More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2527 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2527  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  100 
 
 
433 aa  863    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0879547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2520  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  60.65 
 
 
435 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000248775  normal  0.264719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4000  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  56.38 
 
 
435 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000175217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0256  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  52.82 
 
 
426 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000133948 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0271  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  52.58 
 
 
426 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1767  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  46.05 
 
 
433 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.670459  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2051  Sulfite reductase (ferredoxin)  30.57 
 
 
720 aa  176  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.773496 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2637  sulfite reductase (NADPH)  29.31 
 
 
713 aa  167  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3092  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.83 
 
 
697 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000117991  hitchhiker  0.00929399 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2618  Sulfite reductase (ferredoxin)  29.68 
 
 
742 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.02 
 
 
757 aa  163  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  29.36 
 
 
542 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1504  sulfite reductase (ferredoxin)  27.32 
 
 
696 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361579  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6617  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.48 
 
 
704 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00459026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  29.26 
 
 
553 aa  146  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1146  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.81 
 
 
697 aa  145  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  29.87 
 
 
521 aa  140  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0679  sulfite reductase ferredoxin  26.17 
 
 
602 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.02 
 
 
568 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  27.79 
 
 
541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  26.12 
 
 
540 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  28.84 
 
 
551 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  27.15 
 
 
521 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  27.72 
 
 
513 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  27.72 
 
 
513 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  26.01 
 
 
540 aa  126  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  26.14 
 
 
540 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  26.33 
 
 
540 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  25.78 
 
 
540 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5531  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.41 
 
 
609 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  26.09 
 
 
540 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  26.14 
 
 
540 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  26.39 
 
 
560 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  26.09 
 
 
540 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  25.78 
 
 
540 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  26.09 
 
 
540 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4432  ferredoxin--nitrite reductase  37.39 
 
 
607 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  26.01 
 
 
540 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.19 
 
 
569 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  28.27 
 
 
643 aa  123  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  26.46 
 
 
519 aa  122  9e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  27.21 
 
 
586 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  26.04 
 
 
796 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1671  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.22 
 
 
558 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0706341  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1264  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  28.08 
 
 
551 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.657041  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  29.68 
 
 
639 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.05 
 
 
805 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  26.64 
 
 
548 aa  120  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  25.82 
 
 
560 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3268  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.6 
 
 
606 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446029  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.24 
 
 
590 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  27.18 
 
 
590 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  26.23 
 
 
586 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1758  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  26.49 
 
 
555 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  29.02 
 
 
512 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.71 
 
 
550 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  25.92 
 
 
536 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4058  sulfite reductase (ferredoxin)  24.32 
 
 
544 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.639199  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6980  sulfite/ferredoxin-nitrite reductase  27.54 
 
 
551 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.6 
 
 
562 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0593  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  26.69 
 
 
556 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313736  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4013  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.87 
 
 
550 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1931  ferredoxin--nitrite reductase  27.13 
 
 
556 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.96 
 
 
567 aa  114  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1942  sulfite/nitrite reductase hemoprotein subunit  26.69 
 
 
556 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0338  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  26.49 
 
 
556 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0988225  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1401  sulfite reductase, hemoprotein subunit  25.83 
 
 
550 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0403368  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3274  sulfite reductase (ferredoxin)  26.16 
 
 
669 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1381  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  24.9 
 
 
551 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.244986  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.79 
 
 
570 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.46 
 
 
581 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3346  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  37.44 
 
 
605 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  24.24 
 
 
560 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  26.82 
 
 
586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  26.9 
 
 
604 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  25.22 
 
 
571 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  24.24 
 
 
560 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  25.78 
 
 
513 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2784  sulfite reductase (ferredoxin)  25.71 
 
 
568 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163848 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3991  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  25.61 
 
 
556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661802  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.25 
 
 
573 aa  112  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.45 
 
 
570 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  26.79 
 
 
581 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  24.24 
 
 
560 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  27.14 
 
 
567 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0512  nitrite/sulfite reductase-like protein  23.73 
 
 
516 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  24.52 
 
 
573 aa  110  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0962  sulfite or nitrite reductase  27.27 
 
 
557 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0970  Ferredoxin--nitrite reductase  25.15 
 
 
559 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3267  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  26.07 
 
 
552 aa  109  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2345  sulfite reductase (ferredoxin)  25.8 
 
 
553 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0166972 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2721  Sulfite reductase (NADPH)  26.24 
 
 
563 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000160645 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3122  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  26.24 
 
 
563 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0798  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.02 
 
 
560 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  25.46 
 
 
560 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3664  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  24.74 
 
 
559 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  24.68 
 
 
560 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10550  putative sulfite or nitrite reductas  27.35 
 
 
557 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1110  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.09 
 
 
560 aa  108  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.58 
 
 
592 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>