269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0801 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 464 aa  897    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  35.7 
 
 		 430 aa  188  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  35.79 
 
 		 424 aa  163  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  37.94 
 
 		 423 aa  162  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  34.55 
 
 		 380 aa  139  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  33.99 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  31.18 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  35.7 
 
 		 449 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  33.58 
 
 		 386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  33.26 
 
 		 428 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  30.37 
 
 		 431 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  32.63 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  29.67 
 
 		 439 aa  123  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  33.59 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  30.85 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  26.62 
 
 		 732 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0341  precorrin-3B synthase  33.59 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  30.9 
 
 		 460 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  31.33 
 
 		 476 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  34.51 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6019  precorrin-3B synthase  31.91 
 
 		 452 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0172666  normal  0.33411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.24 
 
 		 432 aa  117  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  32.92 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  30.31 
 
 		 409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1435  precorrin-3B synthase  34.64 
 
 		 437 aa  114  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.592884  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  31.18 
 
 		 447 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  32.43 
 
 		 438 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  31.57 
 
 		 443 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  25.84 
 
 		 494 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  32.83 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  32.76 
 
 		 443 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  25.12 
 
 		 487 aa  106  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3285  precorrin-3B synthase  30.92 
 
 		 438 aa  106  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  29.14 
 
 		 608 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  27.88 
 
 		 586 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  31.67 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  29.7 
 
 		 599 aa  97.8  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  31.53 
 
 		 456 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  26.11 
 
 		 595 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  32.9 
 
 		 408 aa  94.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  28.51 
 
 		 507 aa  94  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  27.88 
 
 		 590 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  25.06 
 
 		 605 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  27.84 
 
 		 595 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  24.29 
 
 		 586 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12100  cobalamin biosynthesis protein cobG  30.89 
 
 		 363 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00940846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  32.87 
 
 		 473 aa  90.1  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2489  precorrin-3B synthase  31.83 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2534  precorrin-3B synthase  31.83 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.35067  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2526  precorrin-3B synthase  31.83 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  25.55 
 
 		 596 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  25.06 
 
 		 601 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  32.71 
 
 		 479 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2494  nitrite/sulfite reductase hemoprotein subnit beta ferrodoxin domain-containing protein  32.56 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  25.55 
 
 		 596 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  29.45 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  43.14 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  29.59 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2439  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  40.82 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341511  normal  0.0829631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1783  hypothetical protein  31.33 
 
 		 345 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  25.54 
 
 		 590 aa  82.4  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  32.18 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  38.79 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  36.59 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  24.62 
 
 		 513 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  25.5 
 
 		 604 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  21.81 
 
 		 519 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  21.08 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  25.98 
 
 		 569 aa  77.4  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  25.32 
 
 		 513 aa  77.4  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  32.18 
 
 		 482 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  22.42 
 
 		 553 aa  76.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  31.94 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  31.94 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3268  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  35.48 
 
 		 606 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446029  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  31.94 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  25.69 
 
 		 542 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  31.94 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  31.94 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3346  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  35.5 
 
 		 605 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3155  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  37.4 
 
 		 606 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.126961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4432  ferredoxin--nitrite reductase  39.84 
 
 		 607 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  22.37 
 
 		 553 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3604  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  36.13 
 
 		 614 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387306  normal  0.13043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.02 
 
 		 581 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  23.68 
 
 		 541 aa  73.6  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  24.11 
 
 		 615 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  25.71 
 
 		 581 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  22.49 
 
 		 540 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  27.47 
 
 		 648 aa  70.5  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  24.63 
 
 		 521 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  25 
 
 		 567 aa  69.7  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.08 
 
 		 570 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2527  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  28.42 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0879547  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  25.32 
 
 		 560 aa  68.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.94 
 
 		 568 aa  67.4  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  23.85 
 
 		 512 aa  67  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  30.25 
 
 		 567 aa  67  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  37.2 
 
 		 482 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  24.86 
 
 		 516 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>