221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2439 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2439  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  100 
 
 		 423 aa  780    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341511  normal  0.0829631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2150  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  61.17 
 
 		 478 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  50.48 
 
 		 428 aa  275  9e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  50 
 
 		 428 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1435  precorrin-3B synthase  49.17 
 
 		 437 aa  260  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.592884  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  49.04 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  35.19 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  36.34 
 
 		 443 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  36.66 
 
 		 386 aa  142  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  35.4 
 
 		 424 aa  139  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  36.77 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  36.26 
 
 		 464 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6019  precorrin-3B synthase  36.84 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0172666  normal  0.33411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0341  precorrin-3B synthase  36.91 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3285  precorrin-3B synthase  35.84 
 
 		 438 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  33.09 
 
 		 434 aa  116  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  32.06 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  31.9 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  47.62 
 
 		 423 aa  106  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.37 
 
 		 432 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  32.05 
 
 		 476 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1767  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  31.09 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.670459  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  31.05 
 
 		 447 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  28.27 
 
 		 569 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  29.06 
 
 		 569 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  30.32 
 
 		 510 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  33.09 
 
 		 438 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  30.37 
 
 		 443 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  33.33 
 
 		 443 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  27.63 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  32.69 
 
 		 443 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  32.55 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  28.25 
 
 		 560 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  26.96 
 
 		 560 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  27.82 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.59 
 
 		 570 aa  83.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  28.19 
 
 		 568 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  27.32 
 
 		 571 aa  82  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  36.81 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  29.38 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.14 
 
 		 562 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  34.38 
 
 		 473 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.85 
 
 		 569 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  32.87 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  30.79 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12100  cobalamin biosynthesis protein cobG  30.5 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00940846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  26.9 
 
 		 563 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2192  precorrin-3B synthase  32.96 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  25.53 
 
 		 521 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2494  nitrite/sulfite reductase hemoprotein subnit beta ferrodoxin domain-containing protein  31.83 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.38 
 
 		 590 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  29.92 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  24.55 
 
 		 513 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.12 
 
 		 805 aa  74.7  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  26.16 
 
 		 567 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  27.25 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  32.41 
 
 		 732 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  25.18 
 
 		 560 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  25.18 
 
 		 560 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  25.12 
 
 		 560 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  36.91 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  26.7 
 
 		 581 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  25.35 
 
 		 560 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  37.69 
 
 		 507 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  35.37 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.07 
 
 		 591 aa  72.8  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  24.37 
 
 		 560 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1783  hypothetical protein  31.78 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.08 
 
 		 565 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  26.62 
 
 		 608 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  39.86 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  25.23 
 
 		 542 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.7 
 
 		 581 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.7 
 
 		 573 aa  70.1  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  24.94 
 
 		 586 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  25.95 
 
 		 564 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0256  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.57 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000133948 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  37.5 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  31.43 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.3 
 
 		 793 aa  67.4  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  27.48 
 
 		 521 aa  67  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.09 
 
 		 567 aa  66.6  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  35.14 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  29.2 
 
 		 494 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2695  sulfite reductase subunit beta  26.27 
 
 		 575 aa  65.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0702337  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  24.77 
 
 		 513 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  23.36 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2520  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.7 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000248775  normal  0.264719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  25.43 
 
 		 604 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0271  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.21 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  21.75 
 
 		 536 aa  63.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.3 
 
 		 592 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  25.64 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  25.47 
 
 		 590 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  23.52 
 
 		 492 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  25.12 
 
 		 569 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  28.37 
 
 		 605 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  22.76 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  25.24 
 
 		 573 aa  61.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  31.61 
 
 		 599 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>