More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1899 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 439 aa  896    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  65.06 
 
 		 431 aa  555  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  65.06 
 
 		 409 aa  528  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  44.62 
 
 		 432 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  44.06 
 
 		 438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  43.34 
 
 		 443 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  41.93 
 
 		 476 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  40.94 
 
 		 465 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  40 
 
 		 447 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  41.26 
 
 		 469 aa  257  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  39.53 
 
 		 510 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  41.55 
 
 		 443 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  42.66 
 
 		 443 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  42.27 
 
 		 456 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  43.38 
 
 		 486 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  38.48 
 
 		 507 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  40.31 
 
 		 483 aa  226  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  39.96 
 
 		 479 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  39.47 
 
 		 482 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  39.25 
 
 		 482 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  39.25 
 
 		 482 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  39.25 
 
 		 482 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  39.25 
 
 		 482 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  39.25 
 
 		 482 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  39.25 
 
 		 482 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  39.07 
 
 		 482 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  37.01 
 
 		 482 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  37.01 
 
 		 516 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  37.89 
 
 		 478 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  36.03 
 
 		 454 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  30.11 
 
 		 494 aa  188  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  36.36 
 
 		 463 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  28.27 
 
 		 732 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  32.06 
 
 		 599 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  27.48 
 
 		 590 aa  154  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  27.01 
 
 		 487 aa  153  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  28.26 
 
 		 595 aa  146  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  29 
 
 		 595 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  29.43 
 
 		 590 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  29.6 
 
 		 608 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  27.94 
 
 		 605 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  29.04 
 
 		 615 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  28.35 
 
 		 596 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  28.35 
 
 		 596 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  28.1 
 
 		 601 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  28.86 
 
 		 586 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  27.51 
 
 		 586 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  26.79 
 
 		 604 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  30.86 
 
 		 430 aa  134  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  30.34 
 
 		 424 aa  133  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  27.23 
 
 		 521 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  30.6 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  31.76 
 
 		 492 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  27.97 
 
 		 567 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  30.3 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  28.72 
 
 		 510 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  28.43 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  29.64 
 
 		 408 aa  114  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  29.29 
 
 		 423 aa  113  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  26.7 
 
 		 513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  24.08 
 
 		 519 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  26.7 
 
 		 513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  26.85 
 
 		 542 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  30.2 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  28.61 
 
 		 439 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.25 
 
 		 550 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  27.44 
 
 		 571 aa  109  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  28.27 
 
 		 449 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.6 
 
 		 569 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  26.17 
 
 		 516 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.09 
 
 		 793 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.84 
 
 		 568 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  26.73 
 
 		 536 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  30.36 
 
 		 428 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  29.76 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  25.89 
 
 		 586 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.55 
 
 		 592 aa  104  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  26.36 
 
 		 569 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  26.87 
 
 		 560 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  28.98 
 
 		 512 aa  103  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2494  nitrite/sulfite reductase hemoprotein subnit beta ferrodoxin domain-containing protein  29.02 
 
 		 367 aa  103  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  25.98 
 
 		 560 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.79 
 
 		 562 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  29.69 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  27.53 
 
 		 581 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.79 
 
 		 581 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  28.78 
 
 		 473 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  25.59 
 
 		 521 aa  99  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.26 
 
 		 556 aa  97.8  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  26.25 
 
 		 443 aa  96.7  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  26.86 
 
 		 648 aa  96.7  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  26.84 
 
 		 639 aa  96.7  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  28.53 
 
 		 428 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  24.81 
 
 		 560 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  25.46 
 
 		 569 aa  94.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.61 
 
 		 570 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.19 
 
 		 567 aa  93.6  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  24.74 
 
 		 553 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  24.74 
 
 		 553 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  24.94 
 
 		 621 aa  92.4  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>