104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2930 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 380 aa  751    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0341  precorrin-3B synthase  42.33 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  41.73 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  39.02 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  40.53 
 
 		 434 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  35.05 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  32.22 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  34.55 
 
 		 464 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  32.1 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  33.66 
 
 		 449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3285  precorrin-3B synthase  31.68 
 
 		 438 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6019  precorrin-3B synthase  33.16 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0172666  normal  0.33411 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  31.83 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  29.72 
 
 		 476 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  29.26 
 
 		 431 aa  102  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  30.56 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  30.2 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.11 
 
 		 432 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  29.78 
 
 		 454 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  28.23 
 
 		 439 aa  97.4  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  28.81 
 
 		 483 aa  96.3  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  29.41 
 
 		 409 aa  93.6  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  30.05 
 
 		 443 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  29.25 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  29.13 
 
 		 465 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  29.5 
 
 		 463 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  29.67 
 
 		 478 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  39.49 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  29.65 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  31.47 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2494  nitrite/sulfite reductase hemoprotein subnit beta ferrodoxin domain-containing protein  31.47 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  29.4 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  31 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2439  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  46.91 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341511  normal  0.0829631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  28.39 
 
 		 469 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  24.32 
 
 		 487 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1435  precorrin-3B synthase  36.71 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.592884  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  30.13 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  29.9 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1767  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  26.48 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.670459  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  38.73 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  30.2 
 
 		 732 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2894  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  32.75 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.804468  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2150  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  50.82 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4000  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.88 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000175217  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12100  cobalamin biosynthesis protein cobG  27.93 
 
 		 363 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00940846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  29.8 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1626  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  34.51 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.470677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2489  precorrin-3B synthase  28.61 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2534  precorrin-3B synthase  28.61 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.35067  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2526  precorrin-3B synthase  28.61 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2192  precorrin-3B synthase  27.43 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1519  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  33.52 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  34 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1783  hypothetical protein  37.19 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  34.92 
 
 		 599 aa  57.4  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17650  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  34.06 
 
 		 292 aa  57  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220438  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  34.39 
 
 		 510 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2520  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.77 
 
 		 435 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000248775  normal  0.264719 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  27.07 
 
 		 486 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  33.1 
 
 		 482 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  29.17 
 
 		 507 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  27.2 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  42.11 
 
 		 516 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  24.59 
 
 		 586 aa  54.3  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2527  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  23.67 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0879547  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  21.76 
 
 		 516 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  26.83 
 
 		 456 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  30.83 
 
 		 564 aa  49.7  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  31.39 
 
 		 608 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  23.02 
 
 		 521 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  23.69 
 
 		 512 aa  47.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0576  precorrin-3B synthase  36.57 
 
 		 389 aa  47  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.244524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  30.86 
 
 		 479 aa  47  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0271  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.54 
 
 		 426 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2201  sulfite reductase subunit beta  28.45 
 
 		 573 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0256  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.83 
 
 		 426 aa  46.6  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000133948 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  26.09 
 
 		 536 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0880  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  21.52 
 
 		 445 aa  46.6  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.612323 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  25.68 
 
 		 615 aa  46.2  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  26.81 
 
 		 510 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  24.82 
 
 		 513 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  24.82 
 
 		 513 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  41.03 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  26.81 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  41.03 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  41.03 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  41.03 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5484  sulfite reductase subunit beta  34.72 
 
 		 602 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  28.67 
 
 		 590 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  23.38 
 
 		 560 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  41.03 
 
 		 482 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.57 
 
 		 550 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  41.03 
 
 		 482 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  24.56 
 
 		 586 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  41.03 
 
 		 482 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0679  sulfite reductase ferredoxin  24.43 
 
 		 602 aa  44.3  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  24.67 
 
 		 639 aa  43.9  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4432  ferredoxin--nitrite reductase  33.9 
 
 		 607 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  25.38 
 
 		 480 aa  43.9  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>