More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1504 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6617  Sulfite reductase (ferredoxin)  56.24 
 
 
704 aa  808    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00459026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3092  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  53.56 
 
 
697 aa  783    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000117991  hitchhiker  0.00929399 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1504  sulfite reductase (ferredoxin)  100 
 
 
696 aa  1435    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2051  Sulfite reductase (ferredoxin)  50.5 
 
 
720 aa  733    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.773496 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2618  Sulfite reductase (ferredoxin)  49.02 
 
 
742 aa  681    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2637  sulfite reductase (NADPH)  50.07 
 
 
713 aa  710    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  35.26 
 
 
757 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5531  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.49 
 
 
609 aa  340  4e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0679  sulfite reductase ferredoxin  34.09 
 
 
602 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4432  ferredoxin--nitrite reductase  34.35 
 
 
607 aa  316  9e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1146  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  35.15 
 
 
697 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3268  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.25 
 
 
606 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3346  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  30.52 
 
 
605 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3155  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  31.6 
 
 
606 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.126961  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4058  sulfite reductase (ferredoxin)  31.82 
 
 
544 aa  270  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.639199  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2912  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.6 
 
 
557 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.198106 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  30 
 
 
796 aa  263  6e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6980  sulfite/ferredoxin-nitrite reductase  33.13 
 
 
551 aa  263  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2558  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.7 
 
 
544 aa  262  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3604  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.2 
 
 
614 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387306  normal  0.13043 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1401  sulfite reductase, hemoprotein subunit  30.8 
 
 
550 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0403368  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1153  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  30.12 
 
 
555 aa  259  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0770  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like protein  30.25 
 
 
543 aa  258  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259227  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1381  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  31.63 
 
 
551 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.244986  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4013  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.43 
 
 
550 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4694  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  31.22 
 
 
551 aa  251  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2462  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.33 
 
 
552 aa  249  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133864  hitchhiker  0.0089814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2371  sulphite reductase hemoprotein, beta subunit  30.88 
 
 
550 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2475  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.87 
 
 
559 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.187728  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1884  sulfite reductase (ferredoxin)  30.47 
 
 
550 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1931  ferredoxin--nitrite reductase  29.33 
 
 
556 aa  249  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2013  sulphite reductase  31.05 
 
 
554 aa  249  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160364  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1864  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  30.87 
 
 
559 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2480  sulfite reductase (ferredoxin)  30.87 
 
 
559 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2524  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.42 
 
 
559 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3324  sulfite reductase (ferredoxin)  30.88 
 
 
550 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0819  ferredoxin--nitrite reductase  29.95 
 
 
559 aa  249  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2730  sulphite reductase  28.96 
 
 
552 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759699  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2392  sulfite reductase (ferredoxin)  30.42 
 
 
559 aa  248  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2689  Sulfite reductase (ferredoxin)  29.74 
 
 
553 aa  248  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.671477  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3112  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.52 
 
 
552 aa  248  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1978  sulfite reductase (ferredoxin)  30.47 
 
 
550 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126005  normal  0.0650245 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1503  putative nitrite/sulfite reductase  31.39 
 
 
569 aa  247  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0107318  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2229  Sulfite reductase (ferredoxin)  29.93 
 
 
553 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3991  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  29.21 
 
 
556 aa  246  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661802  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1264  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.65 
 
 
551 aa  246  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.657041  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2425  sulfite reductase oxidoreductase protein  30.53 
 
 
553 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5806  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  29.95 
 
 
559 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1068  putative sulfite reductase, beta subunit  30 
 
 
561 aa  244  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1528  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.17 
 
 
550 aa  243  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.245681  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0798  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.2 
 
 
560 aa  243  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3457  sulfite reductase  30.96 
 
 
552 aa  243  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.998056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40770  sulfite reductase  30.96 
 
 
552 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74513  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2147  sulfite reductase (ferredoxin)  29.98 
 
 
552 aa  243  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0201969  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2784  sulfite reductase (ferredoxin)  29.7 
 
 
568 aa  243  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163848 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0593  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  28.81 
 
 
556 aa  243  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313736  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1394  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.09 
 
 
561 aa  242  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3274  sulfite reductase (ferredoxin)  29.04 
 
 
669 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1638  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  31.31 
 
 
556 aa  242  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123155  normal  0.260957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3267  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.13 
 
 
552 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0889  sulfite reductase (ferredoxin)  29.89 
 
 
552 aa  242  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0812727 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1166  sulfite reductase  29.7 
 
 
589 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.878601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1013  sulfite reductase, ferredoxin subunit  29.7 
 
 
559 aa  241  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1110  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.24 
 
 
560 aa  240  5e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2235  sulfite reductase (ferredoxin)  29.45 
 
 
559 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0970  Ferredoxin--nitrite reductase  29.12 
 
 
559 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1825  Sulfite reductase (ferredoxin)  31.11 
 
 
556 aa  239  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.291186  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  29.33 
 
 
548 aa  239  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1942  sulfite/nitrite reductase hemoprotein subunit  28.63 
 
 
556 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3664  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  29.12 
 
 
559 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1397  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.64 
 
 
551 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0655  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  32.45 
 
 
551 aa  239  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0814  sulfite reductase  29.66 
 
 
589 aa  238  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2456  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S protein  29.56 
 
 
605 aa  238  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1671  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31 
 
 
558 aa  236  8e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0706341  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1758  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  29.68 
 
 
555 aa  236  8e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2348  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  29.66 
 
 
559 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0663  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  29.66 
 
 
559 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.6828  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2937  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  29.66 
 
 
559 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1662  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  29.66 
 
 
559 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1006  sulfite reductase, ferredoxin subunit  29.66 
 
 
559 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3124  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  29.52 
 
 
564 aa  234  5e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2148  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  28.67 
 
 
557 aa  233  9e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.249832  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3940  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.77 
 
 
568 aa  233  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0338  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  28.83 
 
 
556 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0988225  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2513  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.32 
 
 
557 aa  232  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67153  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_004310  BR0181  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  28.26 
 
 
556 aa  231  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10550  putative sulfite or nitrite reductas  30.07 
 
 
557 aa  231  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2345  sulfite reductase (ferredoxin)  29.96 
 
 
553 aa  230  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0166972 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0190  sulfite reductase (ferredoxin)  29.53 
 
 
556 aa  230  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2816  sulfite reductase (NADPH) subunit beta  30.14 
 
 
560 aa  230  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0962  sulfite or nitrite reductase  29.84 
 
 
557 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0175  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  28.92 
 
 
556 aa  229  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1101  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.98 
 
 
557 aa  228  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.251663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3156  sulfite reductase (ferredoxin)  29.32 
 
 
552 aa  227  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240199  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27520  Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  30.13 
 
 
552 aa  226  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1891  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.09 
 
 
550 aa  226  9e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2408  Sulfite reductase (ferredoxin)  29.67 
 
 
592 aa  226  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351922  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2261  sulfite reductase (ferredoxin)  30.44 
 
 
553 aa  225  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533982  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2696  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  29.89 
 
 
560 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>