266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1674 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  95.64 
 
 		 482 aa  763    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  85.05 
 
 		 478 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  99.79 
 
 		 482 aa  922    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 516 aa  988    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  75 
 
 		 483 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  81.74 
 
 		 463 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  81.82 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  59.37 
 
 		 479 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  57.76 
 
 		 482 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  57.76 
 
 		 482 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  58.19 
 
 		 482 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  57.97 
 
 		 482 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  57.97 
 
 		 482 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  57.97 
 
 		 482 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  57.97 
 
 		 482 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  49.68 
 
 		 507 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  47.42 
 
 		 510 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  49.27 
 
 		 476 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  49.78 
 
 		 447 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  47.87 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  47.62 
 
 		 443 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  46.94 
 
 		 469 aa  307  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  47.93 
 
 		 465 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  49.67 
 
 		 456 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  46.22 
 
 		 443 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  46.5 
 
 		 438 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  48.67 
 
 		 486 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  45.77 
 
 		 443 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  39.21 
 
 		 431 aa  233  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  38.46 
 
 		 439 aa  223  8e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  38.29 
 
 		 409 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  30.61 
 
 		 732 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  30.32 
 
 		 494 aa  181  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  30.31 
 
 		 586 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  31.28 
 
 		 590 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  32.71 
 
 		 599 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  32.35 
 
 		 595 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  32.6 
 
 		 595 aa  146  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  30.52 
 
 		 586 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  29.98 
 
 		 604 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  27.98 
 
 		 615 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  28.82 
 
 		 590 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  29.23 
 
 		 608 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  30.41 
 
 		 601 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  30.17 
 
 		 596 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  29.93 
 
 		 596 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  30.05 
 
 		 605 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  33.89 
 
 		 424 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  25.29 
 
 		 487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  28.54 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  30.82 
 
 		 430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  27.68 
 
 		 510 aa  117  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  33.17 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  33.58 
 
 		 428 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  25.85 
 
 		 542 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  30.82 
 
 		 464 aa  107  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  27.32 
 
 		 521 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  32.44 
 
 		 473 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  26.83 
 
 		 513 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  26.83 
 
 		 513 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  26.11 
 
 		 516 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1435  precorrin-3B synthase  32.37 
 
 		 437 aa  104  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.592884  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  34.99 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  30.81 
 
 		 372 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  28.39 
 
 		 567 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  29.63 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  29 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  31.18 
 
 		 408 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2494  nitrite/sulfite reductase hemoprotein subnit beta ferrodoxin domain-containing protein  30.66 
 
 		 367 aa  100  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  31.14 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  26.79 
 
 		 513 aa  99.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  30.21 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  22.14 
 
 		 480 aa  99.8  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  24.56 
 
 		 513 aa  97.8  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  26.05 
 
 		 492 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  26.25 
 
 		 536 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  28.36 
 
 		 512 aa  96.3  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1783  hypothetical protein  30.38 
 
 		 345 aa  94.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  26.45 
 
 		 521 aa  93.2  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  25.45 
 
 		 551 aa  92.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  24.17 
 
 		 542 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  27.04 
 
 		 560 aa  91.3  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.09 
 
 		 805 aa  91.3  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  25.3 
 
 		 621 aa  90.1  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  25.31 
 
 		 633 aa  89.7  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.34 
 
 		 569 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  26.72 
 
 		 571 aa  88.6  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  22.92 
 
 		 553 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  26.15 
 
 		 586 aa  88.2  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.85 
 
 		 581 aa  87  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  22.36 
 
 		 553 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.75 
 
 		 550 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  25.76 
 
 		 581 aa  85.1  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  25.55 
 
 		 648 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  30 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6019  precorrin-3B synthase  29.23 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0172666  normal  0.33411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  37.91 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  26.8 
 
 		 569 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  21.97 
 
 		 540 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  22.14 
 
 		 540 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>