More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0271 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0271  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  100 
 
 
426 aa  856    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0256  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  94.6 
 
 
426 aa  795    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000133948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4000  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  52.21 
 
 
435 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000175217  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2527  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  52.58 
 
 
433 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0879547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2520  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  50.11 
 
 
435 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000248775  normal  0.264719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1767  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  42.39 
 
 
433 aa  308  9e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.670459  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  28.2 
 
 
542 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  28.09 
 
 
521 aa  140  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2051  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.85 
 
 
720 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.773496 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  27.65 
 
 
540 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.75 
 
 
757 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2637  sulfite reductase (NADPH)  27.21 
 
 
713 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  27.13 
 
 
540 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  27.35 
 
 
540 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  26.93 
 
 
540 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  26.49 
 
 
540 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  27.15 
 
 
540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  26.51 
 
 
541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  26.93 
 
 
540 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  26.93 
 
 
540 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  26.93 
 
 
540 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  26.55 
 
 
540 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2618  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.04 
 
 
742 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3092  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.59 
 
 
697 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000117991  hitchhiker  0.00929399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6617  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.09 
 
 
704 aa  123  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00459026 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0679  sulfite reductase ferredoxin  26.56 
 
 
602 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1504  sulfite reductase (ferredoxin)  24.59 
 
 
696 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361579  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1146  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.57 
 
 
697 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1931  ferredoxin--nitrite reductase  26.94 
 
 
556 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.74 
 
 
592 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.15 
 
 
805 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  26.81 
 
 
540 aa  120  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  23.53 
 
 
796 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1264  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  25.8 
 
 
551 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.657041  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.23 
 
 
581 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  27.53 
 
 
553 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3124  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  26.34 
 
 
564 aa  116  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.67 
 
 
590 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  25.86 
 
 
567 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1942  sulfite/nitrite reductase hemoprotein subunit  26.42 
 
 
556 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3156  sulfite reductase (ferredoxin)  27.11 
 
 
552 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240199  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0593  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  26.42 
 
 
556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313736  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.67 
 
 
568 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2261  sulfite reductase (ferredoxin)  26.46 
 
 
553 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533982  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1891  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.69 
 
 
550 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.92 
 
 
570 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0889  sulfite reductase (ferredoxin)  24.16 
 
 
552 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0812727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  28.05 
 
 
581 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  25.93 
 
 
548 aa  111  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  25.45 
 
 
571 aa  110  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0338  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  25.45 
 
 
556 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0988225  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4432  ferredoxin--nitrite reductase  34.31 
 
 
607 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.1 
 
 
567 aa  110  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0655  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  27.06 
 
 
551 aa  109  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  25.62 
 
 
569 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1773  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  27.11 
 
 
553 aa  109  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.155846  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.42 
 
 
793 aa  109  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.32 
 
 
569 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  27 
 
 
551 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  28.02 
 
 
648 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3274  sulfite reductase (ferredoxin)  26.65 
 
 
669 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4013  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.17 
 
 
550 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1758  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  26.65 
 
 
555 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2013  sulphite reductase  25.47 
 
 
554 aa  107  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160364  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  24.22 
 
 
560 aa  107  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  23.66 
 
 
560 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3991  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  24.1 
 
 
556 aa  106  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  24.52 
 
 
573 aa  106  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  26.88 
 
 
569 aa  106  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1397  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  24.72 
 
 
551 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  27.27 
 
 
586 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3268  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.74 
 
 
606 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446029  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.47 
 
 
589 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3346  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  33.74 
 
 
605 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  24.37 
 
 
586 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  26.15 
 
 
545 aa  103  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3457  sulfite reductase  24.66 
 
 
552 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.998056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  23.78 
 
 
560 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  23.78 
 
 
560 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40770  sulfite reductase  24.66 
 
 
552 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74513  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2696  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  24.38 
 
 
560 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  23.56 
 
 
560 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.94 
 
 
562 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  25.94 
 
 
512 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.89 
 
 
573 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6980  sulfite/ferredoxin-nitrite reductase  23.46 
 
 
551 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.09 
 
 
591 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2345  sulfite reductase (ferredoxin)  24.04 
 
 
553 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0166972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  24.34 
 
 
560 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3155  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  34.29 
 
 
606 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.126961  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1671  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.18 
 
 
558 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0706341  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5531  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.92 
 
 
609 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5806  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  25.91 
 
 
559 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4694  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  25.51 
 
 
551 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0970  Ferredoxin--nitrite reductase  24.83 
 
 
559 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.33 
 
 
570 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.87 
 
 
565 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1401  sulfite reductase, hemoprotein subunit  24.43 
 
 
550 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0403368  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1381  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  24.37 
 
 
551 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.244986  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3664  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  24.83 
 
 
559 aa  99.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>