150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3106 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 372 aa  716    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  78.76 
 
 		 372 aa  542  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2489  precorrin-3B synthase  68.21 
 
 		 373 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2534  precorrin-3B synthase  68.21 
 
 		 373 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.35067  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2526  precorrin-3B synthase  68.21 
 
 		 373 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12100  cobalamin biosynthesis protein cobG  64.67 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00940846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  47.87 
 
 		 378 aa  282  7.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0576  precorrin-3B synthase  48.26 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.244524  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2192  precorrin-3B synthase  46.17 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  39.37 
 
 		 439 aa  229  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  40.55 
 
 		 473 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1519  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  40.69 
 
 		 481 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2494  nitrite/sulfite reductase hemoprotein subnit beta ferrodoxin domain-containing protein  44.3 
 
 		 367 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  42.67 
 
 		 408 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1783  hypothetical protein  40.55 
 
 		 345 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17650  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  43.55 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220438  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2894  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  40.28 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.804468  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.26 
 
 		 432 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1626  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  41.12 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.470677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  31.81 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  32.92 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  29.7 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  32.9 
 
 		 476 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  32.21 
 
 		 443 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  29.98 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  26 
 
 		 494 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3411  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  40.1 
 
 		 207 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  26 
 
 		 732 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  31.12 
 
 		 483 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  31.84 
 
 		 469 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  31.18 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  31.98 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  24.88 
 
 		 487 aa  94.4  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  31.75 
 
 		 447 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  28.23 
 
 		 431 aa  90.9  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  30.68 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  28.87 
 
 		 507 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  29.22 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  31.23 
 
 		 465 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  30.87 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  27.27 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  28.06 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0341  precorrin-3B synthase  29.22 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  26.84 
 
 		 615 aa  78.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  26.8 
 
 		 608 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  32.35 
 
 		 434 aa  76.3  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  27.53 
 
 		 586 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  41.18 
 
 		 510 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  30.13 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  26.55 
 
 		 590 aa  72.4  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  38.93 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  26.87 
 
 		 586 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  32.74 
 
 		 456 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  24.37 
 
 		 581 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  38.66 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  38.78 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.87 
 
 		 581 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  25.24 
 
 		 604 aa  63.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  26.15 
 
 		 605 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  26.63 
 
 		 595 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  26.61 
 
 		 595 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  25.38 
 
 		 596 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  25.13 
 
 		 596 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  34.04 
 
 		 521 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  25.38 
 
 		 601 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  26.89 
 
 		 590 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  36.09 
 
 		 482 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  37.3 
 
 		 599 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  26.13 
 
 		 569 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  38.1 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  35.34 
 
 		 516 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  38.1 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  38.1 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  38.1 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  31.39 
 
 		 796 aa  57.4  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  38.1 
 
 		 482 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  35.34 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  38.1 
 
 		 482 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  38.1 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  32.59 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.87 
 
 		 568 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  31.13 
 
 		 567 aa  55.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  30.5 
 
 		 512 aa  54.3  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  26.32 
 
 		 443 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2439  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.88 
 
 		 423 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341511  normal  0.0829631 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  44.78 
 
 		 460 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  31.55 
 
 		 486 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  21.67 
 
 		 536 aa  53.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  23.79 
 
 		 513 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  23.79 
 
 		 513 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  26.14 
 
 		 569 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  20.82 
 
 		 621 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  21.64 
 
 		 492 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0679  sulfite reductase ferredoxin  28.36 
 
 		 602 aa  52.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  22.74 
 
 		 643 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2150  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  33.11 
 
 		 478 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  30.03 
 
 		 449 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.06 
 
 		 805 aa  50.4  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  23.87 
 
 		 510 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  21.93 
 
 		 541 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>