172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7174 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_6019  precorrin-3B synthase  79.35 
 
 		 452 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0172666  normal  0.33411 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 460 aa  897    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  46.38 
 
 		 443 aa  323  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3285  precorrin-3B synthase  40.5 
 
 		 438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  38.76 
 
 		 428 aa  169  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1435  precorrin-3B synthase  36.32 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.592884  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  37.59 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  36.66 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  33.67 
 
 		 424 aa  147  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  31 
 
 		 430 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2439  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  36.84 
 
 		 423 aa  126  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341511  normal  0.0829631 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  30.9 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  31.83 
 
 		 380 aa  123  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0341  precorrin-3B synthase  32.99 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  29.17 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  28.95 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  33.5 
 
 		 386 aa  109  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  24.09 
 
 		 732 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  24.43 
 
 		 494 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  28.49 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  26.22 
 
 		 586 aa  98.6  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2150  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  43.79 
 
 		 478 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  27.94 
 
 		 469 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  26.85 
 
 		 454 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  28.7 
 
 		 434 aa  89.7  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  26.04 
 
 		 465 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  28.73 
 
 		 482 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  28.73 
 
 		 516 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  27.32 
 
 		 476 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  24.79 
 
 		 560 aa  87.8  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  28.04 
 
 		 478 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.74 
 
 		 562 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.8 
 
 		 556 aa  86.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  28.64 
 
 		 443 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  31.09 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  23.96 
 
 		 507 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  27.43 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  27.33 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  24.17 
 
 		 595 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.09 
 
 		 592 aa  84  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  24.42 
 
 		 571 aa  83.6  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  26.02 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  27.43 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  25.47 
 
 		 608 aa  81.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  27.43 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  24.77 
 
 		 595 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  25.12 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  29.04 
 
 		 479 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.94 
 
 		 581 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  24.71 
 
 		 581 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.25 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.18 
 
 		 567 aa  79  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  26.51 
 
 		 599 aa  79  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  20.7 
 
 		 541 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  28.47 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  23.34 
 
 		 553 aa  77  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  23.19 
 
 		 615 aa  76.6  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  22.58 
 
 		 553 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.7 
 
 		 550 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  22.66 
 
 		 564 aa  74.7  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  22.95 
 
 		 596 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  24.34 
 
 		 569 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  24.29 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  22.26 
 
 		 563 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  23.33 
 
 		 513 aa  73.2  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  22.96 
 
 		 560 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  23.32 
 
 		 605 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  23.48 
 
 		 586 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  21.62 
 
 		 536 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  24.49 
 
 		 586 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.38 
 
 		 570 aa  70.9  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  21.74 
 
 		 516 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  22.76 
 
 		 596 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.17 
 
 		 565 aa  70.5  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  27.31 
 
 		 569 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  20.27 
 
 		 519 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  23.23 
 
 		 513 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  25.44 
 
 		 542 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  21.64 
 
 		 560 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  23.23 
 
 		 513 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  22.76 
 
 		 601 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  21.46 
 
 		 567 aa  67  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  24.1 
 
 		 521 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  29.37 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  19.49 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  20.86 
 
 		 560 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  24.05 
 
 		 604 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.62 
 
 		 568 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  28.28 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  20.8 
 
 		 542 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  19.28 
 
 		 540 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  37.76 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  23.98 
 
 		 512 aa  63.9  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  23.79 
 
 		 573 aa  63.9  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  19.28 
 
 		 540 aa  63.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  19.28 
 
 		 540 aa  63.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  21.52 
 
 		 560 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  21.52 
 
 		 560 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  27.78 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.72 
 
 		 569 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>