More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0896 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  100 
 
 		 482 aa  916    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  98.76 
 
 		 482 aa  905    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  99.59 
 
 		 482 aa  912    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  100 
 
 		 482 aa  916    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  88.38 
 
 		 479 aa  680    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  98.96 
 
 		 482 aa  908    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  100 
 
 		 482 aa  916    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 482 aa  916    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  53.74 
 
 		 507 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  60.81 
 
 		 478 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  56.58 
 
 		 483 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  51.38 
 
 		 510 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  57.79 
 
 		 454 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  57.26 
 
 		 482 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  56.85 
 
 		 482 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  58.23 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  56.85 
 
 		 516 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  47.59 
 
 		 476 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  48.73 
 
 		 465 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  46.25 
 
 		 447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  45.36 
 
 		 432 aa  326  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  50.97 
 
 		 486 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  49.89 
 
 		 456 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  46.84 
 
 		 469 aa  312  9e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  46.71 
 
 		 438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  46.68 
 
 		 443 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  45.11 
 
 		 443 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  46.27 
 
 		 443 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  39.3 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  39.05 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  38.19 
 
 		 409 aa  231  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  31.16 
 
 		 494 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  30.51 
 
 		 732 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  31.12 
 
 		 586 aa  176  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  31.81 
 
 		 590 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  31.5 
 
 		 615 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  31.33 
 
 		 604 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  30.18 
 
 		 595 aa  167  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  30.4 
 
 		 595 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  30.7 
 
 		 586 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  26.67 
 
 		 487 aa  161  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  31.09 
 
 		 605 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  30.39 
 
 		 608 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  29.82 
 
 		 590 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  31.25 
 
 		 599 aa  156  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  30.12 
 
 		 596 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  30.6 
 
 		 596 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  30.6 
 
 		 601 aa  154  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  31.75 
 
 		 424 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  29.49 
 
 		 439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  26.28 
 
 		 516 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  24.94 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  24.94 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  32.51 
 
 		 464 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  26.38 
 
 		 521 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  24.83 
 
 		 536 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  26.28 
 
 		 542 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  25.35 
 
 		 510 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  27.44 
 
 		 512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  27.59 
 
 		 567 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12100  cobalamin biosynthesis protein cobG  31.97 
 
 		 363 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00940846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  30.79 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.55 
 
 		 805 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  25.6 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  27.16 
 
 		 633 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  25 
 
 		 551 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  32.06 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  27.18 
 
 		 648 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  25.88 
 
 		 621 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  24.94 
 
 		 513 aa  100  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  29.67 
 
 		 380 aa  98.6  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  21.43 
 
 		 480 aa  98.6  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  26.71 
 
 		 639 aa  98.2  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  21.81 
 
 		 553 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  23.63 
 
 		 540 aa  97.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  25.42 
 
 		 571 aa  96.7  8e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  27.34 
 
 		 521 aa  96.7  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  23.44 
 
 		 540 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  21.76 
 
 		 553 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  23.44 
 
 		 540 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  24.33 
 
 		 540 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.34 
 
 		 793 aa  95.1  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  30.57 
 
 		 423 aa  94.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  23.44 
 
 		 540 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  23.34 
 
 		 540 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  23 
 
 		 540 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.69 
 
 		 567 aa  94.4  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  23.44 
 
 		 540 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  23.51 
 
 		 540 aa  94  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  23.95 
 
 		 560 aa  94  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  23.67 
 
 		 542 aa  93.2  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  25.49 
 
 		 569 aa  92.8  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  22.5 
 
 		 540 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  23.82 
 
 		 540 aa  92.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  26.75 
 
 		 569 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1504  sulfite reductase (ferredoxin)  22.65 
 
 		 696 aa  90.1  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361579  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6019  precorrin-3B synthase  29.5 
 
 		 452 aa  90.1  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0172666  normal  0.33411 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  28.05 
 
 		 443 aa  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  28.67 
 
 		 378 aa  89  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.49 
 
 		 556 aa  88.6  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>