204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3116 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  100 
 
 
449 aa  847    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  56.78 
 
 
428 aa  364  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  56.31 
 
 
428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1435  precorrin-3B synthase  52.53 
 
 
437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.592884  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2439  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  48.8 
 
 
423 aa  236  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341511  normal  0.0829631 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  36.08 
 
 
430 aa  169  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  37.53 
 
 
424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2150  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  67.41 
 
 
478 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  37.78 
 
 
423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  37.12 
 
 
460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  34.39 
 
 
380 aa  133  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3285  precorrin-3B synthase  36.34 
 
 
438 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  33.33 
 
 
386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  34.69 
 
 
464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  33.33 
 
 
434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  25.51 
 
 
732 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6019  precorrin-3B synthase  35.9 
 
 
452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0172666  normal  0.33411 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  34.47 
 
 
443 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  27.64 
 
 
494 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  29.15 
 
 
439 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  25.17 
 
 
487 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  30.48 
 
 
431 aa  103  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.12 
 
 
432 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  32.9 
 
 
483 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  33.33 
 
 
438 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  33.57 
 
 
476 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  33.08 
 
 
443 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  32.55 
 
 
443 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  30.1 
 
 
409 aa  92  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  29.24 
 
 
586 aa  90.5  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  32.69 
 
 
443 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  30.34 
 
 
447 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  34.12 
 
 
516 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  34.12 
 
 
482 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  28.33 
 
 
639 aa  83.2  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  28.31 
 
 
595 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  31.61 
 
 
469 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  27.89 
 
 
560 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  23.39 
 
 
480 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  27.48 
 
 
595 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.03 
 
 
592 aa  80.9  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  24.15 
 
 
513 aa  80.5  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  30.48 
 
 
486 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  33.18 
 
 
482 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29 
 
 
562 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  29.57 
 
 
456 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  28.37 
 
 
568 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  46.39 
 
 
387 aa  79  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.76 
 
 
569 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  23.74 
 
 
521 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  22.55 
 
 
513 aa  76.6  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  32.05 
 
 
479 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.11 
 
 
550 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  26.61 
 
 
605 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  23.78 
 
 
516 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  26.39 
 
 
604 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  22.91 
 
 
513 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  22.91 
 
 
513 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  26.84 
 
 
560 aa  74.7  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  26.98 
 
 
596 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  23.83 
 
 
542 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  27.48 
 
 
567 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  26.81 
 
 
590 aa  73.9  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  26.83 
 
 
569 aa  73.6  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  26.84 
 
 
586 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  26.11 
 
 
615 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.34 
 
 
565 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  20 
 
 
553 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  26.14 
 
 
551 aa  72.4  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.41 
 
 
570 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  26.73 
 
 
586 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  33.62 
 
 
473 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  27.97 
 
 
599 aa  71.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0341  precorrin-3B synthase  56.92 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  23.63 
 
 
542 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  23.74 
 
 
519 aa  71.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  26.11 
 
 
648 aa  70.5  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  27.01 
 
 
569 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  24.58 
 
 
512 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  22.67 
 
 
510 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  20 
 
 
553 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  26.65 
 
 
571 aa  68.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  26.19 
 
 
521 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  24.88 
 
 
560 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  27.32 
 
 
590 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  24.7 
 
 
492 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  25.68 
 
 
596 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  25.11 
 
 
553 aa  67  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  25.06 
 
 
439 aa  67  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  23.43 
 
 
541 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  24.65 
 
 
560 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  24.65 
 
 
560 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.63 
 
 
805 aa  66.6  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  24.12 
 
 
560 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.99 
 
 
591 aa  66.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  26.34 
 
 
601 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  23.67 
 
 
560 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1519  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  30.14 
 
 
481 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825166  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26 
 
 
556 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  24.41 
 
 
540 aa  63.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>