More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1568 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  100 
 
 
483 aa  922    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  75.98 
 
 
478 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  74.79 
 
 
482 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  74.79 
 
 
516 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  76.15 
 
 
454 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  75.83 
 
 
482 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  75.97 
 
 
463 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  57.88 
 
 
479 aa  382  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  57.39 
 
 
482 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  48.48 
 
 
507 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  57.82 
 
 
482 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  57.6 
 
 
482 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  57.6 
 
 
482 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  57.6 
 
 
482 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  57.6 
 
 
482 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  57.6 
 
 
482 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  47.69 
 
 
510 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  47.53 
 
 
432 aa  330  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  48.65 
 
 
447 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  49 
 
 
465 aa  318  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  46.98 
 
 
476 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  45.89 
 
 
443 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  49.22 
 
 
456 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  44.97 
 
 
443 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  45.92 
 
 
469 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  45.37 
 
 
438 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  49.44 
 
 
486 aa  279  8e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  44.59 
 
 
443 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  40.09 
 
 
439 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  38.41 
 
 
431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  37.47 
 
 
409 aa  205  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  29.22 
 
 
494 aa  194  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  29.91 
 
 
732 aa  181  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  33.99 
 
 
599 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  31.03 
 
 
586 aa  160  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  29.93 
 
 
615 aa  157  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  29.98 
 
 
596 aa  151  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  29.48 
 
 
596 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  30.64 
 
 
595 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  29.48 
 
 
601 aa  147  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  30.4 
 
 
605 aa  146  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  30.31 
 
 
608 aa  146  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  25.61 
 
 
487 aa  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  30.88 
 
 
595 aa  144  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  29.8 
 
 
586 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  29.8 
 
 
590 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  34.57 
 
 
424 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  28.5 
 
 
604 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  29.43 
 
 
439 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  26.96 
 
 
590 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  31.21 
 
 
430 aa  124  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  27.03 
 
 
510 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  25.49 
 
 
542 aa  118  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  28.02 
 
 
521 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  31.67 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  26.8 
 
 
513 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  26.8 
 
 
513 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  30.3 
 
 
443 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  25.85 
 
 
621 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  28.54 
 
 
512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  33.17 
 
 
372 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  26.35 
 
 
536 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  32.62 
 
 
408 aa  106  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  29.69 
 
 
386 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2494  nitrite/sulfite reductase hemoprotein subnit beta ferrodoxin domain-containing protein  31.64 
 
 
367 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  23.56 
 
 
516 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  31.59 
 
 
372 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  30.26 
 
 
378 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  29.3 
 
 
380 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  26.77 
 
 
633 aa  103  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  33.78 
 
 
449 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  28.78 
 
 
567 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  26.7 
 
 
492 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  25.13 
 
 
513 aa  100  7e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  22.36 
 
 
553 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  32.79 
 
 
473 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  22.11 
 
 
553 aa  97.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  32.13 
 
 
428 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  31.9 
 
 
428 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  21.77 
 
 
480 aa  96.7  9e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  24.11 
 
 
513 aa  95.1  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  25.51 
 
 
521 aa  95.5  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1435  precorrin-3B synthase  30.51 
 
 
437 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.592884  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12100  cobalamin biosynthesis protein cobG  31.49 
 
 
363 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00940846  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  24.81 
 
 
542 aa  93.6  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  21.59 
 
 
519 aa  92.8  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  24.88 
 
 
551 aa  92.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  26 
 
 
569 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  31.82 
 
 
423 aa  90.5  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2192  precorrin-3B synthase  29.76 
 
 
351 aa  90.1  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.51 
 
 
550 aa  88.6  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  26.41 
 
 
571 aa  88.2  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  25.44 
 
 
560 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.61 
 
 
805 aa  86.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  22.58 
 
 
540 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1942  sulfite/nitrite reductase hemoprotein subunit  27.34 
 
 
556 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  26.99 
 
 
569 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.94 
 
 
793 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0593  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  27.57 
 
 
556 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313736  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  26.58 
 
 
586 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0267627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>