More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0290 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0290  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  100 
 
 
478 aa  978    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0880  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  39.14 
 
 
445 aa  315  9.999999999999999e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.612323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  26.58 
 
 
567 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  24.82 
 
 
542 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0679  sulfite reductase ferredoxin  23.54 
 
 
602 aa  104  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1146  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.08 
 
 
697 aa  104  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  26.23 
 
 
492 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2051  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.51 
 
 
720 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.773496 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  23.91 
 
 
541 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  23.7 
 
 
540 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.69 
 
 
805 aa  99.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  23.28 
 
 
540 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.98 
 
 
550 aa  97.8  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  23.48 
 
 
540 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.21 
 
 
757 aa  97.1  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.42 
 
 
793 aa  96.3  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.37 
 
 
556 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  24.3 
 
 
540 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  24.13 
 
 
551 aa  95.5  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  23.26 
 
 
540 aa  95.1  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  23.26 
 
 
540 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  23.33 
 
 
540 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4432  ferredoxin--nitrite reductase  22.48 
 
 
607 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.08 
 
 
562 aa  94  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  23.26 
 
 
540 aa  93.6  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  23.26 
 
 
540 aa  93.6  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  23.26 
 
 
540 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2618  Sulfite reductase (ferredoxin)  22.22 
 
 
742 aa  93.6  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  23.26 
 
 
540 aa  91.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  23.13 
 
 
560 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  24.49 
 
 
639 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2637  sulfite reductase (NADPH)  23.76 
 
 
713 aa  89  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  25.13 
 
 
510 aa  87.4  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.74 
 
 
592 aa  87  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  25.37 
 
 
599 aa  87.4  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  26.91 
 
 
536 aa  87  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3092  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.96 
 
 
697 aa  87  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000117991  hitchhiker  0.00929399 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  24.75 
 
 
586 aa  86.7  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1504  sulfite reductase (ferredoxin)  24.56 
 
 
696 aa  86.7  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  24.23 
 
 
586 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  23.31 
 
 
586 aa  85.1  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.53 
 
 
603 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1767  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  21.82 
 
 
433 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.670459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0256  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.43 
 
 
426 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000133948 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2527  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  23.21 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0879547  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  22.25 
 
 
519 aa  84.3  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  22.94 
 
 
516 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  22.58 
 
 
553 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  24.11 
 
 
513 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  23.12 
 
 
521 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  22.41 
 
 
521 aa  81.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  24.11 
 
 
513 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.88 
 
 
590 aa  81.3  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6617  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.32 
 
 
704 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00459026 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0271  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.62 
 
 
426 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.32 
 
 
565 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4000  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.9 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000175217  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6980  sulfite/ferredoxin-nitrite reductase  22.87 
 
 
551 aa  80.5  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2520  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.39 
 
 
435 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000248775  normal  0.264719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4013  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.98 
 
 
550 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  23.68 
 
 
542 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  23.57 
 
 
591 aa  78.6  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1264  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  23.36 
 
 
551 aa  77.4  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.657041  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.52 
 
 
569 aa  77  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  24.34 
 
 
569 aa  76.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1153  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  22.74 
 
 
555 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  22.36 
 
 
564 aa  76.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.78 
 
 
569 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.38 
 
 
570 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1258  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  26.94 
 
 
879 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.993726  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  22.7 
 
 
569 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1305  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  27.11 
 
 
885 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462286 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3156  sulfite reductase (ferredoxin)  21.65 
 
 
552 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240199  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  23.34 
 
 
648 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  21.5 
 
 
573 aa  75.1  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1397  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  22.72 
 
 
551 aa  74.3  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2201  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  27.27 
 
 
870 aa  74.7  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.026547  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  23.44 
 
 
621 aa  74.3  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  22.28 
 
 
633 aa  74.3  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  22.4 
 
 
513 aa  73.9  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  20.78 
 
 
548 aa  73.6  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0434  sulfite/nitrite reductase, putative  28.86 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3507  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  27.23 
 
 
857 aa  73.2  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.917816  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  21.93 
 
 
643 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4694  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  22.75 
 
 
551 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2816  sulfite reductase (NADPH) subunit beta  22.42 
 
 
560 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2730  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  27.62 
 
 
1396 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  23.36 
 
 
569 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1638  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  23.23 
 
 
556 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123155  normal  0.260957 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  22.65 
 
 
513 aa  72.4  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.03 
 
 
589 aa  72  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2906  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  27.35 
 
 
1381 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1482  nitrite and sulphite reductase, 4Fe-4S subunit  25.39 
 
 
219 aa  72  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1825  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.44 
 
 
556 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.291186  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  22.81 
 
 
573 aa  71.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1544  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  27.14 
 
 
1396 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.673057  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  23.94 
 
 
560 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.4 
 
 
568 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1381  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  23.06 
 
 
551 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.244986  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  23.94 
 
 
560 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>