246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1713 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  97.43 
 
 		 428 aa  736    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 428 aa  808    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1435  precorrin-3B synthase  85.09 
 
 		 437 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.592884  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  56.38 
 
 		 449 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2439  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  48.43 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341511  normal  0.0829631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2150  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  46.35 
 
 		 478 aa  237  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  37.21 
 
 		 424 aa  179  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  36.83 
 
 		 430 aa  175  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3285  precorrin-3B synthase  40.3 
 
 		 438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  38.57 
 
 		 460 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  37.28 
 
 		 443 aa  156  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6019  precorrin-3B synthase  37.01 
 
 		 452 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0172666  normal  0.33411 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  32.79 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0341  precorrin-3B synthase  36.04 
 
 		 381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  37.05 
 
 		 423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  36.18 
 
 		 386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  33.08 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  28.15 
 
 		 732 aa  123  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  33.84 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  28.71 
 
 		 494 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  30.53 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  30.4 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  30.61 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  33.17 
 
 		 454 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  32.54 
 
 		 469 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  34.2 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  32.51 
 
 		 483 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.42 
 
 		 550 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  34.88 
 
 		 482 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  26.54 
 
 		 521 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  34.88 
 
 		 516 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  23.53 
 
 		 487 aa  93.2  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.95 
 
 		 562 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  27.83 
 
 		 608 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.5 
 
 		 432 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  26.97 
 
 		 560 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  24.04 
 
 		 510 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  24.59 
 
 		 513 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  24.59 
 
 		 513 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  32.22 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  27.73 
 
 		 595 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  26.71 
 
 		 595 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  31.81 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  27.27 
 
 		 586 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  26.39 
 
 		 512 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  27.56 
 
 		 639 aa  83.6  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  23.04 
 
 		 480 aa  83.2  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.04 
 
 		 565 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  23.87 
 
 		 516 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  26.23 
 
 		 605 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  33.16 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  28.89 
 
 		 586 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  26.2 
 
 		 590 aa  81.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  26.94 
 
 		 564 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  25.39 
 
 		 596 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  31.77 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  27.92 
 
 		 590 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  22.7 
 
 		 536 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  23.66 
 
 		 519 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  25.68 
 
 		 604 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  22.04 
 
 		 553 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  22.04 
 
 		 553 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  25.4 
 
 		 615 aa  77.4  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  25.71 
 
 		 596 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  30.59 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  31.16 
 
 		 473 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  25.5 
 
 		 601 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  32.5 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.52 
 
 		 592 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  32 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.15 
 
 		 568 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  28.02 
 
 		 570 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  26.57 
 
 		 560 aa  73.6  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  30.56 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  27.51 
 
 		 586 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  27.16 
 
 		 569 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  24.82 
 
 		 513 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.55 
 
 		 569 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  26.74 
 
 		 571 aa  70.9  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  23.96 
 
 		 542 aa  70.1  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  24.62 
 
 		 581 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  25.26 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  24.37 
 
 		 513 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.58 
 
 		 591 aa  68.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  32.48 
 
 		 479 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  30.91 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  26.41 
 
 		 569 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.94 
 
 		 556 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  31.13 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0576  precorrin-3B synthase  31.54 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.244524  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1519  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  28.05 
 
 		 481 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  27.58 
 
 		 569 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  25.37 
 
 		 560 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  25.37 
 
 		 560 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  25.37 
 
 		 560 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.13 
 
 		 581 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  29.2 
 
 		 510 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  30.77 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  24.59 
 
 		 553 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  25.92 
 
 		 521 aa  64.3  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>