite reductase hemoprotein subnit beta ferrodoxin domain-containing protein  48.1 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  41.1 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1519  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  37.64 
 
 		 481 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0576  precorrin-3B synthase  45.36 
 
 		 389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.244524  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12100  cobalamin biosynthesis protein cobG  40.16 
 
 		 363 aa  182  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00940846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  41.32 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  42.53 
 
 		 473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2489  precorrin-3B synthase  39.89 
 
 		 373 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2534  precorrin-3B synthase  39.89 
 
 		 373 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.35067  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2526  precorrin-3B synthase  39.89 
 
 		 373 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  30.19 
 
 		 439 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  35.73 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  34.68 
 
 		 378 aa  126  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2192  precorrin-3B synthase  37.78 
 
 		 351 aa  115  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  30.58 
 
 		 430 aa  113  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.59 
 
 		 432 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  28.28 
 
 		 469 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  31.69 
 
 		 476 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  30.71 
 
 		 478 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  30.91 
 
 		 447 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2894  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  33.56 
 
 		 282 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.804468  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17650  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  41.73 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220438  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  32.97 
 
 		 434 aa  90.1  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  30.88 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  29.98 
 
 		 483 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  32 
 
 		 464 aa  85.9  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  28.41 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0341  precorrin-3B synthase  32.37 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  29.85 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1626  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  32.51 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.470677  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  27.61 
 
 		 431 aa  76.3  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  25.92 
 
 		 494 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  27.86 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  27.95 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  23.12 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  34.01 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 486 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  24.74 
 
 		 513 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  24.74 
 
 		 513 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  35.51 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  51.61 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  27.17 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  28.24 
 
 		 428 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  37.96 
 
 		 465 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  38.95 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  45.45 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  45.45 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  45.45 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  45.45 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  45.45 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  45.45 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  45.45 
 
 		 482 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  25.39 
 
 		 512 aa  59.7  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  45.45 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  27.74 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  50 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  33.7 
 
 		 732 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  50 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2439  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.73 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341511  normal  0.0829631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  35.83 
 
 		 507 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  50 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  50 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  20.26 
 
 		 542 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  22.14 
 
 		 536 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  22.25 
 
 		 510 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  24.08 
 
 		 513 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3411  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  31.58 
 
 		 207 aa  52.8  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  37.5 
 
 		 443 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  40.62 
 
 		 439 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  40.21 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2150  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  34.56 
 
 		 478 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  41.84 
 
 		 443 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  41.84 
 
 		 438 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  23.87 
 
 		 586 aa  50.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  33.33 
 
 		 460 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  23.04 
 
 		 492 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  23.56 
 
 		 521 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1435  precorrin-3B synthase  30.77 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.592884  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.83 
 
 		 603 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  23.54 
 
 		 621 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  23.23 
 
 		 604 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  22.37 
 
 		 542 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1603  sulfite reductase, subunit C  34.55 
 
 		 327 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1241  ferredoxin--nitrite reductase  22.19 
 
 		 567 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.250067  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1767  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  25.13 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.670459  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  23.91 
 
 		 560 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  26.98 
 
 		 608 aa  43.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  31.25 
 
 		 516 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6019  precorrin-3B synthase  40.68 
 
 		 452 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0172666  normal  0.33411 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  27.36 
 
 		 633 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>