More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0880 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0880  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  100 
 
 
445 aa  910    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.612323 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0290  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  39.14 
 
 
478 aa  315  9.999999999999999e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0679  sulfite reductase ferredoxin  25.06 
 
 
602 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  28.06 
 
 
540 aa  112  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  26.11 
 
 
551 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  27.49 
 
 
542 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  26 
 
 
553 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  27.15 
 
 
541 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  27.05 
 
 
540 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.33 
 
 
757 aa  110  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  26.51 
 
 
567 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  27.05 
 
 
540 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  26.63 
 
 
540 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  26.57 
 
 
540 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  26.57 
 
 
540 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  26.57 
 
 
540 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  26.57 
 
 
540 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  26 
 
 
560 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  26.39 
 
 
540 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  26.81 
 
 
540 aa  106  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.11 
 
 
556 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  26.33 
 
 
540 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1146  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.97 
 
 
697 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.59 
 
 
550 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  23.98 
 
 
521 aa  99.8  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.76 
 
 
562 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.54 
 
 
569 aa  98.2  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2520  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.65 
 
 
435 aa  97.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000248775  normal  0.264719 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3092  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.62 
 
 
697 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000117991  hitchhiker  0.00929399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.29 
 
 
569 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2637  sulfite reductase (NADPH)  24.62 
 
 
713 aa  93.6  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  25.53 
 
 
639 aa  93.6  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.19 
 
 
590 aa  93.2  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2148  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  23.87 
 
 
557 aa  93.6  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.249832  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  22.12 
 
 
586 aa  93.2  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1101  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  23.48 
 
 
557 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.251663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.12 
 
 
805 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  24.06 
 
 
569 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1264  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  24.04 
 
 
551 aa  91.3  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.657041  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  25 
 
 
586 aa  90.1  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  23.1 
 
 
643 aa  89.7  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6617  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.4 
 
 
704 aa  89.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00459026 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1767  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  25 
 
 
433 aa  89  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.670459  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3267  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  23.58 
 
 
552 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  25.26 
 
 
560 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.93 
 
 
565 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  25.34 
 
 
512 aa  87.4  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4013  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.63 
 
 
550 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  23.59 
 
 
492 aa  87.4  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0512  nitrite/sulfite reductase-like protein  23.23 
 
 
516 aa  86.7  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  25 
 
 
548 aa  86.7  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  23.83 
 
 
569 aa  86.3  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  25.45 
 
 
519 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  25.82 
 
 
621 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  22.49 
 
 
591 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  24.47 
 
 
648 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2527  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  24.41 
 
 
433 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0879547  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.15 
 
 
556 aa  83.6  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1504  sulfite reductase (ferredoxin)  20.53 
 
 
696 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361579  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2618  Sulfite reductase (ferredoxin)  30.89 
 
 
742 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2345  sulfite reductase (ferredoxin)  23.43 
 
 
553 aa  82.4  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0166972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2051  Sulfite reductase (ferredoxin)  30.65 
 
 
720 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.773496 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  21.45 
 
 
592 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4058  sulfite reductase (ferredoxin)  23.76 
 
 
544 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.639199  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  25.51 
 
 
510 aa  81.3  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.13 
 
 
793 aa  80.9  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  24 
 
 
573 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0889  sulfite reductase (ferredoxin)  24.09 
 
 
552 aa  80.9  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0812727 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1931  ferredoxin--nitrite reductase  22.47 
 
 
556 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3156  sulfite reductase (ferredoxin)  23.24 
 
 
552 aa  80.1  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240199  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3346  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  26 
 
 
605 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4432  ferredoxin--nitrite reductase  26.59 
 
 
607 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  24.54 
 
 
581 aa  79.7  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4000  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.72 
 
 
435 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000175217  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3268  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26 
 
 
606 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446029  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  23.76 
 
 
516 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3274  sulfite reductase (ferredoxin)  23.08 
 
 
669 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  22.38 
 
 
573 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3155  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  26.4 
 
 
606 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.126961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0256  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.25 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000133948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.78 
 
 
570 aa  77.4  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  22.48 
 
 
569 aa  77.4  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1397  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  22.9 
 
 
551 aa  76.6  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0338  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  24.55 
 
 
556 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0988225  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  25.23 
 
 
513 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  25.23 
 
 
513 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.18 
 
 
591 aa  76.3  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.27 
 
 
592 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0271  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.38 
 
 
426 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  22.3 
 
 
570 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  22.09 
 
 
560 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0526  nitrite/sulfite reductase-like protein  22.49 
 
 
516 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.574671  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  22.09 
 
 
560 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  22.09 
 
 
560 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.56 
 
 
581 aa  73.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5531  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.34 
 
 
609 aa  73.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1942  sulfite/nitrite reductase hemoprotein subunit  23.63 
 
 
556 aa  73.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0181  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  22.62 
 
 
556 aa  72.4  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.75 
 
 
567 aa  72.8  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0190  sulfite reductase (ferredoxin)  22.92 
 
 
556 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>