More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1767 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1767  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  100 
 
 
433 aa  879    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.670459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4000  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  48.04 
 
 
435 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000175217  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2527  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  46.05 
 
 
433 aa  365  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0879547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2520  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  43.06 
 
 
435 aa  343  5e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000248775  normal  0.264719 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0271  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  42.52 
 
 
426 aa  296  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0256  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  42.15 
 
 
426 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000133948 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  29.83 
 
 
521 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  28.57 
 
 
560 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  29.03 
 
 
553 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.5 
 
 
562 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.94 
 
 
757 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  27.69 
 
 
560 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  28.97 
 
 
560 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  29.1 
 
 
556 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  28.83 
 
 
569 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  26.67 
 
 
560 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  26.67 
 
 
560 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  26.89 
 
 
540 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  26.67 
 
 
560 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  26.5 
 
 
521 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.8 
 
 
573 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  26.18 
 
 
540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1504  sulfite reductase (ferredoxin)  25.06 
 
 
696 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361579  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6617  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.73 
 
 
704 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00459026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3092  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.7 
 
 
697 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000117991  hitchhiker  0.00929399 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.16 
 
 
592 aa  133  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  26.67 
 
 
560 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  26.39 
 
 
513 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  26.39 
 
 
513 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  29.08 
 
 
581 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  26.67 
 
 
542 aa  131  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  26.42 
 
 
540 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  26.37 
 
 
540 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  25.94 
 
 
540 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  25.94 
 
 
540 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  25.94 
 
 
540 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  25.94 
 
 
540 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2051  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.42 
 
 
720 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.773496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  26.53 
 
 
567 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  25.3 
 
 
540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  25.47 
 
 
540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.38 
 
 
805 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  26.37 
 
 
540 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.25 
 
 
570 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  28.24 
 
 
581 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.82 
 
 
550 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  26.32 
 
 
563 aa  127  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  24.82 
 
 
541 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  26.75 
 
 
569 aa  126  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  25.17 
 
 
643 aa  126  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  26.49 
 
 
569 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2637  sulfite reductase (NADPH)  24.74 
 
 
713 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  27.51 
 
 
551 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1146  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.13 
 
 
697 aa  122  9e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2618  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.16 
 
 
742 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  25.84 
 
 
536 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  26.49 
 
 
569 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.97 
 
 
565 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  27.23 
 
 
571 aa  121  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.3 
 
 
568 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.52 
 
 
590 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  25.94 
 
 
586 aa  120  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  23.57 
 
 
519 aa  120  7e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.75 
 
 
793 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1931  ferredoxin--nitrite reductase  25 
 
 
556 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3268  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.72 
 
 
606 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446029  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.45 
 
 
556 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  27.51 
 
 
599 aa  117  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  26.58 
 
 
564 aa  117  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  24.14 
 
 
586 aa  117  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  26.33 
 
 
648 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0679  sulfite reductase ferredoxin  25.5 
 
 
602 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2513  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.55 
 
 
557 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67153  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  24.7 
 
 
512 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  24.52 
 
 
553 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.61 
 
 
567 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  24.68 
 
 
553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.91 
 
 
570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.21 
 
 
589 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  27.39 
 
 
573 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2784  sulfite reductase (ferredoxin)  27.23 
 
 
568 aa  113  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163848 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4432  ferredoxin--nitrite reductase  25.89 
 
 
607 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4013  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.44 
 
 
550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  23.26 
 
 
510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3122  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  26.44 
 
 
563 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2721  Sulfite reductase (NADPH)  26.44 
 
 
563 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000160645 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.65 
 
 
569 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  27.21 
 
 
639 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.64 
 
 
592 aa  109  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  25.98 
 
 
513 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.83 
 
 
590 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  24.22 
 
 
586 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  25.17 
 
 
516 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3124  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  24.07 
 
 
564 aa  106  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3664  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  24 
 
 
559 aa  106  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0970  Ferredoxin--nitrite reductase  24 
 
 
559 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2558  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.51 
 
 
544 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1381  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  23.78 
 
 
551 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.244986  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.04 
 
 
591 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  22.96 
 
 
796 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>