More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3143 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 465 aa  928    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  54.69 
 
 		 510 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  53.48 
 
 		 507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  47.44 
 
 		 476 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  48.65 
 
 		 447 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  48.66 
 
 		 483 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  48.57 
 
 		 438 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  49.44 
 
 		 456 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  48.64 
 
 		 443 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  46.27 
 
 		 432 aa  319  7e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  47.86 
 
 		 479 aa  311  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  50.11 
 
 		 486 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  46.14 
 
 		 443 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  48.79 
 
 		 478 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  48.09 
 
 		 482 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  47.76 
 
 		 454 aa  300  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  48.52 
 
 		 482 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  48.31 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  48.31 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  48.31 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  48.31 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  47.69 
 
 		 463 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  48.18 
 
 		 469 aa  296  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  48.31 
 
 		 482 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  46.83 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  47.28 
 
 		 482 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  40.94 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  47.93 
 
 		 482 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  47.93 
 
 		 516 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  40 
 
 		 431 aa  266  5e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  39.08 
 
 		 409 aa  251  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  29.39 
 
 		 732 aa  177  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  30.7 
 
 		 494 aa  174  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  32.1 
 
 		 615 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  28.63 
 
 		 595 aa  143  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  29.71 
 
 		 586 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  26.29 
 
 		 487 aa  137  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  28.19 
 
 		 595 aa  136  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  27.85 
 
 		 604 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  27.4 
 
 		 605 aa  131  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  28.12 
 
 		 590 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  26.8 
 
 		 599 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  28.88 
 
 		 608 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  25.91 
 
 		 596 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  26.57 
 
 		 596 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  27.74 
 
 		 590 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  26.57 
 
 		 601 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  26.44 
 
 		 586 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  29.69 
 
 		 387 aa  114  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  29.87 
 
 		 423 aa  111  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  28.96 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  31.06 
 
 		 424 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  29.72 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  25 
 
 		 510 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  26.98 
 
 		 569 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  25.55 
 
 		 439 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.45 
 
 		 592 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  23.44 
 
 		 516 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  27.38 
 
 		 567 aa  103  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  29.95 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  25.75 
 
 		 569 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  32.06 
 
 		 372 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.22 
 
 		 569 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  28.33 
 
 		 512 aa  99  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.52 
 
 		 570 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  23.85 
 
 		 536 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  26.33 
 
 		 571 aa  97.4  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.83 
 
 		 568 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.32 
 
 		 556 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  30.43 
 
 		 372 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  29.45 
 
 		 464 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  26.22 
 
 		 586 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  31.79 
 
 		 473 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  25.89 
 
 		 513 aa  92  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  22.06 
 
 		 519 aa  91.3  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  24.94 
 
 		 648 aa  90.1  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  23.68 
 
 		 513 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  25.77 
 
 		 569 aa  89.7  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  23.68 
 
 		 513 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  26.1 
 
 		 633 aa  89.7  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  25.49 
 
 		 560 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  25 
 
 		 521 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.7 
 
 		 567 aa  89.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  25 
 
 		 621 aa  89.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  21.91 
 
 		 540 aa  89  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1504  sulfite reductase (ferredoxin)  23.33 
 
 		 696 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361579  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.94 
 
 		 562 aa  87  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  26.27 
 
 		 460 aa  86.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  23.98 
 
 		 542 aa  86.7  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  25 
 
 		 581 aa  86.3  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  22.98 
 
 		 553 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.73 
 
 		 581 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2051  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.84 
 
 		 720 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.773496 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  21.08 
 
 		 480 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  21.46 
 
 		 540 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  22.98 
 
 		 553 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  28.4 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  21.46 
 
 		 540 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  21.21 
 
 		 540 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  25.36 
 
 		 586 aa  83.2  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>