More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2248 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  100 
 
 		 456 aa  884    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  92.76 
 
 		 486 aa  728    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  55.56 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  54 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  53.32 
 
 		 447 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  57.31 
 
 		 469 aa  385  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  50.31 
 
 		 507 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  49.79 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  53.64 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  53.64 
 
 		 438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  52.5 
 
 		 443 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  53.18 
 
 		 443 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  49.44 
 
 		 465 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  52.47 
 
 		 478 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  48.55 
 
 		 483 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  49.89 
 
 		 479 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  50.94 
 
 		 482 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  48.71 
 
 		 463 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  50.94 
 
 		 516 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  48.69 
 
 		 454 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  51.42 
 
 		 482 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  49.46 
 
 		 482 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  49.46 
 
 		 482 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  49.46 
 
 		 482 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  49.46 
 
 		 482 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  49.46 
 
 		 482 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  49.46 
 
 		 482 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  49.46 
 
 		 482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  40.71 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  41.87 
 
 		 431 aa  266  4e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  41.96 
 
 		 409 aa  253  7e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  31.56 
 
 		 494 aa  202  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  30.16 
 
 		 732 aa  192  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  32.51 
 
 		 590 aa  183  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  30.12 
 
 		 586 aa  176  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  30.24 
 
 		 615 aa  172  7.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  31.85 
 
 		 599 aa  172  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  29.95 
 
 		 604 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  29.95 
 
 		 586 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  29.97 
 
 		 605 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  30.66 
 
 		 595 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  31.49 
 
 		 608 aa  163  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  29.58 
 
 		 601 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  29.58 
 
 		 596 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  30.05 
 
 		 595 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  28.82 
 
 		 596 aa  161  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  27.54 
 
 		 487 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  29.88 
 
 		 590 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  29.17 
 
 		 542 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  29.22 
 
 		 521 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  27.89 
 
 		 510 aa  129  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  31.72 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  27.46 
 
 		 633 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  28.18 
 
 		 513 aa  127  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  29.8 
 
 		 512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  28.15 
 
 		 513 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  28.15 
 
 		 513 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.88 
 
 		 805 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  25.87 
 
 		 516 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.08 
 
 		 793 aa  123  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  24.26 
 
 		 553 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  24.5 
 
 		 553 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  28.82 
 
 		 542 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  30.12 
 
 		 551 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  28.32 
 
 		 571 aa  120  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  26.92 
 
 		 536 aa  120  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  26.29 
 
 		 567 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  28.61 
 
 		 569 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  25.39 
 
 		 541 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  27.07 
 
 		 513 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  31.35 
 
 		 464 aa  116  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  28.32 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  26.57 
 
 		 621 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  27.08 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  30.47 
 
 		 424 aa  114  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  27.78 
 
 		 569 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  28.36 
 
 		 521 aa  110  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  24.3 
 
 		 540 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  24.68 
 
 		 540 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  24.68 
 
 		 540 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  24.68 
 
 		 540 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  24.43 
 
 		 540 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  24.68 
 
 		 540 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  33.8 
 
 		 473 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  24.68 
 
 		 540 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  24.17 
 
 		 540 aa  107  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  23.66 
 
 		 540 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  23 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  32.49 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.96 
 
 		 570 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  24.17 
 
 		 540 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  23.82 
 
 		 480 aa  104  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  27.88 
 
 		 553 aa  103  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  23.47 
 
 		 540 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  31.97 
 
 		 372 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  27.64 
 
 		 560 aa  100  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.46 
 
 		 568 aa  99.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  30.75 
 
 		 372 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  28.53 
 
 		 648 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0576  precorrin-3B synthase  31.45 
 
 		 389 aa  96.7  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.244524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>